Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,186,157 | C→T | A1077V (GCA→GTA) | rpoC → | RNA polymerase beta prime subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,186,157 | 0 | C | T | 99.6% | 889.9 / NA | 255 | A1077V (GCA→GTA) | rpoC | RNA polymerase beta prime subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (123/131); minor base G (1/0); total (124/131) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
CGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTG > NC_000913/4186067‑4186246 | cgcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTAc < 1:4049704/93‑1 (MQ=255) cgcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTAc > 2:3137124/1‑93 (MQ=255) gcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTGCGCCGAACGTACCCCCGGGGGTAAAGATCTGTGTCTGGTAcg > 2:3187509/1‑92 (MQ=255) gcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACt < 1:3252912/93‑1 (MQ=255) gcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACt > 1:1195698/1‑93 (MQ=255) gcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACt < 2:1753379/93‑1 (MQ=255) gcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACt < 2:1541579/93‑1 (MQ=255) gcgTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGGGGTTCTTGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTTCGTCCGGGACt > 2:4115309/1‑93 (MQ=255) gTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGa > 2:3660148/1‑93 (MQ=255) aGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGaaaa > 1:1337365/1‑93 (MQ=255) aGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGaaaa < 1:1728777/93‑1 (MQ=255) aGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGaaaa < 2:2000678/93‑1 (MQ=255) aGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGaaaa < 1:3598959/93‑1 (MQ=255) gACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAAt > 1:609307/1‑93 (MQ=255) cgacgaACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGt < 1:3426289/93‑1 (MQ=255) cgacgaACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGt > 1:1989355/1‑93 (MQ=255) gacgaAGTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGtt < 1:18875/93‑1 (MQ=255) gacgaACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGtt < 2:4414503/93‑1 (MQ=255) cgaACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGa > 2:1919304/1‑93 (MQ=255) cgaACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGa < 1:3413979/93‑1 (MQ=255) gaACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGAt < 2:3850033/93‑1 (MQ=255) gaACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGAt > 2:192252/1‑93 (MQ=255) aaCTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATg > 1:2520799/1‑93 (MQ=255) aaCTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATg < 1:269904/93‑1 (MQ=255) aaCTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATg > 1:319435/1‑93 (MQ=255) cTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCt < 1:917925/93‑1 (MQ=255) tGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTc < 1:1178140/93‑1 (MQ=255) gACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCa < 2:3251059/93‑1 (MQ=255) ccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAgg > 2:3746044/1‑93 (MQ=255) ccGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAgg > 2:148730/1‑93 (MQ=255) ggTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGt < 1:1138064/93‑1 (MQ=255) ggTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGt > 2:2393889/1‑93 (MQ=255) ggTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGt > 1:53433/1‑93 (MQ=255) ggTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGt > 2:633939/1‑93 (MQ=255) gtctgtctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTa < 1:3506392/93‑1 (MQ=255) gtctgtctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTa > 1:2435773/1‑93 (MQ=255) tctgtctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTaa > 2:4060856/1‑93 (MQ=255) ctgtctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAac < 2:134644/93‑1 (MQ=255) gtctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAacga > 2:109220/1‑93 (MQ=255) gtctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAacga > 1:1968533/1‑93 (MQ=255) ttCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGt < 2:2495043/93‑1 (MQ=255) tgctgctGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTc < 2:4212164/92‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCt > 2:1581165/1‑93 (MQ=255) tggtggTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGa > 1:3175097/1‑93 (MQ=255) tggtggTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGa > 1:3272310/1‑93 (MQ=255) gtggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATc < 1:3577447/93‑1 (MQ=255) gtggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATc < 2:206962/93‑1 (MQ=255) tggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATcc > 2:4643221/1‑93 (MQ=255) ggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATccc < 2:4261065/93‑1 (MQ=255) gtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCa < 1:3786658/93‑1 (MQ=255) ttatGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAg < 1:4262696/90‑1 (MQ=255) ttCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAg > 1:2967872/1‑93 (MQ=255) ttCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAg < 2:2685975/93‑1 (MQ=255) tCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAgg > 1:4186249/1‑93 (MQ=255) cTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGt < 2:1405350/93‑1 (MQ=255) ggATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTAc < 1:2770258/93‑1 (MQ=255) ggATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTAc < 1:1477006/93‑1 (MQ=255) gATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTAcc < 2:1686714/93‑1 (MQ=255) ccGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGata < 2:3638872/93‑1 (MQ=255) cGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGatat < 1:4676765/93‑1 (MQ=255) cGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGatat < 1:873273/93‑1 (MQ=255) cGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGatat < 1:4099212/93‑1 (MQ=255) gCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATg > 1:1393067/1‑93 (MQ=255) gAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCa < 2:3545882/93‑1 (MQ=255) gAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCa < 2:1164046/93‑1 (MQ=255) aaCGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAg < 2:776463/93‑1 (MQ=255) aCGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgc > 2:1110583/1‑93 (MQ=255) cGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAgcg > 1:1424939/1‑93 (MQ=255) aCCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAg > 1:2288567/1‑93 (MQ=255) aCCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAg < 1:3157824/93‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGt < 1:2347939/93‑1 (MQ=255) cGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTa < 1:833312/93‑1 (MQ=255) gCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTAc > 1:4008379/1‑93 (MQ=255) cAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACt < 1:456100/93‑1 (MQ=255) aGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACtt > 2:3299592/1‑93 (MQ=255) ggtgttAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGGAACGACGTTCTGAGCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTc < 1:2077712/93‑1 (MQ=255) gtggtAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTcc < 1:646256/93‑1 (MQ=255) gtggtAAAGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTcc > 2:185773/1‑93 (MQ=255) 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aGATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCACAGTACTTCCTGCCggg > 1:1567714/1‑93 (MQ=255) gATCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGt > 2:2189562/1‑93 (MQ=255) aTCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTa > 2:3028352/1‑93 (MQ=255) aTCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTa > 2:3330721/1‑93 (MQ=255) aTCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTa > 1:2452612/1‑93 (MQ=255) tCTGCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTaa > 1:2893027/1‑93 (MQ=255) gCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGc < 1:1640629/93‑1 (MQ=255) gCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGc < 1:3738207/93‑1 (MQ=255) gCGTCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGCTCTGATCCCAGGGACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGAAAAga > 2:2318913/1‑92 (MQ=255) tCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGAt < 1:2680083/93‑1 (MQ=255) tCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGAt < 2:695761/93‑1 (MQ=255) tCCGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGAAAAGCGAt > 2:1010287/1‑93 (MQ=255) cGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTg < 1:756939/93‑1 (MQ=255) cGGTACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTg < 1:1086017/93‑1 (MQ=255) | CGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTG > NC_000913/4186067‑4186246 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |