| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,210,746 | C→T | intergenic (+344/+157) | mcrA → / ← ycgW | McrA/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,210,746 | 0 | C | T | 99.2% | 451.6 / ‑5.3 | 129 | intergenic (+344/+157) | mcrA/ycgW | McrA/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (48/79); total (50/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.13e-01 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTAT > NC_000913/1210656‑1210834 | gACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGgtgc < 2:1249822/93‑1 (MQ=255)gACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGgtgc < 1:3380226/93‑1 (MQ=255) aCTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCt < 1:3640623/93‑1 (MQ=255) cTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTa > 1:4465765/1‑93 (MQ=255) cTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTa > 2:2256550/1‑93 (MQ=255) gAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAg < 1:3872865/93‑1 (MQ=255) aaGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAgc < 2:2083096/93‑1 (MQ=255) aaGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAgc < 1:2956326/93‑1 (MQ=255) aaGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAgc < 1:3167916/93‑1 (MQ=255) aaGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAgc < 1:2058423/93‑1 (MQ=255) gCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGctgctg > 2:3204165/1‑93 (MQ=255) tGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGaa > 1:3688122/1‑93 (MQ=255) gACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGaaa > 2:3699375/1‑93 (MQ=255) gACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGaaa > 2:3384781/1‑93 (MQ=255) gACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGaaa > 1:493114/1‑93 (MQ=255) aCCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAAt < 1:3868128/93‑1 (MQ=255) aCCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAAt < 1:2794198/93‑1 (MQ=255) aCCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAAt > 1:1126887/1‑93 (MQ=255) cTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGGGCTAAGCTGCTGAAATGt > 1:1449515/1‑93 (MQ=255) gATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTc < 2:4011114/93‑1 (MQ=255) gTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCagag < 1:2245279/93‑1 (MQ=255) gTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCagag < 2:3140970/93‑1 (MQ=255) ttAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGt > 2:141030/1‑93 (MQ=255) ttAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGt < 2:2245989/93‑1 (MQ=255) aaGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTg < 2:3087118/93‑1 (MQ=255) aaGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTg < 2:2558778/93‑1 (MQ=255) aGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTgg > 1:2649881/1‑93 (MQ=255) aGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTgg < 2:2652555/93‑1 (MQ=255) ggTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGt < 1:4562526/93‑1 (MQ=255) gTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTg < 1:3601520/93‑1 (MQ=255) tATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGa > 1:2030721/1‑93 (MQ=255) ggAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGc < 1:64660/93‑1 (MQ=255) ggAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGc < 1:738969/93‑1 (MQ=255) aaGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGa < 1:4273661/93‑1 (MQ=255) aaGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGa < 2:2719967/93‑1 (MQ=255) aaGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGa < 2:2547764/93‑1 (MQ=255) aaGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGa < 1:2043388/93‑1 (MQ=255) aGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGat < 1:3747034/93‑1 (MQ=255) ggCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatc < 2:2661243/93‑1 (MQ=255) gcgcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatca > 2:3895352/1‑93 (MQ=255) cgcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatcat < 2:2829169/93‑1 (MQ=255) aatcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGa > 2:4312970/1‑93 (MQ=255) aatcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGa > 2:1825291/1‑93 (MQ=255) tcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaaa < 2:3016047/93‑1 (MQ=255) caatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGaaaa < 2:3700050/93‑1 (MQ=255) aatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAAc < 1:331786/93‑1 (MQ=255) atGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACa < 2:1075649/93‑1 (MQ=255) atGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACa < 1:3808040/93‑1 (MQ=255) atGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACa > 1:2461073/1‑93 (MQ=255) tGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACAt > 2:3530137/1‑93 (MQ=255) ccAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAGAACATGt > 2:3641090/1‑93 (MQ=255) cAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTa > 1:3536163/1‑93 (MQ=255) aaGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTaa < 1:101129/93‑1 (MQ=255) aaGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACAAGTaa < 2:799359/93‑1 (MQ=255) aGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAt < 1:822607/93‑1 (MQ=255) aGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAt < 2:2046899/93‑1 (MQ=255) aGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAt > 2:2206079/1‑93 (MQ=255) gACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtc < 1:1440390/93‑1 (MQ=255) gACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtc < 2:4356948/93‑1 (MQ=255) aCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtct > 2:3334198/1‑93 (MQ=255) aCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtct < 2:1260788/93‑1 (MQ=255) aCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtct < 2:333048/93‑1 (MQ=255) cGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtctct < 1:2760383/93‑1 (MQ=255) gTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAAtctctc > 1:225551/1‑93 (MQ=255) aaCTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCa < 1:4553190/93‑1 (MQ=255) aCTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAt < 2:1174129/93‑1 (MQ=255) aCTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAt < 2:2594488/93‑1 (MQ=255) aCTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAt < 2:2706886/93‑1 (MQ=255) ttATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAtgt < 2:224544/93‑1 (MQ=255) ttATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAtgt < 1:2480825/93‑1 (MQ=255) ttATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAtgt < 1:1721967/93‑1 (MQ=255) ttATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAtgt > 1:3091689/1‑93 (MQ=255) ttATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAtgt > 2:1342439/1‑93 (MQ=255) ttATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAtgt < 1:4582193/93‑1 (MQ=255) tATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCAtgtg < 2:790082/93‑1 (MQ=255) aTGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATgtgt < 2:968715/93‑1 (MQ=255) tGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGtt > 1:2270988/1‑93 (MQ=255) gACTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTa < 1:4356633/93‑1 (MQ=255) aCTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTaa > 1:2305378/1‑93 (MQ=255) cTTCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTaaa < 1:132187/93‑1 (MQ=255) ttCGAACGTCTGATTGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAat > 1:2869077/1‑93 (MQ=255) tCGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAata < 2:1303948/93‑1 (MQ=255) cGAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAatat < 1:2444791/93‑1 (MQ=255) gAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATAtt < 2:1387758/93‑1 (MQ=255) gAACGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATAtt > 1:534216/1‑93 (MQ=255) aCGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGa < 1:142673/93‑1 (MQ=255) aCGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGa > 2:4344386/1‑93 (MQ=255) aCGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGa < 1:230992/93‑1 (MQ=255) cGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGaa < 2:3164956/93‑1 (MQ=255) cGTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGaa > 1:1011818/1‑93 (MQ=255) gTCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGaaa > 2:1925450/1‑93 (MQ=255) tCTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAAc < 1:1653383/93‑1 (MQ=255) cTGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACg < 2:845331/93‑1 (MQ=255) tGATGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACgg > 1:3523104/1‑93 (MQ=255) tGGAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAACCGGGCg > 1:3704061/1‑93 (MQ=255) ggAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGt > 2:3472440/1‑93 (MQ=255) gAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAGCGGGCGta > 1:2377440/1‑93 (MQ=255) gAAGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGta < 1:176123/93‑1 (MQ=255) aaGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtat < 2:4276074/93‑1 (MQ=255) aaGGTGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtat > 2:1753064/1‑93 (MQ=255) | GACTGAAGCGGCTGACCTGATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTAT > NC_000913/1210656‑1210834 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |