| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,601,412 | A→G | T124A (ACG→GCG) | ydeY → | putative transport system permease protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,601,412 | 0 | A | G | 93.7% | 256.5 / 6.5 | 95 | T124A (ACG→GCG) | ydeY | putative transport system permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/2); new base G (47/42); total (51/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACAGCTCTCC > NC_000913/1601320‑1601498 | tCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCa > 1:1520177/1‑93 (MQ=255) cgACTTTACTGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGt > 2:4665576/1‑93 (MQ=255) cTTTACTGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAg < 2:4097788/93‑1 (MQ=255) tttACTGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAgg > 2:206016/1‑93 (MQ=255) tACTGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGt > 2:3160106/1‑93 (MQ=255) cTGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTg < 2:2509526/93‑1 (MQ=255) cTGCTTGGGTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGACATTTTTGCCACCCTTGGCGCGCTAGGGTTg > 2:4358372/1‑93 (MQ=255) tGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGt > 2:3256514/1‑93 (MQ=255) tGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGt > 2:3739848/1‑93 (MQ=255) tGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGt > 2:119564/1‑93 (MQ=255) gCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTa > 2:666860/1‑93 (MQ=255) cTTTGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTAc < 1:3920539/93‑1 (MQ=255) ttGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACa > 1:3430142/1‑93 (MQ=255) ggTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACagg > 1:1231192/1‑92 (MQ=255) ggTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACaga < 1:1954659/93‑1 (MQ=255) gTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACagag < 2:2364150/93‑1 (MQ=255) gTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGCCGCGAGGCTAAAGATGCCTGCCACTGTTGCCACCCTTTGCACCTTAGGGTTGTAAagag > 2:1502797/1‑93 (MQ=255) gCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGcat > 2:2173348/1‑93 (MQ=255) gCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGcat < 1:1430739/93‑1 (MQ=255) tCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGcatca > 1:1904421/1‑93 (MQ=255) cgcgGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGcatcat > 2:848127/1‑93 (MQ=255) cgcgGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGcatcat < 1:4499325/93‑1 (MQ=255) gcgGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATg > 1:1311625/1‑93 (MQ=255) gggATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGtt < 1:2954146/93‑1 (MQ=255) ggATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTg > 2:1323484/1‑93 (MQ=255) ggATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTg > 1:3615934/1‑93 (MQ=255) aTTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCt < 1:4288566/93‑1 (MQ=255) tttttCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCtg < 1:3123476/93‑1 (MQ=255) ttttCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCtgt > 1:161185/1‑93 (MQ=255) ttttCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCtgt < 2:2796121/93‑1 (MQ=255) tttCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCtgtg > 2:2425280/1‑93 (MQ=255) tttCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCtgtg > 1:2421223/1‑93 (MQ=255) cAACGGTGTCCTGGTGGCGTGGCGAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCCCCCTGGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGAc < 2:4251817/93‑1 (MQ=255) aaCGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACt < 2:2562823/93‑1 (MQ=255) aaCGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACt > 1:1995636/1‑93 (MQ=255) aaCGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACt > 2:2126497/1‑93 (MQ=255) aCGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTg > 2:1282904/1‑93 (MQ=255) aCGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTg > 1:3827005/1‑93 (MQ=255) aCGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTg < 2:3470649/93‑1 (MQ=255) aCGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTg < 2:3895028/93‑1 (MQ=255) aCGGTGTCCTGGGAGCGTCGCTAAAGATCTCTGCCATTGTTGCCGCCCTTGGGGCGTTATGGTTGTACAGAGGCAGCATGTTCGTGAGGAcag > 2:2505139/1‑91 (MQ=255) cGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTgg < 2:3252670/93‑1 (MQ=255) cGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTgg < 2:4354945/93‑1 (MQ=255) cGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTgg > 1:3595785/1‑93 (MQ=255) ggTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTggc < 2:353885/93‑1 (MQ=255) tgtCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTggcgg < 2:2974633/93‑1 (MQ=255) tgtCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTggcgg > 2:4660154/1‑93 (MQ=255) cTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCaaa > 2:1061416/1‑93 (MQ=255) cTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCaaa < 2:1539623/93‑1 (MQ=255) tGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAAt > 2:4626648/1‑93 (MQ=255) ggTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATATTGCTGTGGACTGGCGGCAAATg < 2:604841/93‑1 (MQ=255) gTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATgg > 1:1904398/1‑93 (MQ=255) tCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGa > 1:683842/1‑93 (MQ=255) tCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGa < 2:4274197/93‑1 (MQ=255) cgcgTGTCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACACTTGTCGCGTTAGGTTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGAt < 2:2857292/93‑1 (MQ=255) gTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCCCCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGa < 1:1084221/93‑1 (MQ=255) gTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCCCCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGa < 1:3427780/93‑1 (MQ=255) gTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGa < 1:2939064/93‑1 (MQ=255) gTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGa < 2:3058212/93‑1 (MQ=255) ggCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAg < 2:1015046/93‑1 (MQ=255) gCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAgg < 2:960980/93‑1 (MQ=255) gCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAgg < 1:1386065/93‑1 (MQ=255) tAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGt > 2:2149530/1‑93 (MQ=255) ggtCCCTGCCATTGTGGCCACTCTTGGCGCGTTAGGGTTATGCGGAGGCATCATGTTGCTGTAGACTGGTGGCGAATCGATTGAAGGGGTagc < 2:3743243/91‑3 (MQ=255) gATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGTCGGCAAATGGATTGAATGGGTAcc > 2:4649969/1‑93 (MQ=255) gATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTAcc > 1:3708616/1‑93 (MQ=255) gATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTAcc < 2:681652/93‑1 (MQ=255) aTCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTAccc < 1:2820589/93‑1 (MQ=255) aTCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTAccc < 1:3700916/93‑1 (MQ=255) tcacTGCCATTGTTGCCGCCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACccg < 1:2808194/90‑1 (MQ=255) tCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACccg > 1:2115627/1‑93 (MQ=255) tCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACccg > 2:1855253/1‑93 (MQ=255) ccTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACccgcc > 1:3099134/1‑93 (MQ=255) cTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACccgccg > 1:1672925/1‑93 (MQ=255) cTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACccgccg > 1:1764064/1‑93 (MQ=255) cTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACccgccg > 2:3190842/1‑93 (MQ=255) gCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGaa > 2:1736096/1‑93 (MQ=255) gCCATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGaa > 2:4480093/1‑93 (MQ=255) ccATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAAc < 1:117871/93‑1 (MQ=255) ccATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAAc < 1:513521/93‑1 (MQ=255) ccATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAAc < 2:1772922/93‑1 (MQ=255) ccATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAAc > 2:1122612/1‑93 (MQ=255) cATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACt > 1:1498075/1‑93 (MQ=255) cATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACt > 2:3601087/1‑93 (MQ=255) cATTGTTGCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACt > 1:606355/1‑93 (MQ=255) cATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACt > 2:1709113/1‑93 (MQ=255) ttgttgCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGa < 1:3964312/93‑1 (MQ=255) tgttgCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGaa > 2:3207861/1‑93 (MQ=255) tttgCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGTGTTACCCGCCGAACTGaaa < 1:427145/92‑1 (MQ=255) gttgCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGaaa > 1:518418/1‑93 (MQ=255) gttgCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGaaa < 2:2442357/93‑1 (MQ=255) tgCCACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACa < 1:3216580/93‑1 (MQ=255) ccACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACAGc < 2:4306053/93‑1 (MQ=255) cACCCTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACAGct > 1:512615/1‑93 (MQ=255) ccccTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACAGctc < 2:115379/92‑1 (MQ=255) cccTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGGTACCCGCCGAACTGAAACAGctct > 1:3942808/1‑93 (MQ=255) ccTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTAGCCGCCGAACTGAAACAGCtctc > 2:1697708/1‑93 (MQ=255) ccTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACAGCtctc > 2:2984337/1‑93 (MQ=255) cTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACAGCTCTcc > 2:2967863/1‑93 (MQ=255) cTTGGCGCGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGACAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACAGCTCTcc < 2:1922490/93‑1 (MQ=255) | TCGCGACTTTACTGCTTGGTTTGCTCGCGGGATTTTTCAACGGTGTCCTGGTCGCGTGGCTAAAGATCCCTGCCATTGTTGCCACCCTTGGCACGTTAGGGTTGTACAGAGGCATCATGTTGCTGTGGACTGGCGGCAAATGGATTGAAGGGTTACCCGCCGAACTGAAACAGCTCTCC > NC_000913/1601320‑1601498 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |