| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,951,168 | +G | coding (37/1818 nt) | ilvD → | dihydroxyacid dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,951,168 | 1 | . | G | 98.9% | 285.5 / NA | 91 | P13A (CCC→GCC) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); major base G (6/84); minor base A (0/1); total (6/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GG‑‑‑GC‑C‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAC > NC_000913/3951087‑3951248 | ggAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGaa < 2:1402579/93‑1 (MQ=255) gAGTAAATAAAGTATGCCTTAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAAt < 1:3958536/93‑1 (MQ=255) gAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAAt < 1:2914970/93‑1 (MQ=255) taaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑Ac < 2:4365174/93‑1 (MQ=255) aataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCg < 2:2438566/93‑1 (MQ=255) aataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGGATG‑AACg > 2:644878/1‑93 (MQ=255) ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGa < 1:4540475/93‑1 (MQ=255) taaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGG‑‑CACCCGGATG‑ACCGAc > 2:431994/1‑93 (MQ=255) taaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGAc < 2:1750617/93‑1 (MQ=255) aaaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGAc < 2:3896076/92‑1 (MQ=255) aaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGc < 1:383791/93‑1 (MQ=255) aaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGc < 2:4422611/93‑1 (MQ=255) aaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑TGGG‑‑‑GCGC‑‑CACCCGGATG‑ACCGACGc > 2:773959/1‑93 (MQ=255) aGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGcc < 1:665584/93‑1 (MQ=255) gTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCg < 2:3649671/93‑1 (MQ=255) tGCCTGAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGAtt < 2:4356974/93‑1 (MQ=255) tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGAtt < 1:3371048/93‑1 (MQ=255) tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGAtt < 1:1301257/93‑1 (MQ=255) gCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGAttt < 1:3493363/93‑1 (MQ=255) ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTc < 1:4273234/93‑1 (MQ=255) ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTc < 2:174317/93‑1 (MQ=255) cTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCg < 2:673744/93‑1 (MQ=255) cTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CCCCCGAAAG‑AACGACGCCGATCTCg > 2:2957748/1‑93 (MQ=255) tAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCgg < 2:36346/93‑1 (MQ=255) tAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCgg < 1:2166710/93‑1 (MQ=255) aaGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GG‑‑‑GG‑CGGCCCCGGAATG‑AACGACGCCGATTTTggg > 1:3796258/1‑92 (MQ=255) aaGCACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGt < 2:690816/93‑1 (MQ=255) gTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTC‑‑GTGGGCCGG‑G‑GG‑‑‑GCGC‑‑CACCGGGATT‑ACCCACCCCGCATTTGGTaa > 1:2731897/1‑93 (MQ=255) gTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑TGGG‑‑‑GCGC‑‑CACCCGAATG‑AACGACGCCGATTTTGGTaa > 2:2702989/1‑93 (MQ=255) gTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGATGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGtga < 1:4211938/93‑3 (MQ=255) tACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAg < 1:456917/93‑1 (MQ=255) aCCGTTCCGCCCCCCCCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGc < 1:1660226/93‑1 (MQ=255) ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCGC‑‑GTGCG‑CTG‑C‑GGC‑‑GCGC‑‑CCCCGGCATGAACCCAC‑CCCACTTCGGTAAGcc > 1:3469010/1‑93 (MQ=255) ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCCC‑‑GTGCG‑CCGCT‑GC‑‑‑GCGC‑‑CCCCGGGATG‑AACGACGCCCCTTTCTGGAAGcc > 2:3930541/1‑93 (MQ=255) cGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCg < 1:939762/93‑1 (MQ=255) cGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCg < 2:2154903/93‑1 (MQ=255) gTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGGAGG‑ACCGAAGCCGAATTCGGTAAAccca > 2:1346172/1‑91 (MQ=255) tCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAtt < 2:1651175/93‑1 (MQ=255) tCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTC‑‑CTGCG‑GGG‑G‑GGC‑‑GCGG‑‑CACCCGAAAG‑CCCGCCGCCCATTTCTGTAAGCCGCtt > 1:332267/1‑93 (MQ=255) tCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCCGGGGCG‑TTG‑G‑GG‑‑‑CG‑C‑‑CACCCGAATG‑ACCCACGCCGCTTTTGGGAAGGCggct > 1:1070240/1‑90 (MQ=255) ccGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTa < 2:3077173/93‑1 (MQ=255) cGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAt < 1:4013553/93‑1 (MQ=255) cGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAt < 2:1057164/93‑1 (MQ=255) gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 2:2558720/93‑1 (MQ=255) gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 1:3132281/93‑1 (MQ=255) gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 2:394816/93‑1 (MQ=255) ccaccaccaCTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcg < 2:517990/93‑1 (MQ=255) ccaccaccaCTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CCG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCCGAATG‑ACCGACCCCGAGTTCGGTAAGCCCGTTATcg > 2:336127/1‑93 (MQ=255) caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgc < 2:349303/93‑1 (MQ=255) caccaccacTCATGGGCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgc < 1:1234030/93‑1 (MQ=255) cccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgcg < 2:4278977/92‑1 (MQ=255) accaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGCGCGC‑C‑‑CCCCGGAA‑G‑AACGACGCCCATTTCGGTGAGACGACTATtgcg > 2:447684/1‑93 (MQ=255) caccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGt < 1:1642063/93‑1 (MQ=255) caccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGt < 2:2576553/93‑1 (MQ=255) caccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGt < 2:1255042/93‑1 (MQ=255) ccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTtg < 1:1445898/93‑1 (MQ=255) ccTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTtgtg < 2:3229987/92‑1 (MQ=255) acTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTtgtg < 2:4746821/93‑1 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGaa < 2:3961890/93‑1 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGaa < 1:2214470/93‑1 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGaa < 2:1798220/93‑1 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGaa < 1:3708829/93‑1 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGaa < 1:4117847/93‑1 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑TGGG‑‑‑GCGC‑‑CCCCCGGATG‑ACCGCCCCCCATTTTTGTTAGGCCATTTTCGCGGTtgtgta > 2:3027847/1‑91 (MQ=255) cATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAAc < 1:239765/93‑1 (MQ=255) cATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAAc < 2:4731679/93‑1 (MQ=255) aTGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACt < 2:2655115/93‑1 (MQ=255) tGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTc < 2:1769825/93‑1 (MQ=255) gTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGt < 1:2585324/93‑1 (MQ=255) gTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGt < 2:1554359/93‑1 (MQ=255) tCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGtt < 2:517264/93‑1 (MQ=255) cGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTc < 1:1539218/93‑1 (MQ=255) cGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTc < 2:1647658/93‑1 (MQ=255) atatGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCAccc < 2:2070869/93‑1 (MQ=255) tatGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCa < 2:3134200/93‑1 (MQ=255) atGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCaa < 1:1030812/93‑1 (MQ=255) atGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCaa < 1:2611960/93‑1 (MQ=255) tGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAt < 1:3296565/93‑1 (MQ=255) ggCGGTTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAtt < 1:1274847/93‑1 (MQ=255) ggCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAtt < 1:1274848/93‑1 (MQ=255) gCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAttt < 2:680811/93‑1 (MQ=255) gCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAttt > 2:572801/1‑93 (MQ=255) ggTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTa < 1:2504533/93‑1 (MQ=255) gTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTATAc < 1:3574851/93‑1 (MQ=255) gCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCg > 1:224926/1‑93 (MQ=255) gCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCg < 2:3627478/93‑1 (MQ=255) cTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg > 2:3708362/1‑93 (MQ=255) cTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg < 2:1396762/93‑1 (MQ=255) cTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg < 1:2247489/93‑1 (MQ=255) cTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg < 2:3020198/93‑1 (MQ=255) tC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCggg < 1:3843585/93‑1 (MQ=255) tC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCggg > 1:1463993/1‑93 (MQ=255) tC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCggg < 2:2866677/93‑1 (MQ=255) c‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGt < 1:2525995/93‑1 (MQ=255) c‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGt < 2:2813322/93‑1 (MQ=255) gTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc > 1:4733053/1‑93 (MQ=255) gTGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc < 1:1261020/93‑1 (MQ=255) tGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTATCGGGTCa > 2:2156924/1‑93 (MQ=255) tGCG‑CTG‑T‑GGC‑‑GCGC‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCa < 2:743695/93‑1 (MQ=255) gcg‑cTG‑T‑GGC‑‑GCAC‑‑CACCGAAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCaa < 2:4221021/93‑2 (MQ=255) | GGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTC‑‑GTGCG‑CTG‑T‑GG‑‑‑GC‑C‑‑CACCGGAATG‑ACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAC > NC_000913/3951087‑3951248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |