Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,071,763 | A→G | T735A (ACC→GCC) | b2000 → | outer membrane fluffing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,071,763 | 0 | A | G | 99.1% | 341.3 / ‑4.8 | 110 | T735A (ACC→GCC) | b2000 | outer membrane fluffing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (49/60); total (50/60) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.38e-01 |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GCTTATCGTGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTGCCCGTGG > NC_000913/2071673‑2071851 | gCTTATCGTGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGcc > 1:775505/1‑93 (MQ=255) gCTTATCGTGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGcc < 1:1869674/93‑1 (MQ=255) ttATCGTGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCgg > 2:1259323/1‑93 (MQ=255) ttATCGTGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCgg > 1:1253578/1‑93 (MQ=255) tATCGTGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGgt < 1:1374533/93‑1 (MQ=255) tATCGTGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGgt < 1:2112392/93‑1 (MQ=255) aTCGTGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCCTCAAGCCGgtg > 2:933647/1‑93 (MQ=255) tCGTGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCCTCAGGCCGgtgt > 1:2418515/1‑93 (MQ=255) cGTGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTa < 1:3948062/93‑1 (MQ=255) tGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTaaa < 2:2520068/93‑1 (MQ=255) tGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTaaa < 1:3710696/93‑1 (MQ=255) tGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTaaa > 2:3302662/1‑93 (MQ=255) tGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTaaa < 1:2931284/93‑1 (MQ=255) gCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAAt < 2:2545202/93‑1 (MQ=255) cAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATg < 2:1636474/93‑1 (MQ=255) aGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATgg < 2:2849746/93‑1 (MQ=255) gAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGt > 1:4252834/1‑93 (MQ=255) gAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGt > 1:942195/1‑93 (MQ=255) aaGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGGCATCAGGCCGGTGTAAATGGTg > 2:4556882/1‑93 (MQ=255) aGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGAATTCGGGCAGGGTCACTCGGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGa < 2:2351700/93‑1 (MQ=255) gTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGaa < 2:2019775/93‑1 (MQ=255) gTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGaa > 1:2782957/1‑93 (MQ=255) gTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGaa > 2:3971034/1‑93 (MQ=255) tCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGaaa < 2:3116288/93‑1 (MQ=255) tCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGaaa < 2:3705654/93‑1 (MQ=255) ccccTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCCGCCATCAGGGCGGTGTAAATGGTGAAaac > 2:4131415/1‑93 (MQ=255) ccccTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGGCGGTGTTCATGGTGaaaaa > 2:3758011/1‑92 (MQ=255) ccccTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAaac > 2:1547994/1‑93 (MQ=255) ccccTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAaac > 2:1936828/1‑93 (MQ=255) cccTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGTGAGGCTCCCGCCGGCATCAGGCCGGTGTACATGGAGAAaaca > 2:852480/1‑93 (MQ=255) cccTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAaaca > 1:3398890/1‑93 (MQ=255) ccTGTATGCCTCCATGCTGACACAGTCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAaacaa < 2:3137299/93‑1 (MQ=255) ccTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAaacaa > 1:3431578/1‑93 (MQ=255) cTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAaacaac > 1:1644780/1‑93 (MQ=255) cTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAaacaac < 1:4588878/93‑1 (MQ=255) tGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAacaaca < 1:717874/93‑1 (MQ=255) tGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAacaaca < 1:820534/93‑1 (MQ=255) gTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAg > 2:4302130/1‑93 (MQ=255) tATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGc < 1:2102541/93‑1 (MQ=255) tATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGc > 2:3435900/1‑93 (MQ=255) tGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGcgt > 2:2914346/1‑93 (MQ=255) tGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGcgt > 2:945747/1‑93 (MQ=255) ccTCCATGCTGACACAGGCAATGGCCTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGcgtcc < 1:4618064/93‑1 (MQ=255) cTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGcgtccg > 2:1006243/1‑93 (MQ=255) cTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGcgtccg > 1:2609395/1‑93 (MQ=255) cATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGtct > 2:4484374/1‑93 (MQ=255) cATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGGCCGtct > 2:1997256/1‑93 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGtctc > 1:3553124/1‑93 (MQ=255) aTGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGtctc > 2:3624198/1‑93 (MQ=255) tGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCa < 2:1321693/93‑1 (MQ=255) tGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGAGTCCGTCTCa > 1:3559617/1‑93 (MQ=255) gCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGGCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAg > 2:3612581/1‑93 (MQ=255) cTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGc < 2:3015917/93‑1 (MQ=255) tGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGGGGCAGGCTCCCGCAGCCATCCGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCGGTCTCAGCa > 1:1175400/1‑93 (MQ=255) gACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCAt < 1:3697026/93‑1 (MQ=255) gACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCAt < 1:50358/93‑1 (MQ=255) cacaGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTc > 1:2374432/1‑93 (MQ=255) aGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAgg < 1:1283920/93‑1 (MQ=255) ggCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCGGCCATCAGGCCGGCGTAAATGGTGAAAACAACACCGGCCGTCTCAACAATAAggg > 2:4492672/1‑93 (MQ=255) gCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGc < 2:2205635/93‑1 (MQ=255) aaTGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGGCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCgg > 2:2356745/1‑93 (MQ=255) aTGGACTATGACCGGATTGTGGCAGTCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGt < 1:2472366/93‑1 (MQ=255) tGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTc < 1:2961015/93‑1 (MQ=255) gACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCAt < 1:1767023/93‑1 (MQ=255) aCTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCAtc > 2:1702077/1‑93 (MQ=255) aCTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCAtc < 1:1352356/93‑1 (MQ=255) cTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCAtct < 2:1791095/93‑1 (MQ=255) tATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCCGCCATCAGGCCGGTGGAAATGGTGAAAATAACAGCGGCCGTCTCAGCATTCCGGGCGGTCAtctc > 2:704815/1‑93 (MQ=255) tATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCAtctc < 1:951365/93‑1 (MQ=255) aTGACCGGATGGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCg < 2:1186368/93‑1 (MQ=255) tGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCgg > 2:2684031/1‑93 (MQ=255) gACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGt < 1:182054/93‑1 (MQ=255) gACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGt < 2:4347159/93‑1 (MQ=255) ccGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACCGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCa > 2:2745175/1‑93 (MQ=255) gATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGa > 2:4153424/1‑93 (MQ=255) aTTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGAt < 1:4424893/93‑1 (MQ=255) aTTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCAACAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGAt > 1:4400580/1‑93 (MQ=255) tgtgGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATaa < 2:709433/93‑1 (MQ=255) gtgGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAAc < 2:1818640/93‑1 (MQ=255) tgGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACa < 1:1223935/93‑1 (MQ=255) tgCAGGCGCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCCCGATAACaa < 1:1330530/92‑1 (MQ=255) ggCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACaa < 1:1159845/93‑1 (MQ=255) gCAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAAt > 1:879502/1‑93 (MQ=255) cAGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATg < 1:3683502/93‑1 (MQ=255) aGGCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATgg < 1:1905290/93‑1 (MQ=255) ggCTCCCGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGc > 2:2167250/1‑93 (MQ=255) ccGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTAt > 2:596294/1‑93 (MQ=255) ccGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTAt < 1:4489582/93‑1 (MQ=255) ccGCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTAt > 2:736510/1‑93 (MQ=255) gCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTg > 2:3064129/1‑93 (MQ=255) gCAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTg < 1:3799551/93‑1 (MQ=255) cAGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTGc < 1:1947029/93‑1 (MQ=255) aGCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTGcc > 2:1110548/1‑93 (MQ=255) gCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTGccc > 2:3803340/1‑93 (MQ=255) gCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTGccc > 1:1769834/1‑93 (MQ=255) gCCATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTGccc > 1:2964470/1‑93 (MQ=255) ccATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTGCCCg > 1:3895960/1‑93 (MQ=255) ccATCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTGCCCg < 2:2091620/93‑1 (MQ=255) tCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTGCCCGTgg > 1:3973336/1‑93 (MQ=255) tCAGGCCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTGCCCGTgg < 2:1615857/93‑1 (MQ=255) | GCTTATCGTGCAGAAGTCCCCCTGTATGCCTCCATGCTGACACAGGCAATGGACTATGACCGGATTGTGGCAGGCTCCCGCAGCCATCAGACCGGTGTAAATGGTGAAAACAACAGCGTCCGTCTCAGCATTCAGGGCGGTCATCTCGGTCACGATAACAATGGCGGTATTGCCCGTGG > NC_000913/2071673‑2071851 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |