| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,390,553 | T→C | V180A (GTT→GCT) | ycjZ → | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,390,553 | 0 | T | C | 99.1% | 348.1 / ‑4.6 | 111 | V180A (GTT→GCT) | ycjZ | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (58/52); total (58/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
AGATGGATAAAGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTAATAC > NC_000913/1390463‑1390642 | agaTGGATAAAGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTc < 1:3512178/93‑1 (MQ=255) gaTGGATAAAGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTcc < 2:3222720/93‑1 (MQ=255) tGGATAAAGATATGATCGCCATTCGAATCGGCCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCaa < 1:3683479/93‑1 (MQ=255) ggATAAAGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAAc < 1:4177126/93‑1 (MQ=255) aTAAAGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCCACGt > 1:1314283/1‑93 (MQ=255) aTAAAGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGt < 1:1008442/93‑1 (MQ=255) aTAAAGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGt > 1:2848675/1‑93 (MQ=255) tAAAGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTc > 1:941103/1‑93 (MQ=255) aaaGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCa > 2:2857651/1‑93 (MQ=255) aaaGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCa < 2:2850662/93‑1 (MQ=255) aaaGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCa > 1:1961592/1‑93 (MQ=255) gATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAgtg < 2:3532414/93‑1 (MQ=255) gATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAgtg > 1:1527075/1‑93 (MQ=255) gATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAgtg > 1:197760/1‑93 (MQ=255) tatGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTAGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTc > 1:1402706/1‑93 (MQ=255) tGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTcac > 1:949907/1‑93 (MQ=255) gATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTcaca < 1:3134549/93‑1 (MQ=255) gATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTcaca > 2:1762422/1‑93 (MQ=255) aTCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACaa < 1:409406/93‑1 (MQ=255) tCGCCATTCGAATCGGGCCGGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAAt < 1:4125112/93‑1 (MQ=255) tCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAAt > 1:450101/1‑93 (MQ=255) gCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTa > 1:4520703/1‑93 (MQ=255) cATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAAt > 1:880829/1‑93 (MQ=255) cATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAAt < 2:2724761/93‑1 (MQ=255) cATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTAGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAATTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTCAt > 1:1101400/1‑93 (MQ=255) aTTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATa < 1:4006583/93‑1 (MQ=255) aTTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATa < 1:778476/93‑1 (MQ=255) ttCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAg < 2:4375540/93‑1 (MQ=255) ttCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAg > 2:2168128/1‑93 (MQ=255) ttCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAg < 1:3140577/93‑1 (MQ=255) ttCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCAAACGTCAGTGTCACAATTAATAg > 2:4623284/1‑93 (MQ=255) cGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGat < 1:2236284/93‑1 (MQ=255) cGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGat < 2:3403927/93‑1 (MQ=255) aaTCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGatca > 2:198761/1‑93 (MQ=255) aaTCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGatca < 1:225797/93‑1 (MQ=255) aaTCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGatca < 1:2427800/93‑1 (MQ=255) aTCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGatcat < 2:4043027/93‑1 (MQ=255) aTCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGatcat < 1:1135388/93‑1 (MQ=255) tCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGatcatc > 1:2889352/1‑93 (MQ=255) tCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGatcatc < 2:1655916/93‑1 (MQ=255) gggCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAg > 1:1891092/1‑93 (MQ=255) ccAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCa > 2:1668629/1‑93 (MQ=255) cAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCaa > 1:1579615/1‑93 (MQ=255) aGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCaat < 1:4596405/93‑1 (MQ=255) gATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCTGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCaatt < 1:708844/93‑1 (MQ=255) gATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCaatt > 1:2575421/1‑93 (MQ=255) atatACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCaatta > 2:4286904/1‑93 (MQ=255) ataCCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCaattaat < 2:4654246/93‑1 (MQ=255) ataCCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGAGCATCAGGCaattaat < 2:2975566/93‑1 (MQ=255) taCCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCaattaatt > 1:1020607/1‑93 (MQ=255) taCCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCaattaatt > 1:3148503/1‑93 (MQ=255) taCCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCaattaatt > 2:2373174/1‑93 (MQ=255) aCCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAAttt < 1:1453940/93‑1 (MQ=255) aCCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAAttt > 2:107951/1‑93 (MQ=255) aaTGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTa > 1:1964019/1‑93 (MQ=255) aaTGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTa > 2:124679/1‑93 (MQ=255) aaTGGCTATTGTCGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTa > 2:3759283/1‑93 (MQ=255) aaTGGCTATTGCTAGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATAATCAGGCAATTAACTTGTa > 2:1487327/1‑93 (MQ=255) aTGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTAt > 2:1999570/1‑93 (MQ=255) tGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCTGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATc < 2:749191/93‑1 (MQ=255) ggCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCt > 1:1952449/1‑93 (MQ=255) gCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCtt > 1:1326601/1‑93 (MQ=255) gCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCtt > 2:2122190/1‑93 (MQ=255) cTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTc > 2:2606431/1‑93 (MQ=255) tATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTcc > 1:969832/1‑93 (MQ=255) tATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTcc > 1:2108009/1‑93 (MQ=255) aTTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTccc > 2:608373/1‑93 (MQ=255) aTTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTccc > 1:2258032/1‑93 (MQ=255) tgttgGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCcac < 2:190999/93‑1 (MQ=255) tgttgGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCcac > 1:2928075/1‑93 (MQ=255) gttgGCTGACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCcaca < 1:1172285/93‑1 (MQ=255) gttgGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCcaca > 2:2528370/1‑93 (MQ=255) ttgGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACAt > 1:1210396/1‑93 (MQ=255) ttgGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACAt > 1:2961732/1‑93 (MQ=255) gCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCgg < 2:353108/93‑1 (MQ=255) tCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGt < 1:2177759/93‑1 (MQ=255) aCCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTAc > 2:2439089/1‑93 (MQ=255) aCCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTAc > 2:1567306/1‑93 (MQ=255) ccGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACa > 2:2192735/1‑93 (MQ=255) ccGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACa < 1:3471571/93‑1 (MQ=255) ccGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACa < 2:1128647/93‑1 (MQ=255) ttattTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCaaa < 1:424722/93‑1 (MQ=255) ttattTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCaaa < 1:63952/93‑1 (MQ=255) tattTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAAt < 2:684262/93‑1 (MQ=255) attTTTCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATc < 2:1790121/93‑1 (MQ=255) tttttCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCg > 2:2154887/1‑93 (MQ=255) tttttCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCg > 1:1403658/1‑93 (MQ=255) tttCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCt < 2:3855648/93‑1 (MQ=255) ttCTCGCCGAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTg < 2:4532168/93‑1 (MQ=255) gAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTaa > 1:1938571/1‑93 (MQ=255) gAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTaa < 2:1288174/93‑1 (MQ=255) gAAGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTaa < 1:4357964/93‑1 (MQ=255) aaGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTAAt < 1:477904/93‑1 (MQ=255) aGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTAATa < 2:4674863/93‑1 (MQ=255) aGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTAATa > 1:1088962/1‑93 (MQ=255) aGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTAATa < 2:4477283/93‑1 (MQ=255) aGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTAATa < 1:2133532/93‑1 (MQ=255) aGTGCTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTAATa < 2:2258965/93‑1 (MQ=255) gtgcTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTAATAc > 1:2198633/1‑93 (MQ=255) gtgcTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTAATAc < 1:2920216/93‑1 (MQ=255) | AGATGGATAAAGATATGATCGCCATTCGAATCGGGCCAGATATACCAATGGCTATTGTTGGCTCACCGGATTATTTTTCTCGCCGAAGTGTTCCAACGTCAGTGTCACAATTAATAGATCATCAGGCAATTAATTTGTATCTTCCCACATCGGGTACAGCAAATCGCTGGAGATTAATAC > NC_000913/1390463‑1390642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |