Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,670,614 | C→T | R215C (CGT→TGT) | yhjC → | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,670,614 | 0 | C | T | 99.6% | 923.0 / NA | 258 | R215C (CGT→TGT) | yhjC | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (130/127); total (131/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
CTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTG > NC_000913/3670524‑3670703 | cTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAgtgtgt > 2:4246206/1‑93 (MQ=255) cTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAgtgtgt < 2:3619255/93‑1 (MQ=255) gACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTta < 2:2457176/93‑1 (MQ=255) gACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTta < 1:2046767/93‑1 (MQ=255) aCCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTtat > 2:4453806/1‑93 (MQ=255) aCCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTtat < 1:3221035/93‑1 (MQ=255) ccATGGTCATCTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTtata < 2:2054616/93‑1 (MQ=255) ccATGGTCAGCTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTtata < 2:2410426/93‑1 (MQ=255) ccATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTtata > 2:3878028/1‑93 (MQ=255) aTGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGAGCTTTTGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATaca > 2:2239658/1‑93 (MQ=255) ggTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACAcc < 2:576452/93‑1 (MQ=255) ggTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACAcc < 1:1274229/93‑1 (MQ=255) tCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGc > 1:2203319/1‑93 (MQ=255) cAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCa < 1:4495084/93‑1 (MQ=255) cAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCa < 1:658077/93‑1 (MQ=255) aCTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCAcc > 2:481602/1‑93 (MQ=255) aCTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCAcc < 1:3258676/93‑1 (MQ=255) cTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCt > 2:3997056/1‑93 (MQ=255) gtgCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTgg < 1:3828714/93‑1 (MQ=255) tgCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTggg > 1:1994893/1‑93 (MQ=255) tgCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTggg > 2:4182855/1‑93 (MQ=255) tgCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTggg > 1:4426098/1‑93 (MQ=255) gCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGgt < 1:99267/93‑1 (MQ=255) ccAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGgtg > 2:3277119/1‑93 (MQ=255) ccAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGgtg < 2:3131750/93‑1 (MQ=255) ccAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCAGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGgtg < 1:2685461/93‑1 (MQ=255) aGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTa > 2:143702/1‑93 (MQ=255) gTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTAc < 2:1182614/93‑1 (MQ=255) gTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTAc > 1:419740/1‑93 (MQ=255) tCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACa > 2:2287643/1‑93 (MQ=255) cGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATc < 2:2149544/93‑1 (MQ=255) gCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATcc > 2:121455/1‑93 (MQ=255) gCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATcc > 2:157394/1‑93 (MQ=255) aCTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGt > 2:3749157/1‑93 (MQ=255) aCTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGt > 2:3512988/1‑93 (MQ=255) tATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACAGCGCACCTGGGTGTACATCCGTTa > 1:1492151/1‑93 (MQ=255) tATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTa > 1:1399290/1‑93 (MQ=255) tATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTa > 1:2615750/1‑93 (MQ=255) tATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTa < 2:2943056/93‑1 (MQ=255) aTCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCCCCTGGGTGTACATCCGTTAg < 2:4427955/93‑1 (MQ=255) tCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAgg > 1:3848463/1‑93 (MQ=255) cTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGt < 2:1936009/93‑1 (MQ=255) tGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGtt > 1:1568187/1‑93 (MQ=255) gcgcTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGa < 1:1523867/93‑1 (MQ=255) gcgcTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGa < 1:757159/93‑1 (MQ=255) cgcTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAg < 1:301355/93‑1 (MQ=255) gcTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAgg < 2:857761/93‑1 (MQ=255) gcTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAgg > 1:1123470/1‑93 (MQ=255) cTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGt > 1:3408307/1‑93 (MQ=255) tttGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCTCCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGtt < 1:2266466/93‑1 (MQ=255) tttGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGtt > 1:2783067/1‑93 (MQ=255) ttATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAg < 1:3358326/93‑1 (MQ=255) tCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGt < 2:2718417/93‑1 (MQ=255) tCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGt > 2:4555393/1‑93 (MQ=255) tCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGt < 1:3503030/93‑1 (MQ=255) tCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGt > 1:178156/1‑93 (MQ=255) cGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTa > 1:4394453/1‑93 (MQ=255) gCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTaa > 1:4616769/1‑93 (MQ=255) gCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTaa > 1:802638/1‑93 (MQ=255) cAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAAt < 2:3408456/93‑1 (MQ=255) aaaGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATg > 1:2407276/1‑93 (MQ=255) aaGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATgg > 1:2422174/1‑93 (MQ=255) aGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGc < 2:1808813/93‑1 (MQ=255) cccGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTc > 1:4360465/1‑93 (MQ=255) ccGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTcc > 1:1834143/1‑93 (MQ=255) ccGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTcc > 2:1145220/1‑93 (MQ=255) cGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCa > 1:1341238/1‑93 (MQ=255) cGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCa > 2:4648358/1‑93 (MQ=255) gatgatCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAg > 1:2242792/1‑93 (MQ=255) atgatCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGt > 2:2675985/1‑93 (MQ=255) tgatCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTg > 1:917332/1‑93 (MQ=255) tgatCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTg > 1:1208297/1‑93 (MQ=255) tgatCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTg < 1:4186536/93‑1 (MQ=255) tgatCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTg < 1:1973639/93‑1 (MQ=255) gatCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTgg > 1:2831689/1‑93 (MQ=255) atCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGt < 2:1699173/93‑1 (MQ=255) atCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGt > 2:3567090/1‑93 (MQ=255) tCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGtt > 2:1062381/1‑93 (MQ=255) tCTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGtt > 1:1901572/1‑93 (MQ=255) cTGACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGttt < 1:1075637/93‑1 (MQ=255) gACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTaa > 2:2578898/1‑93 (MQ=255) gACTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTaa < 1:3928393/93‑1 (MQ=255) aCTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAg < 1:2089084/93‑1 (MQ=255) aCTTCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAg < 2:2803284/93‑1 (MQ=255) ttCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTc > 2:4113355/1‑93 (MQ=255) ttCACACGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTc > 1:4253000/1‑93 (MQ=255) acacGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTgg > 2:4045037/1‑93 (MQ=255) acacGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTgg < 2:2990252/93‑1 (MQ=255) cacGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTggc < 1:172401/93‑1 (MQ=255) acGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTggcg > 2:2364347/1‑93 (MQ=255) acGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTggcg > 2:2209246/1‑93 (MQ=255) cGCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTggcgg > 1:4451875/1‑93 (MQ=255) gCAATAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTggcggc > 2:4313504/1‑93 (MQ=255) aaTAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCAt > 2:1259084/1‑93 (MQ=255) aaTAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGATTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCAt > 1:3516821/1‑93 (MQ=255) aTAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATg > 2:367640/1‑93 (MQ=255) aTAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATg < 1:2755193/93‑1 (MQ=255) aTAGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATg > 1:2161223/1‑93 (MQ=255) aGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGtt < 1:2958382/93‑1 (MQ=255) aGTGTGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGtt < 1:4105103/93‑1 (MQ=255) | CTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTG > NC_000913/3670524‑3670703 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |