| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,559,003 | G→A | intergenic (+85/‑385) | b2443 → / → b2444 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,559,003 | 0 | G | A | 99.3% | 531.4 / ‑5.7 | 148 | intergenic (+85/‑385) | b2443/b2444 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (74/73); minor base T (0/1); total (74/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
AAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGG > NC_000913/2558913‑2559092 | aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATc > 2:4380257/1‑93 (MQ=255)aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTACATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATc > 1:2410765/1‑93 (MQ=255) aTAACGGACCTAGGCGGCCATTGTGCCCGCCTTGTCTTTGCCTTAATTCCATGAATGGAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaa < 2:3239033/93‑1 (MQ=255) tAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaaa > 1:2197336/1‑93 (MQ=255) aCGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAg > 1:4360930/1‑93 (MQ=255) cGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGt < 1:4019715/93‑1 (MQ=255) gAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTg < 1:2830624/93‑1 (MQ=255) aaTCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGc < 1:1097491/93‑1 (MQ=255) aaTCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGc < 1:2024984/93‑1 (MQ=255) aaTCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGc > 2:2101854/1‑93 (MQ=255) tCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCg < 1:3503633/93‑1 (MQ=255) cAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGt < 1:4060472/93‑1 (MQ=255) aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGtt > 1:2579795/1‑93 (MQ=255) ggCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTa > 2:183093/1‑93 (MQ=255) ggCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTa > 2:2520935/1‑93 (MQ=255) gCGGGCAATGTGCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTaa < 2:1129959/93‑1 (MQ=255) cGGTCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAg < 1:3857780/93‑1 (MQ=255) gggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAgg > 2:1444158/1‑93 (MQ=255) ggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGt > 1:24387/1‑93 (MQ=255) gCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg < 2:4029552/93‑1 (MQ=255) gCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg > 2:864440/1‑93 (MQ=255) cAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 2:3001476/93‑1 (MQ=255) cAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 2:1171658/93‑1 (MQ=255) cAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 1:1809853/93‑1 (MQ=255) cAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 2:766909/93‑1 (MQ=255) tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc > 2:3732124/1‑93 (MQ=255) tCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAANNTTGCCGTTAAGGTGGGTCnaa > 1:2232935/1‑93 (MQ=255) tCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaa > 1:2490704/1‑93 (MQ=255) cccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa < 1:1663512/93‑1 (MQ=255) ccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGTTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg < 2:1343285/93‑1 (MQ=255) gCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt < 2:40669/93‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGNATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTg < 2:704147/93‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTg < 1:2450825/93‑1 (MQ=255) ccTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTg < 1:3958121/93‑1 (MQ=255) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc > 2:1544422/1‑93 (MQ=255) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 2:2907209/93‑1 (MQ=255) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc > 2:2708949/1‑93 (MQ=255) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 1:1200847/93‑1 (MQ=255) ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc > 1:4470709/1‑93 (MQ=255) tttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 2:1625766/1‑93 (MQ=255) tttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:118210/1‑93 (MQ=255) tttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGCTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAAGTTGCCg > 2:334693/1‑93 (MQ=255) tCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt > 2:2813491/1‑93 (MQ=255) tttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa > 2:3255436/1‑93 (MQ=255) tttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa < 2:4249776/93‑1 (MQ=255) ttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg < 2:3583405/93‑1 (MQ=255) gCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt > 2:2637062/1‑93 (MQ=255) gCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 2:2328463/93‑1 (MQ=255) gCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 1:596340/93‑1 (MQ=255) gCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt < 2:3358789/93‑1 (MQ=255) ccTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg < 1:1148034/93‑1 (MQ=255) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg > 1:3167602/1‑93 (MQ=255) aaTTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc < 2:446498/93‑1 (MQ=255) aTTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCa > 1:3481540/1‑93 (MQ=255) ccATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa > 2:2100910/1‑93 (MQ=255) ccATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa > 1:1082139/1‑93 (MQ=255) ccATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa < 1:3958120/93‑1 (MQ=255) ccATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa > 1:4128614/1‑93 (MQ=255) cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTTCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg > 1:3264146/1‑93 (MQ=255) cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg > 1:3594388/1‑93 (MQ=255) tGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt < 2:1481357/93‑1 (MQ=255) tGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt < 2:460871/93‑1 (MQ=255) tGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt > 2:826215/1‑93 (MQ=255) tGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt > 2:3294405/1‑93 (MQ=255) aaTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc > 1:609705/1‑93 (MQ=255) aaTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 2:4262934/93‑1 (MQ=255) tCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGa > 2:3406730/1‑93 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGt < 2:3858301/93‑1 (MQ=255) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTa > 1:536192/1‑93 (MQ=255) gTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTaa < 1:833170/93‑1 (MQ=255) gTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTaa < 2:3128584/93‑1 (MQ=255) gTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGCaa < 1:4445434/93‑1 (MQ=255) tGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAg > 1:4547097/1‑93 (MQ=255) tGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAg < 2:2941775/93‑1 (MQ=255) gggTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGa > 2:3939004/1‑93 (MQ=255) ggTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGaa < 2:2423578/93‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAAt < 2:2538233/93‑1 (MQ=255) tCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAAtt > 1:4466188/1‑93 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTc > 1:3385321/1‑93 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTc < 1:2325354/93‑1 (MQ=255) aaaaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTct > 1:617589/1‑93 (MQ=255) aaaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTcta > 1:4546802/1‑93 (MQ=255) aGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctact > 2:4091246/1‑93 (MQ=255) aGTTGACGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctact > 1:4108108/1‑93 (MQ=255) gTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctacta < 2:3605261/93‑1 (MQ=255) ttGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTAt < 2:976846/93‑1 (MQ=255) ttGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTAt > 2:1993383/1‑93 (MQ=255) ttGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTAt < 1:3432868/93‑1 (MQ=255) ttGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGCTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTAt > 1:758765/1‑93 (MQ=255) ccGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTaa < 1:165613/93‑1 (MQ=255) cGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAg < 2:1128971/93‑1 (MQ=255) gTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGa > 2:601194/1‑93 (MQ=255) gTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGCGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGa > 1:3802996/1‑93 (MQ=255) ttAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGaa > 2:276587/1‑93 (MQ=255) tAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAAt < 1:1740613/93‑1 (MQ=255) ggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 1:3379111/93‑1 (MQ=255) ggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 1:2034995/93‑1 (MQ=255) ggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 1:1285556/93‑1 (MQ=255) gtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAg < 2:4595150/93‑1 (MQ=255) tggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAgg < 1:2303374/93‑1 (MQ=255) | AAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGG > NC_000913/2558913‑2559092 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |