Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,719,329 | A→G | V14V (GTA→GTG) | b1644 → | putative membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,719,329 | 0 | A | G | 93.9% | 368.8 / 9.4 | 132 | V14V (GTA→GTG) | b1644 | putative membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/4); new base G (58/66); total (62/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TTGCGATTTGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTAGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCAGAACA > NC_000913/1719239‑1719418 | gCGATTTGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCgg < 1:2467826/93‑1 (MQ=255) cGATTTGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTAGCGGt < 1:3866235/93‑1 (MQ=255) gATTTGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTa > 1:2750718/1‑93 (MQ=255) aTTTGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAg > 1:574816/1‑93 (MQ=255) tttGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGt < 1:4439130/93‑1 (MQ=255) tttGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGt > 1:3278833/1‑93 (MQ=255) ttGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGtt > 2:4379069/1‑93 (MQ=255) ttGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGtt < 2:2142611/93‑1 (MQ=255) ttGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGtt < 1:764180/93‑1 (MQ=255) ttGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGtt < 1:676274/93‑1 (MQ=255) gCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGc < 2:2415814/93‑1 (MQ=255) gTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTAGCGGTAGTTGCgg > 1:1087147/1‑93 (MQ=255) gTTTGCCTCGCTCTGGCAACACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGTgg > 2:4585313/1‑93 (MQ=255) tttGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGt > 1:4342530/1‑93 (MQ=255) tGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTc < 1:4329326/93‑1 (MQ=255) tGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTc < 1:4584018/93‑1 (MQ=255) gCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAACACAATTAAGTATTTCCCACCAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCt < 1:1806884/93‑1 (MQ=255) gCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCt > 2:1244532/1‑93 (MQ=255) ccTTGCTCTGGCATTACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCtt < 1:4260131/93‑1 (MQ=255) ccTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTAGCGGTAGTTGCGGTTCtt > 2:2428210/1‑93 (MQ=255) cTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTg > 2:4430976/1‑93 (MQ=255) ttGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGc < 1:1556261/93‑1 (MQ=255) tctGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGa < 1:2773507/93‑1 (MQ=255) ctGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGAt < 2:2703964/93‑1 (MQ=255) ctGCCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGAt < 2:2876305/93‑1 (MQ=255) tGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGAtg > 1:3050088/1‑93 (MQ=255) gCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGAtggt < 2:4594403/93‑1 (MQ=255) gCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGAtggt < 2:2544982/93‑1 (MQ=255) gCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGAtggt < 2:202240/93‑1 (MQ=255) gCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGAtggt < 2:56972/93‑1 (MQ=255) cAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGAtggtg < 2:879841/93‑1 (MQ=255) cAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTAGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGAtggtg < 2:1785260/93‑1 (MQ=255) aTACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGc < 2:66950/93‑1 (MQ=255) tACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGTCGGAGGGTGGCt > 1:2069666/1‑93 (MQ=255) tACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCt < 1:3731078/93‑1 (MQ=255) cTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGGTGGTGGCtgg > 1:1245561/1‑92 (MQ=255) cTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCtgt > 1:4479579/1‑93 (MQ=255) tGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCtgtg > 2:3881733/1‑93 (MQ=255) aTTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGa < 2:4684259/93‑1 (MQ=255) aTTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGa > 1:4325783/1‑93 (MQ=255) aTTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGa < 2:3569941/93‑1 (MQ=255) aTTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGa > 2:2928781/1‑93 (MQ=255) ttGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGaa > 1:4598242/1‑93 (MQ=255) tggCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGaa < 2:1598365/91‑1 (MQ=255) tGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAat < 1:964582/93‑1 (MQ=255) cGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAatta < 1:420058/93‑1 (MQ=255) gTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAattat > 2:4361753/1‑93 (MQ=255) ggTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGTattattc > 1:3749749/1‑92 (MQ=255) ggTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAAttatta < 1:2794955/93‑1 (MQ=255) ggTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAAttatta > 1:1945996/1‑93 (MQ=255) aaCTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACAt > 2:1294277/1‑93 (MQ=255) aaCTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACAt < 2:204789/93‑1 (MQ=255) aaCTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACAt < 1:3085110/93‑1 (MQ=255) aCTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATg > 2:2987707/1‑93 (MQ=255) aCTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATg < 2:2141757/93‑1 (MQ=255) cTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGc < 1:2259337/93‑1 (MQ=255) tATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCa < 1:3199843/93‑1 (MQ=255) tATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTAGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCa > 1:1008874/1‑93 (MQ=255) aTGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCaa < 2:4158151/93‑1 (MQ=255) tGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAAt > 2:2414193/1‑93 (MQ=255) tGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAAt < 1:2217382/93‑1 (MQ=255) tGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTAGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAAt < 1:610345/93‑1 (MQ=255) gTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAAtc < 1:4415674/93‑1 (MQ=255) gTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAAtc < 1:4415675/93‑1 (MQ=255) cAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAAtctc < 2:1319875/93‑1 (MQ=255) cAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAAtctc > 1:552444/1‑93 (MQ=255) aTTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCg > 1:3017923/1‑93 (MQ=255) aTTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCg < 2:4222164/93‑1 (MQ=255) ttAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGt < 1:3872015/93‑1 (MQ=255) ttAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGt > 1:530830/1‑93 (MQ=255) tAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTg > 1:910888/1‑93 (MQ=255) aaaCAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGa < 2:2118274/93‑1 (MQ=255) aaaCAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGa < 1:3604269/93‑1 (MQ=255) aaaCAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGa < 1:3303567/93‑1 (MQ=255) aaCAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGac > 1:4116690/1‑93 (MQ=255) cAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGacac < 1:2339115/93‑1 (MQ=255) aaTTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTTCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACAcg > 2:4079048/1‑93 (MQ=255) aGTATTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACg < 1:3428038/93‑1 (MQ=255) aTTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGa > 1:3239376/1‑93 (MQ=255) aTTTCTCAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGa > 2:506839/1‑93 (MQ=255) ctcAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAAt > 1:1181160/1‑93 (MQ=255) ctcAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAAt < 2:3392099/93‑1 (MQ=255) tcAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGGAAATa > 2:2827032/1‑93 (MQ=255) tcAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATa > 1:1767272/1‑93 (MQ=255) tcAACAATCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATa > 2:2240565/1‑93 (MQ=255) caacaaTCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATAc < 1:2109547/93‑1 (MQ=255) aacaaTCATTGTGGCGGTAGGTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGGGGGCACGCGACGGGAAAATGcg > 1:2288711/1‑93 (MQ=255) caaTCATTGTAGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATAcgcg > 2:1179033/1‑93 (MQ=255) aaTCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATAAgcgc > 1:1801547/1‑93 (MQ=255) aTCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCa < 2:1339074/93‑1 (MQ=255) aTCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCa < 1:3136491/93‑1 (MQ=255) tCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGGAAATACGCGCAg > 2:1244371/1‑93 (MQ=255) tCATTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCAg > 2:3531943/1‑93 (MQ=255) aTTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCAgga > 2:4498478/1‑91 (MQ=255) aTTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCAGaa > 1:2213601/1‑93 (MQ=255) aTTGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCAGaa > 2:3182225/1‑93 (MQ=255) ttGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCAGAAc > 2:3725670/1‑93 (MQ=255) ttGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCAGAAc > 1:4261907/1‑93 (MQ=255) ttGTGGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCAGAAc > 1:1546780/1‑93 (MQ=255) tgtgGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCAGAACa < 2:1591252/93‑1 (MQ=255) | TTGCGATTTGCGTTTGCCTTGCTCTGGCAATACTGATTGCGTGGTAACTATGTCAATTAAAACAATTAAGTATTTCTCAACAATCATTGTAGCGGTAGTTGCGGTTCTTGCCGGATGGTGGCTGTGGAATTATTACATGCAATCTCCGTGGACACGCGACGGGAAAATACGCGCAGAACA > NC_000913/1719239‑1719418 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |