Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,620,798 | Δ1 bp | intergenic (+255/+186) | ydeF → / ← ydeH | putative transport protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,620,795 | 0 | C | . | 99.4% | 796.7 / ‑3.5 | 176 | intergenic (+252/+189) | ydeF/ydeH | putative transport protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base . (86/89); total (87/89) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.27e-01 |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
CTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGAT > NC_000913/1620703‑1620883 | cTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGc < 1:1969604/93‑1 (MQ=255) tGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGcc > 2:2758020/1‑93 (MQ=255) gggAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGccc > 1:1584810/1‑93 (MQ=255) ggAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGccct > 2:1021094/1‑92 (MQ=255) gAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGccctt > 1:3009976/1‑91 (MQ=255) aataatTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGcccttg > 1:3417891/1‑90 (MQ=255) aataatTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGcccttg > 2:3320323/1‑90 (MQ=255) taatTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGtt > 1:4360846/1‑93 (MQ=255) taatTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGtt < 1:692203/93‑1 (MQ=255) taatTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGtt < 2:3797658/93‑1 (MQ=255) attttattttCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTAc < 1:2959687/93‑1 (MQ=255) ttttattttCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACa > 1:1534718/1‑93 (MQ=255) ttattttCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGt > 1:4515066/1‑93 (MQ=255) attttCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTtg > 2:2170438/1‑93 (MQ=255) ttttctggttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTtgt > 2:2630540/1‑93 (MQ=255) ttttctggttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTtgt < 2:4261519/93‑1 (MQ=255) ttttctggttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTtgt > 1:2642088/1‑93 (MQ=255) ttctggttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTgtgt > 1:2775820/1‑93 (MQ=255) ttctggttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTgtgt < 1:2484138/93‑1 (MQ=255) tctggttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTa < 2:183047/93‑1 (MQ=255) tctggttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTa < 2:4244157/93‑1 (MQ=255) ctggttttctggTCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTAc < 1:2311713/93‑1 (MQ=255) ctggttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTAc < 1:2597705/93‑1 (MQ=255) tggttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACa > 1:3409652/1‑93 (MQ=255) ggttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACaa > 2:1619392/1‑93 (MQ=255) ggttttctggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACaa > 1:3539756/1‑93 (MQ=255) tggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGcc > 2:4103865/1‑93 (MQ=255) tggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCt > 1:1058637/1‑93 (MQ=255) tggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCt > 2:4455939/1‑93 (MQ=255) tggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCt < 1:2351641/93‑1 (MQ=255) tggCCGCGTATTTCAGCCACAAAGGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCt < 2:3412894/93‑1 (MQ=255) ggCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTg > 1:2091806/1‑93 (MQ=255) cgcgTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGAtt > 1:3551955/1‑93 (MQ=255) cgcgTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGAtt > 1:1020922/1‑93 (MQ=255) gcgTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGAttt > 1:426382/1‑93 (MQ=255) gcgTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGAttt > 2:3204190/1‑93 (MQ=255) cgTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGAtttt < 1:2145349/93‑1 (MQ=255) cgTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGAtttt > 1:1313606/1‑93 (MQ=255) tATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTa < 1:24121/93‑1 (MQ=255) tATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTa < 2:3682961/93‑1 (MQ=255) tATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTa > 2:3962103/1‑93 (MQ=255) tATTTCAGCCACAAATGGGATAACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTa < 2:3479139/93‑1 (MQ=255) aTTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTAt < 1:1672758/93‑1 (MQ=255) aTTTAAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTAt < 1:2449281/93‑1 (MQ=255) tttCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATg > 2:899139/1‑93 (MQ=255) tttCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATg > 1:1851913/1‑93 (MQ=255) tttCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATg < 1:1960260/93‑1 (MQ=255) tttCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATg > 2:4669241/1‑93 (MQ=255) tttCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATg < 2:869919/93‑1 (MQ=255) ttCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGa > 1:1816604/1‑93 (MQ=255) tCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGAc < 1:843009/93‑1 (MQ=255) tCAGCCACAAATGAGATTACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTTATTTTTATGAc < 1:4239928/93‑1 (MQ=255) gCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGc < 1:4122237/93‑1 (MQ=255) cacaAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGa > 2:4160314/1‑93 (MQ=255) cacaAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGa < 1:2693153/93‑1 (MQ=255) aaaTGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGaaaa > 1:1947422/1‑93 (MQ=255) aTGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGaaaaaa > 1:4013597/1‑93 (MQ=255) aTGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGaaaaaa > 1:3245035/1‑93 (MQ=255) tGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGaaaaaaa < 2:2317716/93‑1 (MQ=255) gggATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGaaaaaaaa < 2:4299423/93‑1 (MQ=255) ggATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAAc < 1:3189682/93‑1 (MQ=255) gATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAAcc < 2:1082861/93‑1 (MQ=255) tGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCCCCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGc < 1:3506538/93‑1 (MQ=255) tGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATGTGTATGACGGCGAAAAAAAAACGc > 1:4254950/1‑93 (MQ=255) gACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGcc > 1:3589140/1‑93 (MQ=255) gACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGcc > 2:2464115/1‑93 (MQ=255) aCTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCa < 1:3306861/93‑1 (MQ=255) tAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGt < 2:1226116/93‑1 (MQ=255) aaTGAGCGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTa < 1:1952771/93‑1 (MQ=255) agAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTaaa < 2:1306869/92‑1 (MQ=255) aaCGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAAcc < 2:1656530/93‑1 (MQ=255) aaCGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAAcc > 2:2300177/1‑93 (MQ=255) aaCGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAAcc < 2:1516182/93‑1 (MQ=255) aCGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACcg < 2:3666289/93‑1 (MQ=255) aCGGAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACAGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACcg > 2:783861/1‑93 (MQ=255) ggAGATAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACcggc < 1:665322/93‑1 (MQ=255) agagaTAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACcggc < 1:4374269/92‑1 (MQ=255) agaTAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACcggcgg < 2:710772/93‑1 (MQ=255) gaTAATCCCTCCCCTACCCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGt < 2:1752970/93‑1 (MQ=255) gaTAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACcggcggg > 1:1192213/1‑92 (MQ=255) gaTAATCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGt < 2:631344/93‑1 (MQ=255) aaTCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGaa < 1:3842258/93‑1 (MQ=255) aaTCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGaa < 1:2870859/93‑1 (MQ=255) aaTCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGaa > 1:486291/1‑93 (MQ=255) aaTCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGaa < 1:1325326/93‑1 (MQ=255) aaTCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGGACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCCGTAAACCGGCGGCGaa > 1:4522217/1‑93 (MQ=255) tCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATg > 2:4555220/1‑93 (MQ=255) tCCCTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATg > 1:4694617/1‑93 (MQ=255) ccccTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATg < 2:3786582/92‑1 (MQ=255) ccTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGCAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCt > 2:2788762/1‑93 (MQ=255) ccTCACCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCt < 2:3099834/93‑1 (MQ=255) gccTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCa < 1:3695447/92‑1 (MQ=255) aCCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAGCCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCa > 2:4638051/1‑93 (MQ=255) aCCTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCa > 2:2986765/1‑93 (MQ=255) ccTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCAt > 1:2842308/1‑93 (MQ=255) cTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATg < 2:2842045/93‑1 (MQ=255) cTAACCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATg > 1:3161539/1‑93 (MQ=255) aaCCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGa > 1:1988276/1‑93 (MQ=255) aaCCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGa > 1:3502631/1‑93 (MQ=255) aCCGG‑CCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGAt > 2:1002576/1‑93 (MQ=255) | CTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCGAAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGAT > NC_000913/1620703‑1620883 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |