| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,827,834 | C→T | G421G (GGC→GGT) | yicE → | putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,827,834 | 0 | C | T | 98.3% | 812.3 / NA | 240 | G421G (GGC→GGT) | yicE | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (107/127); minor base G (3/1); total (112/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG > NC_000913/3827744‑3827922 | cgccgcCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgt > 1:2266128/1‑93 (MQ=255)cgccgcCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGACTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgt < 2:3204801/93‑1 (MQ=255) ccgccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgtgt > 2:2753023/1‑93 (MQ=255) cgccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtc < 2:1960179/93‑1 (MQ=255) gccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtct > 2:3464577/1‑93 (MQ=255) gccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtct < 2:3756396/93‑1 (MQ=255) ccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtctc < 1:3539778/93‑1 (MQ=255) cTCGGGTGTGCGTATTGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCTCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTca < 1:755408/93‑1 (MQ=255) cTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTca < 2:3288850/93‑1 (MQ=255) tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcag > 2:18878/1‑93 (MQ=255) tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcag > 1:1890054/1‑93 (MQ=255) tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcag < 1:2815860/93‑1 (MQ=255) ccGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagc > 1:2979996/1‑93 (MQ=255) cGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagca > 2:1716390/1‑93 (MQ=255) gtgtGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCagcagc > 1:660446/1‑93 (MQ=255) tgtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGcc < 2:1342768/93‑1 (MQ=255) gtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGGCg > 1:3936039/1‑93 (MQ=255) gtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCg > 1:3233804/1‑93 (MQ=255) gtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCg > 2:4070466/1‑93 (MQ=255) tgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGc < 1:4460616/93‑1 (MQ=255) tgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGc < 2:3789801/93‑1 (MQ=255) cGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTg < 2:4339792/93‑1 (MQ=255) gTATCGTTTCTCGTGCGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGa < 1:2363661/93‑1 (MQ=255) tATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAt > 1:4371890/1‑93 (MQ=255) tATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAt > 2:264548/1‑93 (MQ=255) tATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAt < 1:417610/93‑1 (MQ=255) tCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGGCGCTGCttt > 2:3132695/1‑93 (MQ=255) gTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTg > 1:3282708/1‑93 (MQ=255) gTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTg < 1:2872432/93‑1 (MQ=255) gTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTg > 1:2684793/1‑93 (MQ=255) gTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGTGTGGCTCAGCAGCCGCTGATTTTg > 2:731877/1‑93 (MQ=255) tttCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGc < 2:80560/93‑1 (MQ=255) ctcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGt < 2:1266228/93‑1 (MQ=255) tcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGtt > 2:104896/1‑93 (MQ=255) tGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGc < 1:1476101/93‑1 (MQ=255) gCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGcccc > 1:1533349/1‑93 (MQ=255) gCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGa > 2:1511903/1‑93 (MQ=255) gCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGa < 1:249524/93‑1 (MQ=255) gCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGa < 2:3325893/93‑1 (MQ=255) gCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGACGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGa > 2:886514/1‑93 (MQ=255) cTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGaa < 1:1846361/93‑1 (MQ=255) tGAGCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt < 2:4492961/93‑1 (MQ=255) tGAATCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt < 2:2915753/93‑1 (MQ=255) tGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt > 2:760626/1‑93 (MQ=255) tGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt > 2:505886/1‑93 (MQ=255) tGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt < 2:3871037/93‑1 (MQ=255) gAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATg < 1:3405669/93‑1 (MQ=255) gAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATg < 2:1097586/93‑1 (MQ=255) aCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGc < 1:2105484/93‑1 (MQ=255) ccGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCt > 2:4039316/1‑93 (MQ=255) cGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTg < 1:2090755/93‑1 (MQ=255) tCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaa > 2:3515235/1‑93 (MQ=255) gggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaa < 2:589780/93‑1 (MQ=255) ggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaaa > 1:2283943/1‑93 (MQ=255) gCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAc < 1:3582811/93‑1 (MQ=255) gATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCt > 1:1423532/1‑93 (MQ=255) gATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCt > 1:2991290/1‑93 (MQ=255) gATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCt > 1:1955553/1‑93 (MQ=255) gATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGGGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGCATGGCTGAAAAAACt > 2:2593459/1‑93 (MQ=255) aTTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTg > 2:934532/1‑93 (MQ=255) ttCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGc > 1:4591879/1‑93 (MQ=255) cTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctc < 1:3868305/93‑1 (MQ=255) cTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCCGAATGGCTGAAAAACCTGctc < 2:2986493/93‑1 (MQ=255) tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct > 2:270099/1‑93 (MQ=255) tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct > 1:881765/1‑93 (MQ=255) tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct > 2:1293145/1‑93 (MQ=255) gATTATCGCTCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCtctc < 2:1000711/93‑1 (MQ=255) aTTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcc < 2:2271368/93‑1 (MQ=255) aTTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcc < 2:3965903/93‑1 (MQ=255) ttATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcct < 2:1386740/93‑1 (MQ=255) tATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcctc > 2:3718925/1‑93 (MQ=255) gcgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCggg > 1:1092064/1‑93 (MQ=255) gcgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCggg > 1:370122/1‑93 (MQ=255) cgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGa < 2:1658602/93‑1 (MQ=255) gcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAt < 2:1179790/93‑1 (MQ=255) tGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcg > 1:559450/1‑93 (MQ=255) tGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcg < 1:3453765/93‑1 (MQ=255) tGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcg > 2:3239382/1‑93 (MQ=255) gTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAATCTGCTCTCCTCCGGGATcgc > 1:2708116/1‑93 (MQ=255) gTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgc < 1:3823615/93‑1 (MQ=255) tCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgcc > 2:2530599/1‑93 (MQ=255) cGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgccg < 1:2147814/93‑1 (MQ=255) ggCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcggg < 1:3838239/93‑1 (MQ=255) ggCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCACTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcggg > 1:4290367/1‑93 (MQ=255) gTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGt > 2:1900064/1‑93 (MQ=255) gTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGt > 1:1144932/1‑93 (MQ=255) gTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGt < 2:1770533/93‑1 (MQ=255) gTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGt > 2:1359259/1‑93 (MQ=255) ttGTTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTa < 2:2427429/93‑1 (MQ=255) ttGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTa < 1:3367957/93‑1 (MQ=255) ttGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCCCCGGGATCGCCGCGGGCGGTa < 2:2042610/93‑1 (MQ=255) tGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAt < 2:1450066/93‑1 (MQ=255) gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa < 1:1623743/93‑1 (MQ=255) gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa < 2:1430289/93‑1 (MQ=255) tCTGTGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:1913236/93‑1 (MQ=255) tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAATCCTGCTCGCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:4534729/93‑1 (MQ=255) tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:1800513/93‑1 (MQ=255) tCTGGGTGTGCCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:647269/93‑1 (MQ=255) tGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTg > 2:4403506/1‑93 (MQ=255) tGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTg > 1:447317/1‑93 (MQ=255) | CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG > NC_000913/3827744‑3827922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |