| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,782,160 | T→C | V369A (GTG→GCG) | ydiD → | putative ligase/synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,782,160 | 0 | T | C | 99.0% | 292.3 / ‑5.0 | 97 | V369A (GTG→GCG) | ydiD | putative ligase/synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (37/59); total (38/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
GTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGAT > NC_000913/1782070‑1782248 | gTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCgg < 1:837891/93‑1 (MQ=255) ttCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGt > 1:1610681/1‑93 (MQ=255) tCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTc < 1:1376698/93‑1 (MQ=255) gccgcATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGa < 1:1100739/93‑1 (MQ=255) gccgcATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGa < 2:4217899/93‑1 (MQ=255) ccgcATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGAt > 2:2170603/1‑93 (MQ=255) gcATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGa < 1:1518710/93‑1 (MQ=255) gcATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGa < 1:4128331/93‑1 (MQ=255) cATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGac > 1:3918072/1‑93 (MQ=255) cATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGac < 1:660485/93‑1 (MQ=255) aTGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGccg > 1:856916/1‑93 (MQ=255) tGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGacgc < 2:209222/93‑1 (MQ=255) tGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGacgc > 1:4343451/1‑93 (MQ=255) gCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGacgca < 1:664306/93‑1 (MQ=255) cGGTGGTGATTCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTCTGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTTGATGacgcac < 2:2301819/93‑1 (MQ=255) cGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGacgcac < 1:4372336/93‑1 (MQ=255) gtggtgAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTGAAGCGGTCGATGacgccggc > 2:856394/1‑89 (MQ=255) tgAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGa < 2:385369/93‑1 (MQ=255) gAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGAc < 1:491982/93‑1 (MQ=255) gAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGAc > 1:2972075/1‑93 (MQ=255) gAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGAc > 1:2726343/1‑93 (MQ=255) aTCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCt < 2:4009304/93‑1 (MQ=255) tctcGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCtt > 1:2699560/1‑93 (MQ=255) tctcGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCtt > 2:2316517/1‑93 (MQ=255) tctcGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCtt < 1:268506/93‑1 (MQ=255) ctcGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTa < 2:3915030/93‑1 (MQ=255) gatgatCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTACCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCg > 1:2514564/1‑93 (MQ=255) attatCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGc < 2:1536139/90‑1 (MQ=255) atgatCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGc < 2:4032065/93‑1 (MQ=255) gatCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCa > 1:93927/1‑93 (MQ=255) atCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAg < 2:2814222/93‑1 (MQ=255) ccTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGt > 2:1736146/1‑93 (MQ=255) cTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGtt < 1:220005/93‑1 (MQ=255) tttGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTg > 1:1882157/1‑93 (MQ=255) tCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGaa > 2:1590647/1‑93 (MQ=255) tCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGaa < 2:2843175/93‑1 (MQ=255) cgcgCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAg < 2:325232/93‑1 (MQ=255) gcgcTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAgg > 2:2888652/1‑93 (MQ=255) cgcTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGCGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGt < 2:3069758/93‑1 (MQ=255) cTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTga < 1:2619285/93‑1 (MQ=255) ttATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTgaag < 1:1393333/93‑1 (MQ=255) tATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTgaaga < 2:430305/93‑1 (MQ=255) aTGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTgaagaa < 1:2010677/93‑1 (MQ=255) aTGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTgaagaa < 1:1648131/93‑1 (MQ=255) tGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGaagaag < 1:2808857/93‑1 (MQ=255) acacCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCt < 1:2116314/93‑1 (MQ=255) acacCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCt < 2:836997/93‑1 (MQ=255) cacCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTc < 2:2428092/93‑1 (MQ=255) acCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTcg > 1:3719517/1‑93 (MQ=255) ccGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTcgc < 2:972391/93‑1 (MQ=255) cGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTcgcg > 1:2887083/1‑93 (MQ=255) cGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTcgcg < 1:4502523/93‑1 (MQ=255) gATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTcgcgg > 1:3077964/1‑92 (MQ=255) gATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTcgcgg > 1:2163404/1‑92 (MQ=255) gATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGt > 1:4293151/1‑93 (MQ=255) gATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGt > 1:4145408/1‑93 (MQ=255) gATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGt > 2:1814245/1‑93 (MQ=255) gATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGt > 1:783764/1‑93 (MQ=255) aTGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTg > 1:473111/1‑93 (MQ=255) aTGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTg > 1:3046148/1‑93 (MQ=255) aTGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTg > 2:1994255/1‑93 (MQ=255) aTGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTg < 2:4420458/93‑1 (MQ=255) tGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTgg > 1:2965128/1‑93 (MQ=255) ggTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAATACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGc < 1:3300082/93‑1 (MQ=255) ttACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGccc < 1:2885784/93‑1 (MQ=255) ttACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGccc < 1:1774785/93‑1 (MQ=255) tACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGcccc < 2:3956073/93‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCa < 2:3287687/93‑1 (MQ=255) gCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAt > 2:4271375/1‑93 (MQ=255) gCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAt < 2:512189/93‑1 (MQ=255) gCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAt < 2:73155/93‑1 (MQ=255) gCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAt < 1:2381370/93‑1 (MQ=255) cTGCGGCAGGTTTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAtg < 2:2047149/93‑1 (MQ=255) cTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAtg > 1:2744101/1‑93 (MQ=255) tGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAtgt < 1:2963182/93‑1 (MQ=255) tGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAtgt > 1:4258151/1‑93 (MQ=255) tGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAtgt < 2:3635379/93‑1 (MQ=255) tGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAtgt < 2:557088/93‑1 (MQ=255) gCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAtgtg < 2:3992379/93‑1 (MQ=255) gCCGCAGGTGCAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAAtgtg > 2:3395829/1‑93 (MQ=255) ccGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATgtgt < 2:4083261/93‑1 (MQ=255) cGCAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGtt < 1:3341967/93‑1 (MQ=255) catgtgtAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTa < 2:525730/90‑1 (MQ=255) cAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTa < 1:2664029/93‑1 (MQ=255) cAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTa < 2:1458512/93‑1 (MQ=255) cAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTa > 2:2944791/1‑93 (MQ=255) cAGGTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTa < 2:4530625/93‑1 (MQ=255) ggTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATg < 2:2676483/93‑1 (MQ=255) ggTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATg < 1:1997783/93‑1 (MQ=255) ggTGTAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGACTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATg > 1:1637687/1‑93 (MQ=255) tgtAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATggg > 2:2846882/1‑93 (MQ=255) tAGAGATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGt > 2:343082/1‑93 (MQ=255) agagATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTa < 1:2015021/93‑1 (MQ=255) agagATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTa < 1:1700833/93‑1 (MQ=255) agagATTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGACTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATggggga > 1:3050015/1‑91 (MQ=255) agaTTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTAtt > 2:2249688/1‑93 (MQ=255) aTTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTAtttt < 2:4654353/93‑1 (MQ=255) aTTAAAGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTAtttt > 1:214838/1‑93 (MQ=255) aaaGCGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTtgat < 2:3536757/93‑1 (MQ=255) | GTTCGCCGCATGCGGTGGTGAATCTCGATGATCCTTTGTCGCGCTTTATGCACACCGATGGTTACGCTGCCGCAGGTGTAGAGATTAAAGTGGTCGATGACGCACGCAAGACCTTACCGCCAGGTTGCGAAGGTGAAGAAGCCTCGCGTGGCCCCAATGTGTTTATGGGGTATTTTGAT > NC_000913/1782070‑1782248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |