| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 334,726 | C→T | P75S (CCT→TCT) | yahD → | putative transcription factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 334,726 | 0 | C | T | 98.9% | 631.4 / ‑5.1 | 175 | P75S (CCT→TCT) | yahD | putative transcription factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base T (92/81); total (92/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTAACCCGTTTT > NC_000913/334636‑334815 | cttgCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCt < 2:3361917/90‑1 (MQ=255) tGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCtt < 1:2078909/93‑1 (MQ=255) tGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCtt < 2:4286189/93‑1 (MQ=255) gCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCtttt > 2:4625430/1‑93 (MQ=255) gTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTACTTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTaa < 2:525910/93‑1 (MQ=255) gTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTaa > 1:4416991/1‑93 (MQ=255) gTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTaa < 2:2164452/93‑1 (MQ=255) tataTCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTa < 2:2517589/93‑1 (MQ=255) tataTCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTa < 1:2289296/93‑1 (MQ=255) tataTCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTa < 2:281993/93‑1 (MQ=255) atatCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAg > 2:2466593/1‑93 (MQ=255) tatCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGc < 2:1307954/93‑1 (MQ=255) tatCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGc > 1:1127045/1‑93 (MQ=255) atCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCt < 2:1724917/93‑1 (MQ=255) atCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCt > 2:3204395/1‑93 (MQ=255) tCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTg < 1:2621529/93‑1 (MQ=255) tCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTg > 1:1133068/1‑93 (MQ=255) cAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGt < 2:914029/93‑1 (MQ=255) aGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTc < 1:3822648/93‑1 (MQ=255) aGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTc < 1:4258045/93‑1 (MQ=255) aGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTc < 2:3294424/93‑1 (MQ=255) gCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCt > 2:1426644/1‑93 (MQ=255) gCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCt > 1:2912536/1‑93 (MQ=255) aaTATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGa > 2:735877/1‑93 (MQ=255) aaTATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGa > 1:4250437/1‑93 (MQ=255) aaTATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGa > 1:278327/1‑93 (MQ=255) atatGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGaa > 1:3067447/1‑93 (MQ=255) tatGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAAc > 1:1538407/1‑93 (MQ=255) atGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACg > 1:388215/1‑93 (MQ=255) tGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACga > 2:2432932/1‑93 (MQ=255) gCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACgat < 1:3510203/93‑1 (MQ=255) ttGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACgatga > 1:582763/1‑93 (MQ=255) gCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGAtt < 2:227119/93‑1 (MQ=255) gCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGAtt < 2:4506831/93‑1 (MQ=255) gCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGAtt > 1:2539244/1‑93 (MQ=255) gTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTa > 1:1622575/1‑93 (MQ=255) gTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTa < 1:2718894/93‑1 (MQ=255) gTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTa > 1:4046734/1‑93 (MQ=255) ttCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTaa > 2:3930576/1‑93 (MQ=255) ttCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTaa < 2:3107581/93‑1 (MQ=255) ttCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTaa > 1:126810/1‑93 (MQ=255) tCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAAc < 2:2251181/93‑1 (MQ=255) aGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGc < 1:4585806/93‑1 (MQ=255) ggCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGct > 1:3953639/1‑93 (MQ=255) cATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGctac < 2:2649354/93‑1 (MQ=255) aTTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGctact > 2:2365541/1‑93 (MQ=255) ttGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGaa < 2:11055/93‑1 (MQ=255) ttGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGaa > 2:2040436/1‑93 (MQ=255) ttGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGaa > 2:1594382/1‑93 (MQ=255) ttGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGaa > 2:2882899/1‑93 (MQ=255) ttGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGaa > 1:1657726/1‑93 (MQ=255) ttGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGaa < 2:3482539/93‑1 (MQ=255) ttGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGaa > 1:1455444/1‑93 (MQ=255) tGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAat < 2:2718948/93‑1 (MQ=255) tGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAat > 2:2047803/1‑93 (MQ=255) tGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAat < 2:1919877/93‑1 (MQ=255) aTGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAatta < 1:4109754/93‑1 (MQ=255) tGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAattat > 1:2073057/1‑93 (MQ=255) tGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAattat > 1:1744174/1‑93 (MQ=255) ccGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTAttt < 1:2729857/93‑1 (MQ=255) cGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTAtttt < 1:704825/93‑1 (MQ=255) cGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTAtttt < 1:4070230/93‑1 (MQ=255) ggAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTa < 2:1422150/93‑1 (MQ=255) gAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTAc > 2:3586131/1‑93 (MQ=255) gAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTAc < 2:1529238/93‑1 (MQ=255) gCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCg > 1:2246919/1‑93 (MQ=255) gCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCg > 2:563736/1‑93 (MQ=255) gCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGAATTAACGCTACTACGAATTATTTTACCg < 1:3534681/93‑1 (MQ=255) cGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCgg < 1:349603/93‑1 (MQ=255) ggATATTACTAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGc > 2:4549428/1‑93 (MQ=255) ggATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGc > 1:2313471/1‑93 (MQ=255) gATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCt > 1:1671501/1‑93 (MQ=255) atatTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTa < 2:1348635/93‑1 (MQ=255) ataaGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCg > 1:4564125/1‑93 (MQ=255) ataaGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCg > 1:3002477/1‑93 (MQ=255) ataaGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCg > 2:1599022/1‑93 (MQ=255) aGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATc > 2:4114317/1‑93 (MQ=255) aGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATc > 2:2306135/1‑93 (MQ=255) aGCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATc < 2:3073194/93‑1 (MQ=255) gCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCt < 1:3681537/93‑1 (MQ=255) gCAAGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCt > 1:2061416/1‑93 (MQ=255) aaGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTa > 1:2656522/1‑93 (MQ=255) aaGATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTa > 1:2211821/1‑93 (MQ=255) gATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAAt < 1:1952844/93‑1 (MQ=255) gATCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAAt < 1:3127358/93‑1 (MQ=255) aTCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAAtt < 2:767486/93‑1 (MQ=255) aTCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAAtt < 1:342624/93‑1 (MQ=255) tCATACCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTg > 1:3204326/1‑93 (MQ=255) aCCTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTa < 1:1541562/93‑1 (MQ=255) ccTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTaa < 1:2055332/93‑1 (MQ=255) ccTGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTaa < 1:3583789/93‑1 (MQ=255) tGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGCATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTAAcc > 2:1107920/1‑93 (MQ=255) tGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTAAcc > 1:617358/1‑93 (MQ=255) tGTTTAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTAAcc > 2:248904/1‑93 (MQ=255) tttAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTAACCCg < 2:1860248/93‑1 (MQ=255) tttAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTAACCCg > 1:4208945/1‑93 (MQ=255) tttAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTAACCCg > 1:3102178/1‑93 (MQ=255) tttAAATTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTAACCCg > 1:903678/1‑93 (MQ=255) aaaTTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTAACCCGttt < 2:4304764/93‑1 (MQ=255) aaTTCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTAACCCGtttt > 1:1812952/1‑93 (MQ=255) | CTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATCCTTTTTTAATTAGCTGTCTGAACGATGATTTAACGCTACTACGAATTATTTTACCGGCTAAACCCGATCTTAATTGCGTAACCCGTTTT > NC_000913/334636‑334815 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |