BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	1,479,655	T→C	C241C (TGT→TGC)	ynbD →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	1,479,655	0	T	C	99.0%	318.9 / ‑4.9	103	C241C (TGT→TGC)	ynbD	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (38/64); total (39/64)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.79e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01

Only 100 of 105 total aligned reads displayed.

CCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC  >  NC_000913/1479572‑1479744

cccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGta                                                                                  >  2:4474607/1‑93 (MQ=255)

 ccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtat                                                                                 <  2:2437310/93‑1 (MQ=255)

  cTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatt                                                                                >  1:3618209/1‑93 (MQ=255)

  cTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatt                                                                                <  1:692252/93‑1 (MQ=255)

  cTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatt                                                                                >  1:1558876/1‑93 (MQ=255)

   tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               <  2:2028106/93‑1 (MQ=255)

    aTGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtattat                                                                              <  1:4368216/93‑1 (MQ=255)

     tGTCGTAGGCGCGGGGTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCGGGTTATGCTGGCCAGTATTATc                                                                             <  2:1306305/93‑1 (MQ=255)

     tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATc                                                                             <  1:2778184/93‑1 (MQ=255)

       tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGCAGCTAATGATGAGGATTCAGTTATGGTGGCCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc                                                                           <  2:3307738/93‑1 (MQ=255)

            ggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTc                                                                      <  2:1175944/93‑1 (MQ=255)

            ggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTc                                                                      <  1:3510262/93‑1 (MQ=255)

            ggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTc                                                                      >  1:728611/1‑93 (MQ=255)

            ggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTc                                                                      >  2:693067/1‑93 (MQ=255)

             gcgcGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCa                                                                     <  1:1544194/93‑1 (MQ=255)

               gcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATa                                                                   <  1:1396443/93‑1 (MQ=255)

               gcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATa                                                                   <  2:2001565/93‑1 (MQ=255)

                cgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATaa                                                                  <  2:1683207/93‑1 (MQ=255)

                cgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATaa                                                                  <  2:3381205/93‑1 (MQ=255)

                 gggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAt                                                                 <  2:2173503/93‑1 (MQ=255)

                   gCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTg                                                               <  1:560332/93‑1 (MQ=255)

                   gCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTg                                                               <  1:4123379/93‑1 (MQ=255)

                   gCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTg                                                               >  1:2908614/1‑93 (MQ=255)

                     tCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGc                                                             >  1:808695/1‑93 (MQ=255)

                     tCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGc                                                             <  1:3430868/93‑1 (MQ=255)

                          cATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTgg                                                        <  2:3719391/93‑1 (MQ=255)

                           aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       >  1:941180/1‑93 (MQ=255)

                           aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       >  1:3059361/1‑93 (MQ=255)

                             tGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTa                                                     <  2:163242/93‑1 (MQ=255)

                             tGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTa                                                     <  1:3165199/93‑1 (MQ=255)

                              ttATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc                                                    <  1:3727371/92‑1 (MQ=255)

                              gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc                                                    <  1:1501610/93‑1 (MQ=255)

                              gTATTGATAGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc                                                    >  2:799570/1‑93 (MQ=255)

                                aTTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACgg                                                  <  1:2760887/93‑1 (MQ=255)

                                 ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACggg                                                 >  1:1450709/1‑92 (MQ=255)

                                 ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt                                                 <  1:1297867/93‑1 (MQ=255)

                                   gATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTgg                                               <  2:304956/93‑1 (MQ=255)

                                    aTGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTggg                                              <  2:65311/93‑1 (MQ=255)

                                    aTGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTggg                                              >  2:2844913/1‑93 (MQ=255)

                                    aTGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTggg                                              <  2:3279806/93‑1 (MQ=255)

                                     tGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGc                                             >  1:521362/1‑93 (MQ=255)

                                     tGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGGACGGTGGGc                                             >  1:3597678/1‑93 (MQ=255)

                                      ggAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCt                                            >  1:1141439/1‑93 (MQ=255)

                                      ggAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCt                                            >  1:4118633/1‑93 (MQ=255)

                                      ggAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCt                                            <  1:1585981/93‑1 (MQ=255)

                                      ggAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCt                                            <  2:4252238/93‑1 (MQ=255)

                                         gCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTgg                                         >  2:1069585/1‑93 (MQ=255)

                                         gCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTgg                                         <  2:627036/93‑1 (MQ=255)

                                           tAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcg                                       <  2:2049080/93‑1 (MQ=255)

                                            aaTGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGTGCTTGgcgc                                      >  1:3625290/1‑93 (MQ=255)

                                              tgatgatgaTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGa                                    <  2:1731747/93‑1 (MQ=255)

                                              tgatgatgaTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGa                                    <  2:187155/93‑1 (MQ=255)

                                               gatgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGcgcgtt                                   >  1:4142206/1‑91 (MQ=255)

                                                 tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa                                 >  2:236485/1‑93 (MQ=255)

                                                 tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa                                 <  2:1894065/93‑1 (MQ=255)

                                                 tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa                                 <  1:988406/93‑1 (MQ=255)

                                                    tgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaa                              <  2:872163/93‑1 (MQ=255)

                                                     gatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaac                             >  2:1043692/1‑93 (MQ=255)

                                                     gatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaac                             <  1:1376697/93‑1 (MQ=255)

                                                     gatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaac                             <  2:539817/93‑1 (MQ=255)

                                                     gatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaaa                             >  2:3956143/1‑92 (MQ=255)

                                                     gatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaaa                             >  2:3021583/1‑92 (MQ=255)

                                                      atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca                            <  2:2973094/93‑1 (MQ=255)

                                                       ttCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAg                           <  2:1819224/93‑1 (MQ=255)

                                                       ttCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAg                           <  1:3881906/93‑1 (MQ=255)

                                                        tCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAgg                          <  1:3549435/93‑1 (MQ=255)

                                                           gTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaa                       >  1:2452640/1‑93 (MQ=255)

                                                           gTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaa                       <  1:3650319/93‑1 (MQ=255)

                                                             tATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAg                     <  1:1043948/93‑1 (MQ=255)

                                                             tATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAg                     <  2:3312409/93‑1 (MQ=255)

                                                             tATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAg                     <  2:1909837/93‑1 (MQ=255)

                                                              aTGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGa                    >  1:3659930/1‑93 (MQ=255)

                                                               tggtggTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt                   >  1:958110/1‑93 (MQ=255)

                                                               tggtggTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt                   <  1:1782866/93‑1 (MQ=255)

                                                               tggtggTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt                   <  2:3120080/93‑1 (MQ=255)

                                                                 gtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAg                 <  2:1154334/93‑1 (MQ=255)

                                                                 gtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAg                 >  2:3721889/1‑93 (MQ=255)

                                                                 gtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAg                 <  2:2643920/93‑1 (MQ=255)

                                                                  tggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt                <  2:4687990/93‑1 (MQ=255)

                                                                  tggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt                <  1:3295185/93‑1 (MQ=255)

                                                                  tggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt                <  1:1900830/93‑1 (MQ=255)

                                                                   ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               <  2:1657121/93‑1 (MQ=255)

                                                                   ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               >  2:2516583/1‑93 (MQ=255)

                                                                     tCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAg             >  1:1730460/1‑93 (MQ=255)

                                                                      cAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAAGAACAGGGAAAGACAGTCAgg            >  1:839435/1‑93 (MQ=255)

                                                                      cAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgg            <  1:1808744/93‑1 (MQ=255)

                                                                      cAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgg            <  1:2698809/93‑1 (MQ=255)

                                                                        gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg          <  1:2699780/93‑1 (MQ=255)

                                                                        gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg          <  1:1629543/93‑1 (MQ=255)

                                                                         tCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGa         >  1:2214992/1‑93 (MQ=255)

                                                                           tGGTTATGCTGGCGAGTATCATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa       <  2:3101297/93‑1 (MQ=255)

                                                                           tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa       <  1:1360279/93‑1 (MQ=255)

                                                                           tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa       <  2:1652140/93‑1 (MQ=255)

                                                                            ggTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAAc      <  1:697448/93‑1 (MQ=255)

                                                                             gTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACt     >  1:224814/1‑93 (MQ=255)

                                                                             gTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACt     >  1:1554765/1‑93 (MQ=255)

                                                                             gTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACt     >  2:1604750/1‑93 (MQ=255)

                                                                              ttATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTa    >  1:1086749/1‑93 (MQ=255)

                                                                                aTGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc  >  1:4607867/1‑93 (MQ=255)

                                                                                aTGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc  >  1:1936013/1‑93 (MQ=255)

CCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC  >  NC_000913/1479572‑1479744

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 23 ≤` `ATCG/ATCG` `< 30 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`