| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,418,628 | A→G | A286A (GCA→GCG) | b3269 → | putative transport system permease protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,418,628 | 0 | A | G | 99.1% | 656.1 / ‑3.0 | 213 | A286A (GCA→GCG) | b3269 | putative transport system permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (109/102); total (110/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.47e-01 | |||||||||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
TTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCAGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCG > NC_000913/3418538‑3418717 | tttAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGt > 2:568404/1‑93 (MQ=255) ttAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTg > 2:2173223/1‑93 (MQ=255) ttAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTg < 2:3624530/93‑1 (MQ=255) aTTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCt < 1:44061/93‑1 (MQ=255) aTTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATACGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCt > 2:4070962/1‑93 (MQ=255) ttCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCtt < 2:959725/93‑1 (MQ=255) tCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTa > 1:4280835/1‑93 (MQ=255) tCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTa < 1:4080698/93‑1 (MQ=255) cTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATg > 2:1788033/1‑93 (MQ=255) tGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATgg > 1:3064445/1‑93 (MQ=255) tGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATgg < 2:3199586/93‑1 (MQ=255) aaCTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTc > 2:3753885/1‑93 (MQ=255) aaCTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTc > 1:2351978/1‑93 (MQ=255) cTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCaa > 1:3209198/1‑93 (MQ=255) cTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCaa > 1:4155837/1‑93 (MQ=255) tGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAAc < 1:1010592/93‑1 (MQ=255) ggCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACa < 1:830764/93‑1 (MQ=255) gCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACAt < 2:1669873/93‑1 (MQ=255) gCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACAt < 2:1223523/93‑1 (MQ=255) cAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATg > 2:4147940/1‑93 (MQ=255) aGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGa < 2:2408168/93‑1 (MQ=255) gCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGaa > 2:1958224/1‑93 (MQ=255) gCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGaa > 1:3228748/1‑93 (MQ=255) gCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGaa > 1:3027421/1‑93 (MQ=255) gCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGaa < 1:1585714/93‑1 (MQ=255) cTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGc < 2:351310/93‑1 (MQ=255) cTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGc < 2:4320716/93‑1 (MQ=255) tAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCgg < 2:4413317/93‑1 (MQ=255) cGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTc < 1:3875178/93‑1 (MQ=255) cTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCgg > 2:1185411/1‑93 (MQ=255) cTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCgg > 2:4101677/1‑93 (MQ=255) tGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGt < 1:1356210/93‑1 (MQ=255) ggCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTc > 1:361453/1‑93 (MQ=255) ggCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTc < 2:3246187/93‑1 (MQ=255) ggCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTAGCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTc < 1:2705019/93‑1 (MQ=255) cACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCAc > 1:1283077/1‑93 (MQ=255) cTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTccacg > 2:3999667/1‑89 (MQ=255) cTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTg > 1:1629537/1‑93 (MQ=255) tttCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTgg > 1:2900476/1‑93 (MQ=255) ttCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTggg < 2:4465371/93‑1 (MQ=255) tCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGa > 2:2150445/1‑93 (MQ=255) tCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGa < 1:559142/93‑1 (MQ=255) gTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTa > 1:4609266/1‑93 (MQ=255) gTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTa < 2:798520/93‑1 (MQ=255) ttATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTAcc < 2:1543029/93‑1 (MQ=255) ttATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTAcc < 2:1029442/93‑1 (MQ=255) ataCATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCa < 1:917284/93‑1 (MQ=255) aCATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAAc < 1:1045844/93‑1 (MQ=255) cATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAAcc < 1:1929162/93‑1 (MQ=255) cATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAAcc > 1:1195462/1‑93 (MQ=255) cATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACACAAcc > 2:1469258/1‑93 (MQ=255) aTCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCGAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAAccc < 2:1996361/93‑1 (MQ=255) tCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCg > 2:250094/1‑93 (MQ=255) tCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCg > 2:256200/1‑93 (MQ=255) tCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCg > 1:4040673/1‑93 (MQ=255) cTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCgg < 1:4133062/93‑1 (MQ=255) cTGCATTTATCGCCGAGATCATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCgg < 1:2930865/93‑1 (MQ=255) gCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGtt < 2:3031865/93‑1 (MQ=255) aTTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAATATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtac < 2:1562846/93‑1 (MQ=255) aTTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAAACCGGTtac > 1:1880111/1‑93 (MQ=255) tttATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtacg > 2:1463532/1‑93 (MQ=255) ttATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtacgc > 1:2855476/1‑93 (MQ=255) ttATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGCGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGCCACTGGGATTACCCAACCCGGGtacgc > 1:818045/1‑93 (MQ=255) tATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtacgct > 2:1204568/1‑93 (MQ=255) aTCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtacgcta < 2:1254118/93‑1 (MQ=255) tCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtacgctac < 2:3894802/93‑1 (MQ=255) tCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtacgctac > 1:4673278/1‑93 (MQ=255) tCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtacgctac > 1:1659961/1‑93 (MQ=255) tCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtacgctac < 1:744963/93‑1 (MQ=255) gCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtacgctacgc > 2:2892841/1‑93 (MQ=255) gCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtacgctacgc > 1:3480250/1‑93 (MQ=255) gCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTtacgctacgc < 1:1430007/93‑1 (MQ=255) ccGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGcc < 2:2280272/93‑1 (MQ=255) cGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCa < 1:2907139/93‑1 (MQ=255) cGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCa < 1:2489413/93‑1 (MQ=255) cGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGGTACGCTACGCCa > 2:4041258/1‑93 (MQ=255) cGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGAGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTTACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCa > 1:6414/1‑93 (MQ=255) gagaTTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAg > 2:692129/1‑93 (MQ=255) gagaTTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAg > 2:3549479/1‑93 (MQ=255) gagaTTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAg > 1:2645971/1‑93 (MQ=255) agaTTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAgg < 1:3267727/93‑1 (MQ=255) gaTTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGt > 2:4397661/1‑93 (MQ=255) aTTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTc < 1:2063662/93‑1 (MQ=255) aTTATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTc < 1:1254865/93‑1 (MQ=255) ttATCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCa > 2:2057949/1‑93 (MQ=255) tCCGCGCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCatta < 2:1732965/93‑1 (MQ=255) cgcgCTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCattatt < 1:3800453/93‑1 (MQ=255) gcgcTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTc < 1:4546426/93‑1 (MQ=255) cgcTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGGTACGCTACGCCAGGTCATTATTcc > 2:4560853/1‑93 (MQ=255) gcTGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTccc > 2:2810921/1‑93 (MQ=255) tGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCa > 2:3568421/1‑93 (MQ=255) tGGGATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCa > 2:3150641/1‑93 (MQ=255) tGGGATCCAGGCGGTCCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCa < 1:1480056/93‑1 (MQ=255) gggATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAg > 2:3326038/1‑93 (MQ=255) ggATCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCCGGCCATTATTCCCCAgg > 2:870356/1‑93 (MQ=255) tCCAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCAt > 1:221506/1‑93 (MQ=255) ccAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTCCCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCAtt < 2:4618889/93‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCAtt < 1:4559039/93‑1 (MQ=255) cAGGCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTg > 2:1345296/1‑93 (MQ=255) ggCGGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGGCATTATTCCCCACGCATTTCg > 1:1139297/1‑93 (MQ=255) | TTTAATTCCTGAACTGGCAGCCTTAACGCTGGCACTTTCGGTTTATACATCTGCATTTATCGCCGAGATTATCCGCGCTGGGATCCAGGCAGTGCCTTATGGTCAACATGAAGCGGCTCGGTCACTGGGATTACCCAACCCGGTTACGCTACGCCAGGTCATTATTCCCCAGGCATTGCG > NC_000913/3418538‑3418717 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |