| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,787,068 | G→A | A204T (GCC→ACC) | aroH → | 3‑deoxy‑D‑arabinoheptulosonate‑7‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,787,068 | 0 | G | A | 99.1% | 389.8 / NA | 114 | A204T (GCC→ACC) | aroH | 3‑deoxy‑D‑arabinoheptulosonate‑7‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (54/59); minor base C (0/1); total (54/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
ATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGT > NC_000913/1786978‑1787157 | aTGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCacc < 2:2543598/93‑1 (MQ=255)aTGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCacc > 1:1466363/1‑93 (MQ=255)aTGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCacc > 1:346434/1‑93 (MQ=255) gCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCaccagc > 2:4475644/1‑93 (MQ=255) cTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCaccagcc > 2:410545/1‑93 (MQ=255) cTTCGGCACGCTCCTGTCCGGTAGTGTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCaccagcc < 1:2200706/93‑1 (MQ=255) ttCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCaccagcca > 2:1996898/1‑93 (MQ=255) cGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCata < 1:102333/93‑1 (MQ=255) cGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCata < 1:905686/93‑1 (MQ=255) gCACTCTCCTGTCCGTTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTAGCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATg < 2:706859/93‑1 (MQ=255) ccctctCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGt < 1:813488/91‑1 (MQ=255) cACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGt < 1:2153668/93‑1 (MQ=255) aCTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGtt > 1:458956/1‑93 (MQ=255) aCTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGtt > 2:4370081/1‑93 (MQ=255) ctctCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTc < 2:2023226/93‑1 (MQ=255) ctctCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTc > 1:2157819/1‑93 (MQ=255) ctctCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTc < 2:4623624/93‑1 (MQ=255) tctcCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTcc > 2:4675678/1‑93 (MQ=255) tctcCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTcc > 1:3538508/1‑93 (MQ=255) tctcCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATAGGACCGATGGCAATACGGGGAATGCTGTGGATGCTATTCGCGCAGTCTGTACCAGCCATATGTTcc > 2:2949407/1‑93 (MQ=255) tcCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCctc > 1:3926658/1‑93 (MQ=255) tcCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCctc < 1:3706904/93‑1 (MQ=255) cTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCtctc > 2:247994/1‑93 (MQ=255) cTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCtctc > 1:721421/1‑93 (MQ=255) tCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTCCCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGcc < 1:339559/93‑1 (MQ=255) cGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATTCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAg > 2:3584854/1‑93 (MQ=255) ggTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGa < 1:1655836/93‑1 (MQ=255) ggTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGa > 2:1907226/1‑93 (MQ=255) ggTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGa > 2:2853428/1‑93 (MQ=255) gTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGAc < 1:2862358/93‑1 (MQ=255) gTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGAc > 2:2099621/1‑93 (MQ=255) tAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACa < 1:582725/93‑1 (MQ=255) aGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACaa > 2:1993130/1‑93 (MQ=255) gTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCTGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACaaaa > 1:791974/1‑93 (MQ=255) gTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACaaaa > 1:4660308/1‑93 (MQ=255) gTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACaaaa > 2:2123387/1‑93 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACaaaaa > 1:1308955/1‑93 (MQ=255) tttAAAAATGGTCCCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAAt < 1:4425672/93‑1 (MQ=255) ttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATg > 2:1871951/1‑93 (MQ=255) tAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATgg < 1:3025857/93‑1 (MQ=255) tAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATgg < 1:2815216/93‑1 (MQ=255) tAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATgg < 1:485549/93‑1 (MQ=255) tAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATgg < 1:453888/93‑1 (MQ=255) tAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATgg > 2:4332901/1‑93 (MQ=255) aaaaGGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTc < 2:3955921/93‑1 (MQ=255) aaaTGGTCCCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCa < 1:1194657/93‑1 (MQ=255) aaTGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAg > 2:1163044/1‑93 (MQ=255) aaTGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAg > 2:3916461/1‑93 (MQ=255) aTGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGa < 1:2492634/93‑1 (MQ=255) tGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGAt < 1:1730479/93‑1 (MQ=255) tGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGAt < 1:4440371/93‑1 (MQ=255) ggTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATg > 1:249318/1‑93 (MQ=255) gTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGa < 2:1132179/93‑1 (MQ=255) aCCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGagc > 2:1222910/1‑91 (MQ=255) ccGATGGCAATACGCGGATGGCTGTGGATGCTATCCGCTCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGCCCa < 2:1540918/93‑1 (MQ=255) cGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCAt < 1:207245/93‑1 (MQ=255) gagggCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATc < 2:4367179/90‑1 (MQ=255) gATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATc < 2:4381473/93‑1 (MQ=255) tGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTa > 2:3461896/1‑93 (MQ=255) cAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCa < 2:2848097/93‑1 (MQ=255) aTACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGa < 2:3294633/93‑1 (MQ=255) cgcgGATTGCTGTGGATGCAATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCa < 1:4119482/93‑1 (MQ=255) aTTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGc > 1:199597/1‑93 (MQ=255) tGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCaa < 2:4481123/93‑1 (MQ=255) tGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCaa < 1:1843732/93‑1 (MQ=255) gCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAAc < 2:3708219/93‑1 (MQ=255) gCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAAc < 2:306465/93‑1 (MQ=255) gCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAAc > 1:1719357/1‑93 (MQ=255) cTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCCCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAAcc < 1:3559147/93‑1 (MQ=255) cTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAAcc > 1:3877761/1‑93 (MQ=255) tgtgGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAAccc > 2:753911/1‑93 (MQ=255) tgtgGATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAAccc > 2:854717/1‑93 (MQ=255) ggATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTa < 1:469733/93‑1 (MQ=255) ggATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTa < 1:2686770/93‑1 (MQ=255) ggATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTa < 2:41000/93‑1 (MQ=255) gATGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTAt > 1:3086860/1‑93 (MQ=255) gATGCTATCCGCGCAGCCCAGCCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTAt < 1:2311401/93‑1 (MQ=255) aTGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATg > 1:4303682/1‑93 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATgg > 1:3384891/1‑93 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATgg > 1:1522001/1‑93 (MQ=255) cTATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGcc > 2:4019875/1‑93 (MQ=255) tATCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCca > 1:3018076/1‑93 (MQ=255) aTCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCcac > 1:4336898/1‑93 (MQ=255) tCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCcaca > 2:2325997/1‑93 (MQ=255) tCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCcaca < 1:4388358/93‑1 (MQ=255) tCCGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCcaca > 1:745141/1‑93 (MQ=255) ccGCGCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACat < 1:431544/93‑1 (MQ=255) cgcgCAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACatt > 1:3655169/1‑93 (MQ=255) ccccAGCCCGCCCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACatta < 1:3264203/90‑1 (MQ=255) cgcAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACattat < 2:2392049/93‑1 (MQ=255) gcAGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACattatt > 1:3777962/1‑93 (MQ=255) caccccGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCGACAttatta < 2:1848912/90‑1 (MQ=255) cAGCCCGCCCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACAttatta < 1:3235559/93‑1 (MQ=255) cAGCCCCCCCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACAttatta < 2:1350253/93‑1 (MQ=255) cAGCCCCCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACAttatta < 1:1729511/93‑1 (MQ=255) aGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATtattat < 2:346434/93‑1 (MQ=255) aGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATtattat > 2:4625213/1‑93 (MQ=255) aGCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATtattat < 1:1178097/93‑1 (MQ=255) gCCCGCACCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATg < 2:4160330/93‑1 (MQ=255) cgcaCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGt < 2:3680220/93‑1 (MQ=255) | ATGGCTTCGGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATCAGACCAGCGGCAACCCGTATGGCCACATTATTATGCGT > NC_000913/1786978‑1787157 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |