| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,363,501 | A→G | I284T (ATC→ACC) | dcuA ← | anaerobic dicarboxylate transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,363,501 | 0 | A | G | 99.6% | 699.0 / NA | 222 | I284T (ATC→ACC) | dcuA | anaerobic dicarboxylate transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (110/111); minor base T (0/1); total (110/112) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
TTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGC > NC_000913/4363411‑4363590 | ttgttgGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGtg > 2:919792/1‑93 (MQ=255)ttgttgGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGtg > 2:2268430/1‑93 (MQ=255) tgttgGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGgtgt < 2:3017598/93‑1 (MQ=255) ttgGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGtgttg > 1:2553036/1‑93 (MQ=255) ttgGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGtgttg > 1:2447869/1‑93 (MQ=255) tgGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGtgttgt < 1:2647149/93‑1 (MQ=255) ggAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTc < 1:1105514/93‑1 (MQ=255) ggAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTc > 2:117402/1‑93 (MQ=255) ggAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTc < 2:175442/93‑1 (MQ=255) gAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCg > 1:3151833/1‑93 (MQ=255) gAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCg > 2:3476980/1‑93 (MQ=255) aaaCGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCgg < 2:4287385/93‑1 (MQ=255) aCGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTa < 1:4359191/93‑1 (MQ=255) aCGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGGGTTGTCGGTa > 2:2798421/1‑93 (MQ=255) cGAAAGCATCGCCCTGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTAt > 2:2864705/1‑93 (MQ=255) cGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTAt > 1:2427029/1‑93 (MQ=255) gAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATc < 2:4028969/93‑1 (MQ=255) gAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATc > 1:4531401/1‑93 (MQ=255) aaaGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCTGTATCg > 2:1043716/1‑93 (MQ=255) aaaGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCg > 2:1610909/1‑93 (MQ=255) aaGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGa < 1:2111305/93‑1 (MQ=255) agcaTCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGAc < 1:4156680/90‑1 (MQ=255) agcaTCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGAc > 1:2336688/4‑93 (MQ=255) aTCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACttt < 2:1853543/93‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACttt > 1:2217223/1‑93 (MQ=255) tCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTa < 2:864653/93‑1 (MQ=255) cGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTAc < 1:3223107/93‑1 (MQ=255) gCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACa > 2:2449568/1‑93 (MQ=255) gCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACa < 1:2779777/93‑1 (MQ=255) ccccAGCCACGCAGCACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACa < 1:4110241/92‑1 (MQ=255) gCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATaa < 2:4018427/93‑1 (MQ=255) cACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACg < 1:2302728/93‑1 (MQ=255) cACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACg < 2:2540801/93‑1 (MQ=255) aCGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACgg > 1:359074/1‑93 (MQ=255) aCGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACgg > 2:2973500/1‑93 (MQ=255) aCGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACgg < 1:4325727/93‑1 (MQ=255) cGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGGTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACggt < 1:4285751/93‑1 (MQ=255) cGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACggt < 2:3367977/93‑1 (MQ=255) cGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACggt < 1:1172553/93‑1 (MQ=255) gCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACggtg < 2:675536/93‑1 (MQ=255) gCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACggtg < 2:2286612/93‑1 (MQ=255) aaCACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACggtggt < 1:333053/93‑1 (MQ=255) acacCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTc > 2:1841236/1‑93 (MQ=255) acacCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTc > 1:2968931/1‑93 (MQ=255) cccAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCaga < 1:562110/93‑1 (MQ=255) cccAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCaga > 2:1386787/1‑93 (MQ=255) 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ggATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTg > 2:1626814/1‑93 (MQ=255) gATACAAATACAGGCGCTCATTCCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGc < 2:2497623/93‑1 (MQ=255) gATACAAATACAGGCGCTCATGCCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGc < 1:1629793/93‑1 (MQ=255) tACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCaa > 1:371611/1‑93 (MQ=255) aCAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAAc < 2:1342911/93‑1 (MQ=255) cAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTAGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACg > 2:275163/1‑93 (MQ=255) aaaTACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGGGGTCAGAGTTGCAACGc > 1:1398077/1‑93 (MQ=255) aTACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTg > 2:3299815/1‑93 (MQ=255) 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cATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATgatgat < 1:3413718/93‑1 (MQ=255) cATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGGCAGAGTTGCAACGCTGAGCATgatgat > 1:1694818/1‑93 (MQ=255) aTACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATc < 1:1407005/93‑1 (MQ=255) tACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCa < 1:1362087/93‑1 (MQ=255) tACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCa < 1:380551/93‑1 (MQ=255) aCCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAg < 1:2876197/93‑1 (MQ=255) aCCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAg < 1:845095/93‑1 (MQ=255) ccTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAga > 1:3893565/1‑92 (MQ=255) 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aGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtca < 2:2149649/93‑1 (MQ=255) gTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtcat > 2:2313621/1‑93 (MQ=255) gAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAg < 2:2853609/93‑1 (MQ=255) gAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAg < 2:2661436/93‑1 (MQ=255) aGGGTGTTTTCGGTATCGATTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGc > 2:4585730/1‑93 (MQ=255) aGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGc < 2:1925541/93‑1 (MQ=255) | TTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGC > NC_000913/4363411‑4363590 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |