BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	528,636	T→C	intergenic (+282/+233)	b0501 → / ← b0502	hypothetical protein/hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_000913	528,636	0	T	C	100.0%	580.2 / NA	182	intergenic (+282/+233)	b0501/b0502	hypothetical protein/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (74/108); total (74/108)

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TCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGTGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCATTAG  >  NC_000913/528546‑528725

tCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACgcgt                                                                                         >  1:2756561/1‑93 (MQ=255)

 cAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGtt                                                                                        <  2:1513277/93‑1 (MQ=255)

   gagagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTa                                                                                      <  1:2823569/93‑1 (MQ=255)

    agagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTaa                                                                                     <  2:4673446/93‑1 (MQ=255)

      agTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAtg                                                                                   >  2:4186427/1‑93 (MQ=255)

       gTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAtgt                                                                                  <  1:2486231/93‑1 (MQ=255)

         ttACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGa                                                                                <  2:756799/93‑1 (MQ=255)

         ttACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGa                                                                                <  2:3768037/93‑1 (MQ=255)

           aCATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGt                                                                              >  2:3442037/1‑93 (MQ=255)

             aTAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTCATGTGAGTcc                                                                            >  1:2464111/1‑93 (MQ=255)

              tAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTccc                                                                           <  1:1154275/93‑1 (MQ=255)

              tAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTccc                                                                           <  2:124325/93‑1 (MQ=255)

               aGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCt                                                                          <  1:30528/93‑1 (MQ=255)

                gAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTa                                                                         >  2:821802/1‑93 (MQ=255)

                gAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTa                                                                         <  1:4066813/93‑1 (MQ=255)

                  aTTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATc                                                                       >  2:2186708/1‑93 (MQ=255)

                  aTTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATc                                                                       <  2:1393751/93‑1 (MQ=255)

                  aTTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATc                                                                       <  1:1726733/93‑1 (MQ=255)

                  aTTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATc                                                                       <  2:3550954/93‑1 (MQ=255)

                   ttGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCt                                                                      <  1:657944/93‑1 (MQ=255)

                   ttGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCt                                                                      <  1:4354528/93‑1 (MQ=255)

                   ttGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCt                                                                      <  1:4324142/93‑1 (MQ=255)

                     gCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGa                                                                    <  1:4316112/93‑1 (MQ=255)

                        cTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGaaaa                                                                 <  2:2120532/93‑1 (MQ=255)

                        cTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGaaaa                                                                 >  1:661281/1‑93 (MQ=255)

                        cTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGaaaa                                                                 <  2:2581728/93‑1 (MQ=255)

                         tGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAaaat                                                                <  2:2208231/93‑1 (MQ=255)

                         tGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAaaat                                                                >  1:1009322/1‑93 (MQ=255)

                          ggTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAaaata                                                               <  1:3287200/93‑1 (MQ=255)

                            tCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCTCTATCTGAaaataaa                                                             <  2:4588785/93‑1 (MQ=255)

                              ttttACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAaataaata                                                           >  2:3166479/1‑93 (MQ=255)

                                 tACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATc                                                        <  2:499748/93‑1 (MQ=255)

                                 tACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATc                                                        <  1:437707/93‑1 (MQ=255)

                                 tACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATc                                                        <  1:2829767/93‑1 (MQ=255)

                                  aCGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATcc                                                       <  2:4672754/93‑1 (MQ=255)

                                   cGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCt                                                      >  2:4481940/1‑93 (MQ=255)

                                   cGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCt                                                      <  2:2637588/93‑1 (MQ=255)

                                    gATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCtt                                                     >  1:3344996/1‑93 (MQ=255)

                                     atatCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTc                                                    >  1:1670278/1‑93 (MQ=255)

                                     atatCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTc                                                    >  1:812274/1‑93 (MQ=255)

                                      tatCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTcc                                                   >  2:2914174/1‑93 (MQ=255)

                                      tatCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTcc                                                   <  1:2331379/93‑1 (MQ=255)

                                      tatCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTcc                                                   <  2:1339041/93‑1 (MQ=255)

                                      tatCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTcc                                                   >  1:1969868/1‑93 (MQ=255)

                                      tatCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTcc                                                   <  1:3063697/93‑1 (MQ=255)

                                       atCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCg                                                  <  1:2559173/93‑1 (MQ=255)

                                       atCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCg                                                  <  1:3960978/93‑1 (MQ=255)

                                           gACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGAtt                                              >  2:3334378/1‑93 (MQ=255)

                                            aCATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTa                                             >  1:4219883/1‑93 (MQ=255)

                                               ttGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTaaaa                                          <  1:2101103/93‑1 (MQ=255)

                                               ttGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTaaaa                                          >  2:2807084/1‑93 (MQ=255)

                                               ttGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTaaaa                                          <  1:1527111/93‑1 (MQ=255)

                                                 gtgtAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaata                                        >  2:2031565/1‑93 (MQ=255)

                                                   gtAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaataaa                                      <  1:968454/93‑1 (MQ=255)

                                                   gtAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaataaa                                      >  2:1315924/1‑93 (MQ=255)

                                                   gtAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaataaa                                      <  1:486584/93‑1 (MQ=255)

                                                   gtAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaataaa                                      >  2:1832560/1‑93 (MQ=255)

                                                     aaTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAAtt                                    >  1:2174565/1‑93 (MQ=255)

                                                     aaTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAAtt                                    <  1:3754800/93‑1 (MQ=255)

                                                     aaTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAAtt                                    >  1:1075536/1‑93 (MQ=255)

                                                      aTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTc                                   <  2:2884763/93‑1 (MQ=255)

                                                      aTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTc                                   >  1:1501994/1‑93 (MQ=255)

                                                      aTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTc                                   <  2:2547413/93‑1 (MQ=255)

                                                      aTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTc                                   >  1:3177642/1‑93 (MQ=255)

                                                      aTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTc                                   <  1:3782012/93‑1 (MQ=255)

                                                      aTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTc                                   >  1:336540/1‑93 (MQ=255)

                                                       tACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCt                                  <  2:3713503/93‑1 (MQ=255)

                                                        aCATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCtt                                 <  1:2500049/93‑1 (MQ=255)

                                                         cATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTg                                <  2:3681539/93‑1 (MQ=255)

                                                         cATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTg                                >  2:1783334/1‑93 (MQ=255)

                                                           tatTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGcc                              >  2:3282812/1‑93 (MQ=255)

                                                           tatTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGcc                              >  2:1955102/1‑93 (MQ=255)

                                                           tatTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGcc                              >  1:528297/1‑93 (MQ=255)

                                                            atTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCg                             <  2:3849965/93‑1 (MQ=255)

                                                             ttCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCgg                            >  1:1575844/1‑93 (MQ=255)

                                                              tCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCggg                           <  2:1980824/93‑1 (MQ=255)

                                                               cAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGga                          >  2:2364419/1‑93 (MQ=255)

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                                                                 gCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaa                        <  2:3820787/93‑1 (MQ=255)

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                                                                   cATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaaga                      >  1:3227429/1‑93 (MQ=255)

                                                                    aTGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaagaa                     <  1:162621/93‑1 (MQ=255)

                                                                    aTGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaagaa                     >  1:1859030/1‑93 (MQ=255)

                                                                     tGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaagaaa                    >  2:2308419/1‑93 (MQ=255)

                                                                       cATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAaagaaaga                  <  1:1853268/93‑1 (MQ=255)

                                                                       cATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAaagaaaga                  >  2:3420306/1‑93 (MQ=255)

                                                                       cATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAaagaaaga                  >  1:126648/1‑93 (MQ=255)

                                                                         ttaattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAgg                <  1:1003501/93‑1 (MQ=255)

                                                                          taattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGa               <  1:265492/93‑1 (MQ=255)

                                                                          taattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGa               >  1:866038/1‑93 (MQ=255)

                                                                           aattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGaa              >  1:1180858/1‑93 (MQ=255)

                                                                            attaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGaaa             >  2:3994334/1‑93 (MQ=255)

                                                                              taaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATa           <  2:3848019/93‑1 (MQ=255)

                                                                               aaaaTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATaa          >  1:3983047/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 aaTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAAc        <  2:968261/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  aTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAAcc       <  1:3921083/93‑1 (MQ=255)

                                                                                      tACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCATTa   <  1:3467453/93‑1 (MQ=255)

                                                                                       aCGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCATTAg  <  1:3908987/93‑1 (MQ=255)

                                                                                       aCGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCATTAg  <  1:4237924/93‑1 (MQ=255)

TCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGTGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCATTAG  >  NC_000913/528546‑528725

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 28 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 35 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`