Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,259,162 | A→G | intergenic (+277/‑86) | yjbM → / → yjbN | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,259,162 | 0 | A | G | 99.5% | 678.1 / ‑4.9 | 211 | intergenic (+277/‑86) | yjbM/yjbN | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (105/104); total (106/105) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.79e-01 |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
TTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATAGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATGC > NC_000913/4259072‑4259251 | ttattTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTatggtatggt > 1:3204227/1‑93 (MQ=255) tattTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTAtggtatggta > 1:2391866/1‑93 (MQ=255) attTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTAc > 1:4071871/1‑93 (MQ=255) attTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTAc > 1:1831076/1‑93 (MQ=255) tttCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTAcc > 2:1435130/1‑93 (MQ=255) ttCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTAccc > 2:3245496/1‑93 (MQ=255) ccATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCg < 1:3610887/93‑1 (MQ=255) aTCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCt > 2:2895876/1‑93 (MQ=255) aTCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCt > 1:1363427/1‑93 (MQ=255) aTCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCt < 2:4410604/93‑1 (MQ=255) aTCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCt > 2:881378/1‑93 (MQ=255) cACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTAt > 2:924329/1‑93 (MQ=255) cACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTAt < 1:4016280/93‑1 (MQ=255) aCTTCGTGAGAGCTTCATGTCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTAtt > 2:4565781/1‑93 (MQ=255) aCTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTAtt < 2:2993462/93‑1 (MQ=255) aCTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTAtt > 2:662654/1‑93 (MQ=255) aCTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTAtt > 1:3908977/1‑93 (MQ=255) cTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTg > 2:141397/1‑93 (MQ=255) ttCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGa < 1:2371278/93‑1 (MQ=255) ttCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGa > 2:523883/1‑93 (MQ=255) ttCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGa > 1:910682/1‑93 (MQ=255) ttCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGa < 1:1003062/93‑1 (MQ=255) tCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAg > 1:3789450/1‑93 (MQ=255) gTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGcc > 2:2792898/1‑93 (MQ=255) tGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGcct > 2:2082749/1‑93 (MQ=255) tGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGcct > 2:2582023/1‑93 (MQ=255) agagCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGcctcc < 2:901327/93‑1 (MQ=255) gCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGa > 1:2472897/1‑93 (MQ=255) cTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGaa < 2:160612/93‑1 (MQ=255) cTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGaa < 1:2339248/93‑1 (MQ=255) ttCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAAt > 1:1918397/1‑93 (MQ=255) ttCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAAt > 1:4537560/1‑93 (MQ=255) tCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATa > 2:4281822/1‑93 (MQ=255) aTGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGt > 1:2901602/1‑93 (MQ=255) aTGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGt < 1:3375388/93‑1 (MQ=255) gCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGa < 2:3460506/93‑1 (MQ=255) ccTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGAt < 2:1954699/93‑1 (MQ=255) cTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATg > 1:4615806/1‑93 (MQ=255) ttGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGc > 1:1346280/1‑93 (MQ=255) ttGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGc < 2:770161/93‑1 (MQ=255) agagGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGa < 1:197562/93‑1 (MQ=255) agGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAat < 1:3510072/93‑1 (MQ=255) ggATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAata > 2:2979907/1‑93 (MQ=255) gATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataa > 2:448345/1‑93 (MQ=255) gATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataa < 2:1119566/93‑1 (MQ=255) aTCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataac < 1:113554/93‑1 (MQ=255) tctcAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataaca < 2:2191645/93‑1 (MQ=255) tctcAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataaca < 1:1551701/93‑1 (MQ=255) tctcAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataaca > 1:3231941/1‑93 (MQ=255) tctcAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataaca < 1:660880/93‑1 (MQ=255) tctcAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataaca < 2:2290199/93‑1 (MQ=255) ctcAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataacat > 1:477588/1‑93 (MQ=255) cAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataacataa < 2:3561266/93‑1 (MQ=255) cAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataacataa < 1:3646304/93‑1 (MQ=255) aaTTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataacataac < 1:1655340/93‑1 (MQ=255) aaTTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataacataac < 2:600383/93‑1 (MQ=255) aaTTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAataacataac < 1:3403506/93‑1 (MQ=255) aTTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAAcc > 1:1208872/1‑93 (MQ=255) aTTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAAcc < 2:3143345/93‑1 (MQ=255) aTTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAAcc < 2:4596324/93‑1 (MQ=255) aTTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATACTGAATAACATAAcc > 1:1239970/1‑93 (MQ=255) ttttCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAAccc < 2:1774534/93‑1 (MQ=255) tttCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAAcccc > 1:4232279/1‑93 (MQ=255) tttCTTTTACAATGAGACATGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAAcccc > 2:4578025/1‑93 (MQ=255) ttttGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGa > 1:1506666/1‑93 (MQ=255) ttttGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGa < 1:787662/93‑1 (MQ=255) tttGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGat < 1:2688226/93‑1 (MQ=255) gCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGatata < 2:3674326/93‑1 (MQ=255) gCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGatata < 2:250661/93‑1 (MQ=255) aaTGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTCCCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATc < 1:255333/93‑1 (MQ=255) aaTGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATc < 2:788860/93‑1 (MQ=255) aaTGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATc > 1:2451317/1‑93 (MQ=255) aTGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCg > 1:1061354/1‑93 (MQ=255) tGAGACAAGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGa > 2:4453739/1‑93 (MQ=255) gagaCAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGAt < 1:1086460/93‑1 (MQ=255) gagaCAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGAt < 2:433028/93‑1 (MQ=255) gaCAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATaa > 2:721822/1‑93 (MQ=255) gaCAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATaa < 1:698407/93‑1 (MQ=255) gaCAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATaa < 1:4270024/93‑1 (MQ=255) aGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAaat < 2:4391960/93‑1 (MQ=255) ggCGCTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAaata < 1:2953882/93‑1 (MQ=255) gcgcTGCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACACCATGATATATCGATAAaataa < 1:2992198/93‑1 (MQ=255) gcTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAAtc < 1:157968/93‑1 (MQ=255) gcTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAAtc > 1:176078/1‑93 (MQ=255) gcTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAAtc < 2:4014717/93‑1 (MQ=255) cTTCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAAtct < 1:4105198/93‑1 (MQ=255) ttCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATCATATATCGATAAAATAAtctc < 1:4647973/93‑1 (MQ=255) ttCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGAGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAAtctc > 1:3943497/1‑93 (MQ=255) tCCTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCGCATGATATATCGATAAAATAATctct > 2:3796515/1‑93 (MQ=255) cTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTAc < 1:2209090/93‑1 (MQ=255) cTGTTGTTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTAc < 2:3846674/93‑1 (MQ=255) tgttgtTATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACa > 2:3993870/1‑93 (MQ=255) gttgttATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACAt > 2:2321512/1‑93 (MQ=255) gttgttATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACAt > 1:726785/1‑93 (MQ=255) tgttATCGTATGTCACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATACCATAGCCCCATGATACATCGATAAAACAATCTCTACGttt < 2:2361012/93‑1 (MQ=255) ttATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGa < 2:1258618/93‑1 (MQ=255) ttATGGTATGGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGa > 1:816151/1‑93 (MQ=255) tatggtatggTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGaa > 1:2025705/1‑93 (MQ=255) atggtatggtACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGaaa > 2:4070815/1‑93 (MQ=255) tggtatggtaCCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGaaaa < 1:1722027/93‑1 (MQ=255) | TTATTTCCATCACTTCGTGAGAGCTTCATGCCTTGAGAGGATCTCAATTTTCTTTTGCAATGAGACAGGCGCTTCCTGTTGTTATGGTATAGTACCCCGCTATTGAGCCTCCTGAATAGTGATGCTGAATAACATAACCCCATGATATATCGATAAAATAATCTCTACATTTGAAAATGC > NC_000913/4259072‑4259251 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |