| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,450,334 | G→A | A64T (GCT→ACT) | ytfT → | putative transport system permease protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,450,334 | 0 | G | A | 98.9% | 634.6 / NA | 188 | A64T (GCT→ACT) | ytfT | putative transport system permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base A (88/97); total (88/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
TCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC > NC_000913/4450245‑4450423 | tCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTc < 1:2007762/93‑1 (MQ=255) cGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTcc < 1:1013664/93‑1 (MQ=255) gATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTccc > 1:4202193/1‑93 (MQ=255) aTAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCg > 2:3922827/1‑93 (MQ=255) tAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGt > 1:148151/1‑93 (MQ=255) aGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt < 2:3574928/93‑1 (MQ=255) aGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt < 1:2871127/93‑1 (MQ=255) aGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt < 2:4640116/93‑1 (MQ=255) aGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGCTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt > 2:3631381/1‑93 (MQ=255) gCCTGGTAGCGCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTg < 1:3827821/93‑1 (MQ=255) gCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTg > 1:2380518/1‑93 (MQ=255) ccTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGc > 1:462368/1‑93 (MQ=255) tGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAGCCGTGCAACTCCCGTTGCGt < 1:349386/93‑1 (MQ=255) tGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGt < 1:230283/93‑1 (MQ=255) tAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAAGTCCCGTTGCGTTat > 1:1792015/1‑92 (MQ=255) tAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTGCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTAc < 2:2818475/93‑1 (MQ=255) aGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACt < 2:168205/93‑1 (MQ=255) gCCGCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTg < 1:4017783/93‑1 (MQ=255) gCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTg < 1:1759005/93‑1 (MQ=255) gCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTg > 2:3428343/1‑93 (MQ=255) gCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTg > 1:1960132/1‑93 (MQ=255) gCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTg < 2:4525944/93‑1 (MQ=255) gCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTg < 2:4565072/93‑1 (MQ=255) ccccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTgg < 1:4497368/93‑1 (MQ=255) cccGCATTTCTGGCAGGGGGTGCTTCAGGCTGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCCTAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGc > 2:4069144/1‑93 (MQ=255) cGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGa > 2:1100617/1‑93 (MQ=255) cGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGa > 1:1435748/1‑93 (MQ=255) gCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAt < 1:2551965/93‑1 (MQ=255) gCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAt > 2:4669545/1‑93 (MQ=255) aTTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTACCCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTg < 1:2515547/93‑1 (MQ=255) aTTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTg < 1:556563/93‑1 (MQ=255) aTTTCTGGCAGGTGGGGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAGCCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTg < 2:559098/93‑1 (MQ=255) ggCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGa < 2:1554186/93‑1 (MQ=255) gCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGAc > 1:2740225/1‑93 (MQ=255) aGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGc > 2:2586443/1‑93 (MQ=255) ggtggtGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCt < 2:592939/93‑1 (MQ=255) gtggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTg > 1:3166389/1‑93 (MQ=255) tggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACTTTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTgg < 1:2145086/93‑1 (MQ=255) tggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTgg > 2:3660028/1‑93 (MQ=255) gttgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGt < 2:86053/91‑1 (MQ=255) ggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGt < 1:710313/93‑1 (MQ=255) ggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGt < 2:1805168/93‑1 (MQ=255) ggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGt > 2:224972/1‑93 (MQ=255) ggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGAGACTGGCATGACGCGGGt > 1:297655/1‑93 (MQ=255) gtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTg < 2:3145648/93‑1 (MQ=255) gCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAt < 2:817616/93‑1 (MQ=255) aGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCa < 1:1175927/93‑1 (MQ=255) aGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCa > 1:3660428/1‑93 (MQ=255) ggATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCAc < 1:2347635/93‑1 (MQ=255) ggATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCAc > 2:3761557/1‑93 (MQ=255) gATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTACCCGTGCAACTCCCGTTGCGTTCCTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCAcc < 2:1450152/93‑1 (MQ=255) aTGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCg > 2:1385913/1‑93 (MQ=255) tGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCgg > 2:2442031/1‑93 (MQ=255) tGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCgg > 1:3271636/1‑93 (MQ=255) gtgtcGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTATCCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCgg < 1:260259/89‑1 (MQ=255) gggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTACCCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGt < 2:2530179/93‑1 (MQ=255) ggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTg < 2:328198/93‑1 (MQ=255) ggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTg > 2:128121/1‑93 (MQ=255) gCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTgg < 2:1766331/93‑1 (MQ=255) gCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTgg < 1:585524/93‑1 (MQ=255) gCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTgg < 1:3190322/93‑1 (MQ=255) cGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTggg > 2:2333529/1‑93 (MQ=255) cGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATCCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTggg < 2:2476877/93‑1 (MQ=255) gTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGa < 1:3916761/93‑1 (MQ=255) gTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGa < 1:2124765/93‑1 (MQ=255) gTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGa < 2:4211414/93‑1 (MQ=255) tttGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAt > 1:305603/1‑93 (MQ=255) tttGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAt > 1:3340324/1‑93 (MQ=255) tttGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAt > 2:1879721/1‑93 (MQ=255) gTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGa < 1:1230919/93‑1 (MQ=255) gTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGa > 1:3617118/1‑93 (MQ=255) cGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtct > 1:939954/1‑93 (MQ=255) gTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctct > 1:4536881/1‑93 (MQ=255) tAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctctc < 1:2234/93‑1 (MQ=255) tAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctctc < 1:1515775/93‑1 (MQ=255) aGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTcc < 1:4365385/93‑1 (MQ=255) gCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCg > 1:4643162/1‑93 (MQ=255) cccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGTATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTa > 1:1723304/1‑93 (MQ=255) cccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTa < 1:987654/93‑1 (MQ=255) ccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg > 2:2251774/1‑93 (MQ=255) ccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg > 2:1170140/1‑93 (MQ=255) cATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg < 1:3642294/93‑1 (MQ=255) cATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg > 1:166613/1‑93 (MQ=255) aTAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAggg > 1:1269659/1‑93 (MQ=255) aTAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAggg < 1:1860953/93‑1 (MQ=255) tAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgggg > 1:1030389/1‑93 (MQ=255) tAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgggg > 1:839835/1‑93 (MQ=255) tAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgggg > 2:174314/1‑93 (MQ=255) gACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCg > 2:2061575/1‑93 (MQ=255) aCATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGGGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCgg > 2:3729091/1‑93 (MQ=255) aTTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTg > 2:1500789/1‑93 (MQ=255) ttCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGa > 2:2162112/1‑93 (MQ=255) tCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt < 2:3953850/93‑1 (MQ=255) cTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATg < 2:2725649/93‑1 (MQ=255) tAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGc < 1:1609263/93‑1 (MQ=255) aaCCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCt > 1:627055/1‑93 (MQ=255) aCCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTa > 1:484509/1‑93 (MQ=255) cGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATc > 1:3529851/1‑93 (MQ=255) tGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGc > 1:669649/1‑93 (MQ=255) gCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGcc > 1:2613796/1‑93 (MQ=255) | TCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC > NC_000913/4450245‑4450423 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |