| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,107,690 | C→T | W157* (TGG→TGA) | rfbC ← | dTDP‑6‑deoxy‑D‑glucose‑3,5 epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,107,690 | 0 | C | T | 99.3% | 484.3 / ‑5.4 | 142 | W157* (TGG→TGA) | rfbC | dTDP‑6‑deoxy‑D‑glucose‑3,5 epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (67/74); total (67/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.04e-01 | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
ATTCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGCCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAATTC > NC_000913/2107601‑2107776 | aTTCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaa < 1:4380917/93‑1 (MQ=255)aTTCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaa > 2:1326437/1‑93 (MQ=255) ttCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaat > 1:808926/1‑93 (MQ=255) ttCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaat > 1:2666152/1‑93 (MQ=255) ttCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaat > 1:2401742/1‑93 (MQ=255) ttCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaat > 2:559938/1‑93 (MQ=255) tCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTcaatc < 1:2120207/93‑1 (MQ=255) gCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAAtt < 1:479905/93‑1 (MQ=255) gCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAAtt > 2:1780060/1‑93 (MQ=255) aattaattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTga > 2:2648553/1‑92 (MQ=255) aattaattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGc > 1:3243585/1‑93 (MQ=255) aattaattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGc > 1:846706/1‑93 (MQ=255) attaattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCa < 1:4530211/93‑1 (MQ=255) attaattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCa > 1:323072/1‑93 (MQ=255) ttaattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACTTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCaa < 2:4398746/93‑1 (MQ=255) ttaattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCaa < 1:356025/93‑1 (MQ=255) taattTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAAt < 2:3196313/93‑1 (MQ=255) ttttAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCg > 2:692914/1‑93 (MQ=255) tAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtc < 2:1959467/93‑1 (MQ=255) tAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtc > 2:2023961/1‑93 (MQ=255) cTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtcatca < 1:2981059/93‑1 (MQ=255) cTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTtcatca < 1:187845/93‑1 (MQ=255) tGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTcatcat > 2:666450/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTcatcat > 1:1337781/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTcatcat < 2:542193/93‑1 (MQ=255) tGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTcatcat > 2:458/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTcatcat < 2:1425431/93‑1 (MQ=255) tAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTcc > 2:321297/1‑93 (MQ=255) tAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTcc > 2:393156/1‑93 (MQ=255) tAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTcc > 2:1266504/1‑93 (MQ=255) aaGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCa > 2:4631608/1‑93 (MQ=255) aGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCaa > 2:507995/1‑93 (MQ=255) cTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGGTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACa > 2:3296045/1‑93 (MQ=255) cATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACata < 2:4618024/93‑1 (MQ=255) cATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACata < 1:4262144/93‑1 (MQ=255) aTCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACatat < 1:3897270/93‑1 (MQ=255) tCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATAtt > 2:1631930/1‑93 (MQ=255) tCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATAtt < 1:4084616/93‑1 (MQ=255) tCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATAtt < 2:2059938/93‑1 (MQ=255) tCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATAtt > 1:397239/1‑93 (MQ=255) cTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTc < 1:3678418/93‑1 (MQ=255) aCGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCcac < 1:364827/93‑1 (MQ=255) aCGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCcac > 1:952719/1‑93 (MQ=255) gTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACaa < 2:1494335/93‑1 (MQ=255) gTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACaa < 1:3081251/93‑1 (MQ=255) tAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAAt > 1:3725095/1‑93 (MQ=255) aaGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCg > 2:2997717/1‑93 (MQ=255) agagCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGc > 2:4166146/1‑93 (MQ=255) gagCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCt < 2:4168306/93‑1 (MQ=255) cttttCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATTTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTc < 2:827421/91‑1 (MQ=255) ccTTTCATCTTTTGGCGGAAGGATTAACCCTGATGGTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTc > 1:2400500/1‑93 (MQ=255) cTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCa > 1:4100319/1‑93 (MQ=255) tttCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAg > 2:3487741/1‑93 (MQ=255) tttCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAg < 2:1226192/93‑1 (MQ=255) ttCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTTAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAgg > 1:4064329/1‑93 (MQ=255) ttCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAgg < 2:4423515/93‑1 (MQ=255) tCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGga > 2:222031/1‑93 (MQ=255) tCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGga < 2:3949158/93‑1 (MQ=255) tCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGga < 1:1575673/93‑1 (MQ=255) tCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGAGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGga < 2:2769478/93‑1 (MQ=255) gcATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGga > 2:4503956/2‑93 (MQ=255) cATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGgat < 2:818536/93‑1 (MQ=255) aTCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGgatg > 1:5122/1‑93 (MQ=255) aTCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGgatg < 1:4376228/93‑1 (MQ=255) tCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGgatga > 1:4574469/1‑93 (MQ=255) cTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGgatgat < 2:3818953/93‑1 (MQ=255) cTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGgatgat < 1:2128332/93‑1 (MQ=255) ttttGGCGAAAGGATTAACCCTGTTGCTTGGGGTCAATTAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTGAGGATGata > 2:2042784/1‑93 (MQ=255) ttttGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGata > 1:538588/1‑93 (MQ=255) tttGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGataa < 1:4480644/93‑1 (MQ=255) tttGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGataa > 2:2885890/1‑93 (MQ=255) ggCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAg < 1:4168511/93‑1 (MQ=255) ggCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGAGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAg < 1:497447/93‑1 (MQ=255) gCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGt < 1:3849865/93‑1 (MQ=255) cGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGtt < 1:3513251/93‑1 (MQ=255) gAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGttt < 2:4373394/93‑1 (MQ=255) gAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGttt < 1:1310210/93‑1 (MQ=255) aaaGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTg > 1:2551915/1‑93 (MQ=255) aaaGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTg > 2:4209999/1‑93 (MQ=255) aaaGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTg > 1:2551914/1‑93 (MQ=255) aaGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGt > 1:4316831/1‑93 (MQ=255) aGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTa < 1:663079/93‑1 (MQ=255) aGGATTAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTa < 2:2510601/93‑1 (MQ=255) gATTAACCCTGATGTTTGGGGCCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGt < 2:4329591/93‑1 (MQ=255) ttAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGttt < 2:2669083/93‑1 (MQ=255) ttAACCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGttt > 1:2350499/1‑93 (MQ=255) aCCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTtat > 1:1612031/1‑93 (MQ=255) aCCCTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTtat > 1:650686/1‑93 (MQ=255) cccTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTtata > 2:35883/1‑93 (MQ=255) ccTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTatat < 1:1070060/93‑1 (MQ=255) ccTGATGTTTGCGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTatat < 1:1063546/93‑1 (MQ=255) cTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATAtt > 2:3777269/1‑93 (MQ=255) cTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATAtt < 1:3323254/93‑1 (MQ=255) cTGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATAtt > 2:3041171/1‑93 (MQ=255) tGATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTg > 1:2391732/1‑93 (MQ=255) gATGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGa > 1:1060853/1‑93 (MQ=255) tGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGaaa > 1:1862399/1‑93 (MQ=255) tGTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGaaa > 2:2151947/1‑93 (MQ=255) gTTTGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAAt > 1:2880382/1‑93 (MQ=255) tttGGGGTCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAAtt < 1:1738618/93‑1 (MQ=255) | ATTCATGCAATTAATTTTAATCTGATAAGCTCATCTAACGTAAAGAGCCTTTCATCTTTTGGCGAAAGGATTAACCCTGATGTTTGGGGCCAATCAATTGCAATGCGTTCATCATTCCAACATATTCCACAATCGCTTTCAGGATGATAATAGTTTGTAGTTTTATATTGAAATTC > NC_000913/2107601‑2107776 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |