Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,013,772 | +C | intergenic (‑53/‑246) | ysgA ← / → udp | hypothetical protein/uridine phosphorylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,013,770 | 1 | . | C | 99.1% | 719.4 / ‑1.5 | 223 | intergenic (‑51/‑248) | ysgA/udp | hypothetical protein/uridine phosphorylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/2); new base C (152/69); total (152/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
GCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TA‑CC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT > NC_000913/4013679‑4013856 | gcgTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑Ta > 2:3765494/1‑93 (MQ=255) tcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TA‑ccc > 1:270754/1‑92 (MQ=255) gtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TA‑ccctt < 1:3373888/93‑4 (MQ=255) tcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TA‑ccctta > 2:4063267/1‑89 (MQ=255) cGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑Ttata < 1:661845/93‑1 (MQ=255) cGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑Ttata < 1:714881/93‑1 (MQ=255) ggggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATaa > 2:3050293/1‑93 (MQ=255) gTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATaaaaa > 1:4573368/1‑93 (MQ=255) tCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATACTCCG‑TACCC‑TTATAAAAAt < 1:1833007/93‑1 (MQ=255) tGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGt > 2:4706561/1‑93 (MQ=255) tGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGt < 1:1302379/93‑1 (MQ=255) gAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGtt < 2:3672498/93‑1 (MQ=255) gAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGtt > 1:304682/1‑93 (MQ=255) aaCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTg > 2:3322304/1‑93 (MQ=255) aaCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTg > 1:3252486/1‑93 (MQ=255) aCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTgc < 1:4681480/93‑1 (MQ=255) cGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTgcg > 2:866021/1‑93 (MQ=255) cGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTgcg > 1:2848262/1‑93 (MQ=255) cGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTgcg > 1:4087983/1‑93 (MQ=255) gATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTgcgc > 1:1691087/1‑93 (MQ=255) aTGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCa > 1:591642/1‑93 (MQ=255) tGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCaa < 1:3858395/93‑1 (MQ=255) tGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCaa < 2:2509035/93‑1 (MQ=255) cGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGtt < 1:1962191/93‑1 (MQ=255) gAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTa > 2:927779/1‑93 (MQ=255) gAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTa > 1:2122168/1‑93 (MQ=255) aaGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTaa > 2:2365956/1‑93 (MQ=255) aaGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTaa < 2:678451/93‑1 (MQ=255) aGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAAc > 1:3343340/1‑93 (MQ=255) aGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAAc > 2:585841/1‑93 (MQ=255) gCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt > 1:2314534/1‑93 (MQ=255) gCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTACG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt > 1:2501036/1‑93 (MQ=255) cGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACta < 2:1756195/93‑1 (MQ=255) gagaGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCGTGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACtat > 1:2224787/1‑93 (MQ=255) gagaGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACtat > 1:2873060/1‑93 (MQ=255) ggcgaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTc > 1:1576792/5‑93 (MQ=255) gcgaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCa < 2:3518780/90‑1 (MQ=255) cgaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAg < 2:1027481/91‑1 (MQ=255) gaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGc > 1:3976042/2‑93 (MQ=255) gaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGc < 1:3607413/92‑1 (MQ=255) aTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCa > 1:4150483/1‑93 (MQ=255) tGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCAt > 1:775412/1‑93 (MQ=255) tGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCAt < 1:4406890/93‑1 (MQ=255) tGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCAt > 1:3452574/1‑93 (MQ=255) gcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaa > 2:319912/1‑93 (MQ=255) gcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaa > 2:1980118/1‑93 (MQ=255) agGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaaca > 1:4583659/1‑93 (MQ=255) gTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACaaa < 2:1708425/93‑1 (MQ=255) tGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAAt > 2:2888042/1‑93 (MQ=255) gCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATc < 1:552186/93‑1 (MQ=255) gCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATc > 2:3989500/1‑93 (MQ=255) gCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATc > 1:1936896/1‑93 (MQ=255) gCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATc < 1:2520375/93‑1 (MQ=255) aaaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcac < 2:1576771/93‑1 (MQ=255) aaaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcac > 1:4708904/1‑93 (MQ=255) aTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAt < 1:4449831/93‑1 (MQ=255) aTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAt > 2:4540760/1‑93 (MQ=255) aTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAt < 1:1445620/93‑1 (MQ=255) aTCCAGATGGTGTTGTTGTTGCCATGGTATTCGCCG‑TA‑CCTTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAt < 1:2180146/93‑1 (MQ=255) tCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAtt < 1:2661801/93‑1 (MQ=255) tCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAtt < 2:1149504/93‑1 (MQ=255) tCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAtt > 1:1761813/1‑93 (MQ=255) tCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAtt > 1:3886520/1‑93 (MQ=255) ccAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTg > 1:1124094/1‑93 (MQ=255) ccAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTg < 2:2035853/93‑1 (MQ=255) ccAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTg > 1:1099124/1‑93 (MQ=255) cAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGc > 2:3543754/1‑93 (MQ=255) aGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGcc < 2:1549401/93‑1 (MQ=255) aGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGcc > 1:1655668/1‑93 (MQ=255) aGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGcc < 1:3787314/93‑1 (MQ=255) gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCt > 2:616327/1‑93 (MQ=255) gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCt > 1:1661645/1‑93 (MQ=255) gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAAAAAATCACATTGCCt > 1:3225397/1‑93 (MQ=255) ttgttgTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGa > 2:302326/1‑93 (MQ=255) tgttgtgttgTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGaa < 2:3976042/93‑1 (MQ=255) tgttgtgttgTTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGaa > 1:4030325/1‑93 (MQ=255) gttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAAt > 2:4601267/1‑93 (MQ=255) ttgCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATc < 2:4358446/93‑1 (MQ=255) tgCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCt < 2:1204926/93‑1 (MQ=255) tgCCATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCt < 2:1942621/93‑1 (MQ=255) ccATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCttt > 2:3846537/1‑93 (MQ=255) cATGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCtttt > 2:3216278/1‑93 (MQ=255) aTGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAGTCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTa > 1:3677321/1‑93 (MQ=255) tGGTATTCTCCGTTC‑CC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt < 2:4128341/93‑1 (MQ=255) tGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt > 2:540824/1‑93 (MQ=255) tGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt > 2:124880/1‑93 (MQ=255) tGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt < 1:2859697/93‑1 (MQ=255) tGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt > 2:4456755/1‑93 (MQ=255) tGGTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt > 1:4277446/1‑93 (MQ=255) ggTATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATg > 2:1637555/1‑93 (MQ=255) tATTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCa > 2:1439051/1‑93 (MQ=255) aTTCTCCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAg > 1:882054/1‑93 (MQ=255) tctcCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTc > 2:346947/1‑93 (MQ=255) tctcCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTc > 2:1001193/1‑93 (MQ=255) tctcCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTc > 1:3146268/1‑93 (MQ=255) ctcCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCTCATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTcc < 1:840947/93‑1 (MQ=255) ctcCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTcc < 2:2146450/93‑1 (MQ=255) tcCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCt > 1:2276896/1‑93 (MQ=255) tcCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCt > 2:3378643/1‑93 (MQ=255) tcCG‑TACCC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCt > 2:1385462/1‑93 (MQ=255) | GCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCG‑TA‑CC‑TTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT > NC_000913/4013679‑4013856 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |