| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,315,907 | +A | coding (436/759 nt) | phnK ← | ATP‑binding component of phosphonate transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,315,903 | 1 | . | A | 96.2% | 441.4 / 7.1 | 130 | coding (440/759 nt) | phnK | ATP‑binding component of phosphonate transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/1); new base A (67/58); total (71/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
CATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑A‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCG > NC_000913/4315811‑4315989 | cttCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACCCCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCgg < 1:1874527/91‑1 (MQ=255) tCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑a‑a > 2:3237155/1‑93 (MQ=255) cAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑a‑a‑aa < 1:1757653/93‑1 (MQ=255) gCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑a‑a‑aaag < 1:1641452/93‑3 (MQ=255) ccgccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑a‑a‑aaaggg > 1:191021/1‑89 (MQ=255) gccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAggtgg > 1:4495738/1‑93 (MQ=255) cggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTc < 1:328812/93‑1 (MQ=255) cggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTc < 1:4595130/93‑1 (MQ=255) cggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTc < 2:2863958/93‑1 (MQ=255) ggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCg < 1:882637/93‑1 (MQ=255) ggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCg > 2:1487792/1‑93 (MQ=255) gtcgttACATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCgg < 2:3186016/93‑1 (MQ=255) tcggtTCATCCATAAACCCCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGc < 2:1816609/93‑1 (MQ=255) ggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAg > 2:1501497/1‑93 (MQ=255) gtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑AGA‑AAGGTGGTCGGCAgg > 1:3202754/1‑93 (MQ=255) ttCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCTGGCAATCTGCAAACGCTGCTGAATCCCGCGGG‑A‑A‑AAGGGGGTCGGCCggcg > 1:3913958/1‑91 (MQ=255) ttCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGgt < 1:4581093/93‑1 (MQ=255) ttCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGGTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGGCGGCAGgt > 2:1601899/1‑93 (MQ=255) tCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGgtc < 2:1624370/93‑1 (MQ=255) tCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGgtc < 2:2310075/93‑1 (MQ=255) cATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGgtcg < 2:3246590/93‑1 (MQ=255) cATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGgtcg < 1:2069885/93‑1 (MQ=255) aTCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGgtcgt > 1:3924557/1‑93 (MQ=255) aTCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGgtcgt > 2:3448979/1‑93 (MQ=255) aTCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGgtcgt < 2:1461768/93‑1 (MQ=255) tCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGgtcgtc < 2:3377322/93‑1 (MQ=255) accATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGgtcgtc < 2:3940608/92‑1 (MQ=255) ccATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGtcgtcg > 1:2515816/1‑93 (MQ=255) ccATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGtcgtcg > 1:1769439/1‑93 (MQ=255) cATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGa > 2:2122466/1‑93 (MQ=255) cATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGa < 1:2121277/93‑1 (MQ=255) aTAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGAt < 1:4019577/93‑1 (MQ=255) tAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATc > 2:3964713/1‑93 (MQ=255) aaaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATcc > 2:223438/1‑93 (MQ=255) aaaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGGGGTCGGCAGGTCGTCGATcc > 2:3830164/1‑93 (MQ=255) cccAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGtt < 1:506558/92‑1 (MQ=255) acCAGCTACGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGtt < 2:3186451/93‑1 (MQ=255) cAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTTCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTgg > 1:2912713/1‑93 (MQ=255) cAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTgg > 1:1046622/1‑93 (MQ=255) cAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTgg > 1:3598966/1‑93 (MQ=255) aGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGc > 2:2628282/1‑93 (MQ=255) gCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCg > 1:243932/1‑93 (MQ=255) ttCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCggg > 1:1210285/1‑93 (MQ=255) ttCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCggg > 1:3202855/1‑93 (MQ=255) ttCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCggg < 1:2274033/93‑1 (MQ=255) ttCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCggg > 2:482944/1‑93 (MQ=255) tCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGa < 2:688071/93‑1 (MQ=255) tCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGa < 1:2679006/93‑1 (MQ=255) cGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGaa < 1:4444220/93‑1 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc > 1:2181011/1‑93 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACAGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc > 1:1124756/1‑93 (MQ=255) tGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtctc > 2:3724025/1‑93 (MQ=255) gCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTcc < 2:1025127/93‑1 (MQ=255) gTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCAc > 2:2888252/1‑93 (MQ=255) gTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCAc < 1:4347476/93‑1 (MQ=255) cACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACct > 1:1061177/1‑93 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc > 1:1605258/1‑93 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc > 1:4746524/1‑93 (MQ=255) ccAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctct < 2:1911538/93‑1 (MQ=255) ccAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctct < 1:743374/93‑1 (MQ=255) aGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTc < 2:932331/93‑1 (MQ=255) ggTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTcc > 1:3977388/1‑93 (MQ=255) ttGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAg > 1:3131187/1‑93 (MQ=255) tGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCAATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGc > 1:4583355/1‑93 (MQ=255) gCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGcc < 2:287754/93‑1 (MQ=255) gCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGcc < 1:979126/93‑1 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTTCATACCGCCGG‑A‑AGAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATTTCCACCTCTTCCCGCCaa > 1:851001/1‑92 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCAc < 1:930716/93‑1 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCAc > 1:3803620/1‑93 (MQ=255) ggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATGCCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACt < 1:1208647/93‑1 (MQ=255) aaTCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCt > 2:2650593/1‑93 (MQ=255) aaTCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCt < 1:3953216/93‑1 (MQ=255) aaTCTGCAAACGCTGCTCCATCCCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGGCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCt < 1:3953217/93‑1 (MQ=255) aTCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTg > 2:3295919/1‑93 (MQ=255) aTCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTg > 2:1306290/1‑93 (MQ=255) tCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCATCCACTTCTgc > 1:4581338/1‑93 (MQ=255) tGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTgcgc > 2:1726711/1‑93 (MQ=255) cAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCgg < 2:1058197/93‑1 (MQ=255) cAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCgg < 2:4565739/93‑1 (MQ=255) aaaCGCTGCTGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGt > 1:2808571/1‑93 (MQ=255) gctgctGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGTTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCa > 1:1722728/1‑93 (MQ=255) gctgctGCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCCCTTCTGCGCCGTggta > 2:4070643/1‑91 (MQ=255) gtgctgcATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCAc < 1:2009222/92‑1 (MQ=255) ctgctgCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCAc < 1:2009223/93‑1 (MQ=255) ctgctgCATACCGCCGGAA‑A‑AAGGGGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCAACCTCTTCCAGCCACTTATGCGCGGTGGCAc > 2:3619990/1‑93 (MQ=255) tgctgcATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCGCCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACg > 1:2614681/1‑93 (MQ=255) tgctgcATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACg > 2:1059583/1‑93 (MQ=255) gctgcATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGa > 2:1492231/1‑93 (MQ=255) ctgcATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGaa < 2:4124634/93‑1 (MQ=255) ctgcATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCCGTGCGACGaa > 1:3088585/1‑93 (MQ=255) tgcATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAat > 2:1226975/1‑93 (MQ=255) tgcATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAat > 2:1693585/1‑93 (MQ=255) tgcATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAat > 2:1276199/1‑93 (MQ=255) gcATCCCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata < 1:2695167/93‑1 (MQ=255) gcATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata > 1:4614003/1‑93 (MQ=255) cATACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAatat < 1:4629987/93‑1 (MQ=255) aTACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCGCCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATc < 1:2102426/93‑1 (MQ=255) aTACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATc > 1:4615404/1‑93 (MQ=255) tACCGCCGGAA‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCg > 2:4729270/1‑93 (MQ=255) ccgccgG‑A‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCg > 2:3993813/1‑93 (MQ=255) | CATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑A‑A‑AAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCG > NC_000913/4315811‑4315989 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |