BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	3,243,762	T→C	V340A (GTT→GCT)	exuT →	ExuT

Read alignment evidence...
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*	NC_000913	3,243,762	0	T	C	99.4%	549.4 / ‑4.9	179	V340A (GTT→GCT)	exuT	ExuT
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (91/87); total (92/87)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.68e-01

Only 100 of 185 total aligned reads displayed.

CTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTA  >  NC_000913/3243670‑3243851

   gATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTCCCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTc                                                                                        <  1:3166273/93‑1 (MQ=255)

   gATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTc                                                                                        >  1:625631/1‑93 (MQ=255)

     tGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTccc                                                                                      >  1:2646795/1‑93 (MQ=255)

       ccGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGt                                                                                    >  1:2321423/1‑93 (MQ=255)

        cGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTa                                                                                   <  1:4167060/93‑1 (MQ=255)

         gATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTaa                                                                                  >  1:1342628/1‑93 (MQ=255)

          aTGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAg                                                                                 <  2:1102893/93‑1 (MQ=255)

          aTGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAg                                                                                 >  2:3343664/1‑93 (MQ=255)

            gCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGAt                                                                               >  2:55960/1‑93 (MQ=255)

            gCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGAt                                                                               <  1:172090/93‑1 (MQ=255)

             cTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATg                                                                              <  1:1103858/93‑1 (MQ=255)

             cTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATg                                                                              <  1:4001938/93‑1 (MQ=255)

             cTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATg                                                                              >  1:3403683/1‑93 (MQ=255)

              tGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATgg                                                                             <  1:3091932/93‑1 (MQ=255)

               gTTTGCTGATCGCGCTTGTATCCTAGGTCGTTACTTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGt                                                                            <  2:1404555/93‑1 (MQ=255)

               gTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCCTAAGATGGt                                                                            >  2:3587517/1‑93 (MQ=255)

                tttGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTc                                                                           <  1:2269807/93‑1 (MQ=255)

                  tGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGt                                                                         <  2:4442992/93‑1 (MQ=255)

                    cTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTaa                                                                       <  1:3308871/93‑1 (MQ=255)

                      gACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACg                                                                     >  2:3082743/1‑93 (MQ=255)

                       aCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGc                                                                    >  2:3657411/1‑93 (MQ=255)

                       aCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGc                                                                    >  2:939737/1‑93 (MQ=255)

                       aCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGc                                                                    >  1:198879/1‑93 (MQ=255)

                        ccTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCt                                                                   >  2:1995818/1‑93 (MQ=255)

                        ccTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCt                                                                   <  2:193514/93‑1 (MQ=255)

                         cTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTg                                                                  <  2:3513979/93‑1 (MQ=255)

                         cTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTg                                                                  >  1:3465316/1‑93 (MQ=255)

                         cTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTg                                                                  <  1:4005766/93‑1 (MQ=255)

                         cTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTg                                                                  <  1:656810/93‑1 (MQ=255)

                         cTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCATAAGATGGTCGTAACGCTg                                                                  <  2:4562174/93‑1 (MQ=255)

                          tCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTgg                                                                 >  1:2823350/1‑93 (MQ=255)

                          tCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTgg                                                                 <  1:4306389/93‑1 (MQ=255)

                           cGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTggg                                                                <  2:3182867/93‑1 (MQ=255)

                           cGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTCCCAGCGTTGGTTTGGTGTGACCCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTggg                                                                <  2:1664482/93‑1 (MQ=255)

                            ggTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTgggg                                                               >  1:3621578/1‑92 (MQ=255)

                            ggTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGt                                                               <  1:1018807/93‑1 (MQ=255)

                            ggTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGt                                                               <  2:2839588/93‑1 (MQ=255)

                             gTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTggctc                                                              >  1:3579969/1‑90 (MQ=255)

                             gTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTg                                                              >  2:416463/1‑93 (MQ=255)

                              ttGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGc                                                             >  1:2172040/1‑93 (MQ=255)

                                gTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAg                                                           >  1:2395466/1‑93 (MQ=255)

                                gTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAg                                                           >  2:3642806/1‑93 (MQ=255)

                                gTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAg                                                           <  2:72268/93‑1 (MQ=255)

                                 tATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGt                                                          <  2:4314649/93‑1 (MQ=255)

                                 tATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGt                                                          >  1:2329860/1‑93 (MQ=255)

                                 tATCCTCGGTGGTGACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGt                                                          <  2:344824/93‑1 (MQ=255)

                                   tCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGGGCAggac                                                        >  2:538384/1‑90 (MQ=255)

                                    ccTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCt                                                       <  2:1006818/93‑1 (MQ=255)

                                      tCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtga                                                     <  2:2312157/93‑1 (MQ=255)

                                        ggtggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtgatg                                                   <  1:4635871/93‑1 (MQ=255)

                                          tggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTgatgat                                                 <  2:2008307/93‑1 (MQ=255)

                                          gggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTgatgat                                                 <  2:3188239/92‑1 (MQ=255)

                                           ggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGAtt                                                <  2:615074/93‑1 (MQ=255)

                                           ggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGAAGTGCTGATGAtt                                                >  2:2942900/1‑93 (MQ=255)

                                             ttACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTgg                                              >  1:3463257/1‑93 (MQ=255)

                                             ttACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTgg                                              >  1:2777870/1‑93 (MQ=255)

                                               tccTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGcc                                            <  1:4344834/92‑1 (MQ=255)

                                               aCCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGcc                                            >  2:1330620/1‑93 (MQ=255)

                                                 cTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCg                                          <  1:1464100/93‑1 (MQ=255)

                                                 cTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCg                                          >  2:3999706/1‑93 (MQ=255)

                                                 cTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCg                                          <  2:2156275/93‑1 (MQ=255)

                                                    ccgccgCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGt                                       >  1:4436739/1‑93 (MQ=255)

                                                     cgccgcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTa                                      <  2:1763945/93‑1 (MQ=255)

                                                     cgccgcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTa                                      >  1:3838937/1‑93 (MQ=255)

                                                       ccgcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATg                                    >  1:4533131/1‑93 (MQ=255)

                                                        cgcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGa                                   <  1:2947706/93‑1 (MQ=255)

                                                        cgcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGa                                   >  2:1993986/1‑93 (MQ=255)

                                                         gcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGAt                                  <  1:4026640/93‑1 (MQ=255)

                                                           tGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCg                                <  2:1834139/93‑1 (MQ=255)

                                                            gTTCCAGCGTTGGATTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGT‑ACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGGCCGGGCATGATCGGc                              >  2:2322495/1‑93 (MQ=255)

                                                             ttCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCTGc                              >  2:288665/1‑93 (MQ=255)

                                                               ccAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCt                            <  2:1230595/93‑1 (MQ=255)

                                                               ccAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCt                            <  2:559246/93‑1 (MQ=255)

                                                                cAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTg                           >  1:1046465/1‑93 (MQ=255)

                                                                  gCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGtt                         >  2:2466700/1‑93 (MQ=255)

                                                                   cGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTc                        >  2:126921/1‑93 (MQ=255)

                                                                    gTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCa                       <  1:3531491/93‑1 (MQ=255)

                                                                    gTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCa                       <  1:836156/93‑1 (MQ=255)

                                                                    gTTGGTTTGGTGTGAAACTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGGATGATCGGCCTGTTCa                       >  2:867409/1‑93 (MQ=255)

                                                                     ttggtttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCAc                      >  1:4577505/1‑93 (MQ=255)

                                                                     ttggtttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCAc                      >  1:2202125/1‑93 (MQ=255)

                                                                       ggtttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCa                    >  2:2981777/1‑93 (MQ=255)

                                                                         tttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAAc                  >  2:2809223/1‑93 (MQ=255)

                                                                          ttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAAcc                 >  2:4090073/1‑93 (MQ=255)

                                                                          ttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAAcc                 >  1:1062360/1‑93 (MQ=255)

                                                                             gtgtGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGt              >  1:2021087/1‑93 (MQ=255)

                                                                              tgtgATCCTGTTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTCCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGGTCACCAACCCGTa             <  2:1017775/93‑1 (MQ=255)

                                                                              tgtgACCCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTa             <  2:76203/93‑1 (MQ=255)

                                                                              tgtgAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTa             <  2:1248331/93‑1 (MQ=255)

                                                                               gtgAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTAt            <  2:2212096/93‑1 (MQ=255)

                                                                                   aCCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCg        >  1:196248/1‑93 (MQ=255)

                                                                                    ccTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGc       >  1:2891179/1‑93 (MQ=255)

                                                                                      tGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCaa     >  2:377725/1‑93 (MQ=255)

                                                                                      tGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCaa     <  1:1612690/93‑1 (MQ=255)

                                                                                      tGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCaa     >  2:2076234/1‑93 (MQ=255)

                                                                                        aTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAAtt   <  1:3707875/93‑1 (MQ=255)

                                                                                        aTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAAtt   >  1:559030/1‑93 (MQ=255)

                                                                                        aTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAAtt   >  2:2606633/1‑93 (MQ=255)

                                                                                        aTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGACTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAAtt   >  2:4656261/1‑93 (MQ=255)

                                                                                         tCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTa  <  1:878381/93‑1 (MQ=255)

CTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTA  >  NC_000913/3243670‑3243851

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 18 ≤` `ATCG/ATCG` `< 26 ≤` `ATCG/ATCG` `< 33 ≤` `ATCG/ATCG` `< 40 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`