BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	3,904,345	T→C	intergenic (‑150/+136)	bglG ← / ← phoU	BglG/PhoU

Read alignment evidence...
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*	NC_000913	3,904,345	0	T	C	100.0%	453.4 / NA	142	intergenic (‑150/+136)	bglG/phoU	BglG/PhoU
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (29/113); total (29/113)

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CAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTAT  >  NC_000913/3904255‑3904434

 aGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCa                                                                                        >  1:1416932/1‑93 (MQ=255)

  ggTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCag                                                                                       >  1:1346619/1‑93 (MQ=255)

     tttGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAgaga                                                                                    <  1:1587426/93‑1 (MQ=255)

     tttGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAgaga                                                                                    <  2:2970131/93‑1 (MQ=255)

       tGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGaaa                                                                                  <  2:3174562/93‑1 (MQ=255)

        gCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGaaaa                                                                                 <  2:4439573/93‑1 (MQ=255)

         ccTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAAt                                                                                <  2:1457841/93‑1 (MQ=255)

         ccTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAAt                                                                                <  1:1790111/93‑1 (MQ=255)

          cTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATa                                                                               <  1:3543474/93‑1 (MQ=255)

          cTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATa                                                                               <  2:1162149/93‑1 (MQ=255)

          cTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATa                                                                               >  2:4356090/1‑93 (MQ=255)

           tGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAg                                                                              >  2:4342318/1‑93 (MQ=255)

            gCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGc                                                                             <  2:3278685/93‑1 (MQ=255)

              gAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCaa                                                                           <  1:3429508/93‑1 (MQ=255)

               aaTGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAAt                                                                          <  1:3740134/93‑1 (MQ=255)

               aaTGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAAt                                                                          <  2:2813227/93‑1 (MQ=255)

                aTGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATg                                                                         >  2:3650055/1‑93 (MQ=255)

                aTGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATg                                                                         >  2:4023293/1‑93 (MQ=255)

                 tGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATgc                                                                        <  2:4650296/93‑1 (MQ=255)

                 tGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATgc                                                                        <  1:1251915/93‑1 (MQ=255)

                 tGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATgc                                                                        <  1:985896/93‑1 (MQ=255)

                 tGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATgc                                                                        <  1:4295242/93‑1 (MQ=255)

                 tGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATgc                                                                        >  2:2771461/1‑93 (MQ=255)

                  gCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATgcg                                                                       >  1:1002267/1‑93 (MQ=255)

                   cAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATgcgc                                                                      <  2:3068804/93‑1 (MQ=255)

                   cAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATgcgc                                                                      <  1:3886311/93‑1 (MQ=255)

                   cAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATgcgc                                                                      <  1:323226/93‑1 (MQ=255)

                     gTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTa                                                                    <  2:2128454/93‑1 (MQ=255)

                      tAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTAt                                                                   <  2:339593/93‑1 (MQ=255)

                        aCAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTg                                                                 >  1:2468569/1‑93 (MQ=255)

                             ccAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATaaa                                                            <  1:3084345/93‑1 (MQ=255)

                             ccAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATaaa                                                            <  2:398852/93‑1 (MQ=255)

                                  cATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAatat                                                       <  1:3971954/93‑1 (MQ=255)

                                  cATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAatat                                                       >  1:3028232/1‑93 (MQ=255)

                                   aTTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATg                                                      >  2:4194500/1‑93 (MQ=255)

                                    tttATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGa                                                     <  1:3475012/93‑1 (MQ=255)

                                    tttATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGa                                                     <  1:2719682/93‑1 (MQ=255)

                                    tttATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGa                                                     <  1:4450221/93‑1 (MQ=255)

                                    tttATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGa                                                     <  1:4483278/93‑1 (MQ=255)

                                    tttATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGa                                                     >  1:460897/1‑93 (MQ=255)

                                     ttattaATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGAc                                                    <  1:683823/93‑1 (MQ=255)

                                      tattaATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGAcc                                                   >  2:1989284/1‑93 (MQ=255)

                                       attaATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCa                                                  >  2:492526/1‑93 (MQ=255)

                                       attaATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCa                                                  <  1:868120/93‑1 (MQ=255)

                                       attaATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCa                                                  <  1:4658709/93‑1 (MQ=255)

                                         taATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATg                                                <  2:4180151/93‑1 (MQ=255)

                                         taATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATg                                                >  2:2710509/1‑93 (MQ=255)

                                          aaTGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGc                                               <  2:1823791/93‑1 (MQ=255)

                                           aTGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCt                                              <  1:2047959/93‑1 (MQ=255)

                                           aTGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCt                                              >  1:2557360/1‑93 (MQ=255)

                                                ttttATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAg                                         >  1:1504482/1‑93 (MQ=255)

                                                 tttATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGt                                        <  1:3621826/93‑1 (MQ=255)

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                                                 tttATAACGAACATCCAGGTGCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGt                                        <  1:4314017/93‑1 (MQ=255)

                                                  ttATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCGATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGtt                                       >  1:2220823/1‑93 (MQ=255)

                                                   tataACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGtta                                      <  1:3292182/93‑1 (MQ=255)

                                                      aaCGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGttatta                                   <  1:567369/93‑1 (MQ=255)

                                                       aCGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTaa                                  <  2:3498406/93‑1 (MQ=255)

                                                         gAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACt                                >  2:2547156/1‑93 (MQ=255)

                                                         caaCATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACt                                <  2:3745740/92‑1 (MQ=255)

                                                          aaCATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACtt                               <  1:600555/93‑1 (MQ=255)

                                                          aaCATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACtt                               <  1:2660858/93‑1 (MQ=255)

                                                          aaCATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACtt                               <  2:4274889/93‑1 (MQ=255)

                                                          aaCATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACtt                               <  2:111312/93‑1 (MQ=255)

                                                            cATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTtg                             <  2:1773608/93‑1 (MQ=255)

                                                             aTCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTtgt                            <  2:121851/93‑1 (MQ=255)

                                                             aTCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTtgt                            <  2:121842/93‑1 (MQ=255)

                                                               ccAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTgtgt                          <  1:2883812/93‑1 (MQ=255)

                                                                cAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTa                         <  2:4286807/93‑1 (MQ=255)

                                                                 aGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTaa                        <  1:1069994/93‑1 (MQ=255)

                                                                 aGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTaa                        <  1:1972922/93‑1 (MQ=255)

                                                                  ggTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAAt                       <  1:3899628/93‑1 (MQ=255)

                                                                  ggTTCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAAt                       <  2:2712988/93‑1 (MQ=255)

                                                                    ttCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAAttt                     <  1:1219816/93‑1 (MQ=255)

                                                                    ttCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAAttt                     <  1:174745/93‑1 (MQ=255)

                                                                     tCGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAAtttt                    <  2:343382/93‑1 (MQ=255)

                                                                      cGGAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTa                   <  1:2313301/93‑1 (MQ=255)

                                                                       ggAAATTAATTTAATTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAg                  <  1:2250488/93‑1 (MQ=255)

                                                                            ttaatttaatTGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAAtt             <  2:2986604/93‑1 (MQ=255)

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                                                                              aatttaattGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTta           >  1:2563964/1‑93 (MQ=255)

                                                                              aatttaattGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTta           <  2:2063322/93‑1 (MQ=255)

                                                                              aatttaattGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTta           <  2:1958570/93‑1 (MQ=255)

                                                                              aatttaattGCGCACAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTta           >  1:417539/1‑93 (MQ=255)

                                                                                tttaattGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTtata         <  2:1325772/93‑1 (MQ=255)

                                                                                tttaattGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCAATATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTATCTTTGTGTAATTTTAGGAATTtata         <  2:3468731/93‑1 (MQ=255)

                                                                                 ttaattGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATaa        <  1:4580659/93‑1 (MQ=255)

                                                                                 ttaattGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATaa        <  2:1603806/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  taattGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATaaa       <  2:3528478/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  taattGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATaaa       <  2:4419025/93‑1 (MQ=255)

                                                                                    attGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGt     <  2:3533437/93‑1 (MQ=255)

                                                                                    attGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGt     <  1:994284/93‑1 (MQ=255)

                                                                                    attGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGt     <  1:2434190/93‑1 (MQ=255)

                                                                                     ttGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGtt    <  2:2235221/93‑1 (MQ=255)

                                                                                     ttGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGtt    >  1:3181280/1‑93 (MQ=255)

                                                                                      tGCGCGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTta   <  1:4384989/93‑1 (MQ=255)

                                                                                       gcgcgcAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTtat  <  2:1346619/93‑1 (MQ=255)

                                                                                       gcgcgcAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTtat  <  1:399052/93‑1 (MQ=255)

CAGGTTTTGCCTGCGAATGCAGTAACAATCCAGTCATTTATTAATGGTTTTTATAACGAACATCCAGGTTCGGAAATTAATTTAATTGCGTGCAGAGAAAATAGCAATGCGCTATTGATAAAAATATGACCATGCTCGCAGTTATTAACTTTGTGTAATTTTAGGAATTTATAAAGTTAT  >  NC_000913/3904255‑3904434

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 24 ≤` `ATCG/ATCG` `< 31 ≤` `ATCG/ATCG` `< 35 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`