Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,222,734 | T→C | intergenic (‑583/‑184) | b1172 ← / → b1173 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,222,734 | 0 | T | C | 99.2% | 400.5 / ‑4.8 | 129 | intergenic (‑583/‑184) | b1172/b1173 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (67/61); total (67/62) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
TTATGCGGGATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGTCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGTCG > NC_000913/1222644‑1222823 | ttATGCGGGATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCctggcct > 1:4065029/1‑93 (MQ=255) tATGCGGGATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCctggcctg < 2:86543/93‑1 (MQ=255) tATGCGGGATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCctggcctg > 1:2548327/1‑93 (MQ=255) gggATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGcc > 1:1462425/1‑93 (MQ=255) ggATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCt < 2:3732703/93‑1 (MQ=255) ggATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCt > 1:508133/1‑93 (MQ=255) ggATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCt < 2:2174881/93‑1 (MQ=255) ggATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCt > 2:3582904/1‑93 (MQ=255) gATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTg > 2:1769715/1‑93 (MQ=255) tatCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCg > 2:4324137/1‑93 (MQ=255) tatCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCg > 1:3678060/1‑93 (MQ=255) atcatcATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCgg < 1:3928526/93‑1 (MQ=255) catcgtTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGc > 2:1717232/1‑93 (MQ=255) catcatTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGc < 2:3804600/93‑1 (MQ=255) catcatTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGc < 2:424002/93‑1 (MQ=255) catcatTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGc > 1:293761/1‑93 (MQ=255) atcatTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCt > 2:4164073/1‑93 (MQ=255) atcatTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCt > 1:1382375/1‑93 (MQ=255) tcatTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTg > 2:4185878/1‑93 (MQ=255) catTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGa < 2:4071354/93‑1 (MQ=255) atTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGAt > 2:520213/1‑93 (MQ=255) atTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGAt > 2:2274791/1‑93 (MQ=255) ttCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGCCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGt < 1:445973/93‑1 (MQ=255) tcatcaTGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGtt > 1:3702065/1‑93 (MQ=255) tcatGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTgca > 2:3362662/1‑93 (MQ=255) tcatGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTgca < 2:781140/93‑1 (MQ=255) tcatGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTgca > 1:2209540/1‑93 (MQ=255) atgatgTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTgcagc > 2:4564849/1‑93 (MQ=255) tgatgTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTgcagca < 2:3858972/93‑1 (MQ=255) gatgTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGcagcag < 1:516957/93‑1 (MQ=255) gatgTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGcagcag > 1:3405143/1‑93 (MQ=255) atgTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCaga > 1:1673359/1‑93 (MQ=255) atgTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCaga < 2:307171/93‑1 (MQ=255) atgTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCaga > 1:321404/1‑93 (MQ=255) atgTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCaga < 2:2671153/93‑1 (MQ=255) gTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGc < 2:1992444/93‑1 (MQ=255) gTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGc < 1:4188343/93‑1 (MQ=255) gTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGc > 1:3184516/1‑93 (MQ=255) gTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGc > 2:4682080/1‑93 (MQ=255) tCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCt < 2:4479532/93‑1 (MQ=255) tCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCt > 1:1251784/1‑93 (MQ=255) cTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCtt > 1:1561228/1‑93 (MQ=255) tttGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAGTCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTa < 1:1909016/93‑1 (MQ=255) tttGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTa > 1:3392340/1‑93 (MQ=255) tttGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTa > 1:751019/1‑93 (MQ=255) ttGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAg > 1:1091445/1‑93 (MQ=255) ggTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGt > 2:2590953/1‑93 (MQ=255) ggTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGt > 1:3766095/1‑93 (MQ=255) ggTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGt < 2:4595173/93‑1 (MQ=255) gTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTc < 2:1500216/93‑1 (MQ=255) gAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGGGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCat > 1:450206/1‑92 (MQ=255) aGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACt < 2:3399990/93‑1 (MQ=255) cGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTa < 2:673434/93‑1 (MQ=255) gTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGa < 1:1901972/93‑1 (MQ=255) aaCACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGc > 2:3890838/1‑93 (MQ=255) caATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGctact < 2:1500736/93‑1 (MQ=255) caATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGctact > 1:401494/1‑93 (MQ=255) aaTACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGctacta > 2:3246163/1‑93 (MQ=255) aTACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTAt < 2:3613088/93‑1 (MQ=255) aTACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTAt < 2:3581381/93‑1 (MQ=255) acacCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCa < 1:2767235/93‑1 (MQ=255) acacCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCa < 1:4111843/93‑1 (MQ=255) cacCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCAt > 1:1373425/1‑93 (MQ=255) cacCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCAt > 1:1787338/1‑93 (MQ=255) cacCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCAt < 2:3340624/93‑1 (MQ=255) cccTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCAtt < 1:2537478/92‑1 (MQ=255) acCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCAtt > 1:3224840/1‑93 (MQ=255) acCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCAtt < 2:2781627/93‑1 (MQ=255) acCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCAtt < 1:2033301/93‑1 (MQ=255) cTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTa < 2:93161/93‑1 (MQ=255) cTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTa > 1:1688968/1‑93 (MQ=255) cgcTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATcc < 2:3951221/93‑1 (MQ=255) gcTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCa > 1:4245910/1‑93 (MQ=255) cTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCaa < 2:443434/93‑1 (MQ=255) cTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCaa < 1:1013808/93‑1 (MQ=255) ctctTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGc < 1:2843066/93‑1 (MQ=255) tctTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCa > 1:1329980/1‑93 (MQ=255) tctTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCa > 1:1203233/1‑93 (MQ=255) tctTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCa > 2:673994/1‑93 (MQ=255) tctTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCa > 1:2227220/1‑93 (MQ=255) ctTCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCAt < 1:1246769/93‑1 (MQ=255) ttCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATg > 2:932927/1‑93 (MQ=255) ttCAGGAGGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATg < 2:2745677/93‑1 (MQ=255) tCAGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATgg > 2:3266263/1‑93 (MQ=255) aGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGaa > 2:3664906/1‑93 (MQ=255) aGGATGAATCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGaa < 1:1095376/93‑1 (MQ=255) aaTCCCCTGGTCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGaaa < 1:4620100/93‑1 (MQ=255) aaTCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGaaa < 1:3677009/93‑1 (MQ=255) aaTCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGaaa > 2:659098/1‑93 (MQ=255) aTCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAAt > 2:3010556/1‑93 (MQ=255) tCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATc < 1:2006679/93‑1 (MQ=255) tCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATc < 1:2974541/93‑1 (MQ=255) tCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATc < 2:1859268/93‑1 (MQ=255) tCCCCTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATc < 1:1183167/93‑1 (MQ=255) cccTGGCCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAg < 2:1075345/93‑1 (MQ=255) cctggcctggTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGt > 1:2477731/1‑93 (MQ=255) ctggcctggtGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGTc > 1:431498/1‑93 (MQ=255) tggcctggtGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGTCg > 2:1086149/1‑93 (MQ=255) tggcctggtGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGTCg < 1:4663457/93‑1 (MQ=255) tggcctggtGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGTCg < 1:3777227/93‑1 (MQ=255) | TTATGCGGGATATCATCATTTCATCATGATGTCTTTGGTGAGCGGTGAACACAATACACCTGCGCTGTCTCTTCAGGATGAATCCCCTGGTCTGGTGCCTGCGGGCTGATGTTGCAGCAGAGCTTAGGTCACTTAGACGCTACTATCATTTATCCAATGGCATGGAATCGAAATCAGTCG > NC_000913/1222644‑1222823 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |