BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	3,025,676	+C	coding (535/570 nt)	ygfQ →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	3,025,675	1	.	C	99.3%	469.5 / ‑5.6	144	L178F (TTG→TTC)	ygfQ	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); major base C (76/66); minor base T (1/0); total (77/67)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 155 total aligned reads displayed.

GCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑CAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGC  >  NC_000913/3025583‑3025761

gCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTCATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑g                                                                                         >  2:4611670/1‑93 (MQ=255)

  tCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑cc                                                                                      >  2:4228439/1‑92 (MQ=255)

   cACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑cca                                                                                     <  1:1178276/93‑3 (MQ=255)

   cACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑cca                                                                                     <  2:1648316/93‑3 (MQ=255)

    ccGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑ccag                                                                                    <  2:4112608/92‑4 (MQ=255)

    aCGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑ccag                                                                                    >  1:270651/1‑90 (MQ=255)

       gTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTgg                                                                                  >  1:2149415/1‑93 (MQ=255)

       gTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTgg                                                                                  <  1:4370617/93‑1 (MQ=255)

       gTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTgg                                                                                  >  2:1341778/1‑93 (MQ=255)

       gTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGCGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTgg                                                                                  >  1:2149414/1‑93 (MQ=255)

        tACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGgc                                                                                 <  1:3651527/93‑1 (MQ=255)

        tACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGgc                                                                                 <  1:3585646/93‑1 (MQ=255)

           agatatcggcatcggACTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCt                                                                              <  2:2282308/90‑1 (MQ=255)

             gtatcggcatcgGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCg                                                                            >  2:4445692/1‑93 (MQ=255)

               atcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCggg                                                                          >  2:879529/1‑92 (MQ=255)

               atcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGt                                                                          <  2:1366171/93‑1 (MQ=255)

               atcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGt                                                                          <  2:2368754/93‑1 (MQ=255)

               atcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGt                                                                          >  2:3390376/1‑93 (MQ=255)

                tcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTg                                                                         <  2:2769924/93‑1 (MQ=255)

                tcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTg                                                                         >  2:3841116/1‑93 (MQ=255)

                 cggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCTATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGc                                                                        <  2:3233778/93‑1 (MQ=255)

                 cggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGc                                                                        <  2:374813/93‑1 (MQ=255)

                  ggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCg                                                                       <  1:4499647/90‑1 (MQ=255)

                   gcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGt                                                                      <  2:3227740/91‑1 (MQ=255)

                    catcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGtt                                                                     <  2:2109440/92‑1 (MQ=255)

                    catcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGtt                                                                     <  2:1502391/92‑1 (MQ=255)

                    catcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGtt                                                                     <  2:1043862/92‑1 (MQ=255)

                      tcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTa                                                                   <  2:2610183/93‑1 (MQ=255)

                      tcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTa                                                                   >  1:4716894/1‑93 (MQ=255)

                        gggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcc                                                                 <  2:2189986/93‑1 (MQ=255)

                        gggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcc                                                                 >  2:3650278/1‑93 (MQ=255)

                         ggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcct                                                                <  2:2418144/93‑1 (MQ=255)

                           cTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCATTGGCGCTCGGTGCGTTTtcctcc                                                              >  2:4342580/1‑93 (MQ=255)

                           cTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctct                                                              >  1:3256024/1‑92 (MQ=255)

                           cTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctcc                                                              >  2:3668512/1‑93 (MQ=255)

                           cTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctcc                                                              >  1:1703343/1‑93 (MQ=255)

                              tttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTc                                                           >  1:2881793/1‑93 (MQ=255)

                              tttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTc                                                           >  2:4038016/1‑93 (MQ=255)

                              tttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTc                                                           >  2:2256429/1‑93 (MQ=255)

                              tttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTc                                                           >  2:72062/1‑93 (MQ=255)

                              tttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTc                                                           >  2:160210/1‑93 (MQ=255)

                               ttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTcc                                                          <  2:3459001/93‑1 (MQ=255)

                               ttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTcc                                                          <  2:4744408/93‑1 (MQ=255)

                                  tgctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCgg                                                       >  1:2523456/1‑93 (MQ=255)

                                     tgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtga                                                    >  2:3009279/1‑93 (MQ=255)

                                     tgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtga                                                    >  2:3009280/1‑93 (MQ=255)

                                      gctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgat                                                   <  2:142236/93‑1 (MQ=255)

                                      gctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgat                                                   >  2:4332198/1‑93 (MQ=255)

                                       ctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatg                                                  >  2:817556/1‑93 (MQ=255)

                                        tgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatga                                                 >  1:971342/1‑93 (MQ=255)

                                        tgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatga                                                 <  2:2174581/93‑1 (MQ=255)

                                           ttGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAACCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTGCCTCCTTCCCGGtgatgatga                                              <  1:4229990/93‑1 (MQ=255)

                                           ttGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatgatga                                              <  2:3918440/93‑1 (MQ=255)

                                             gctgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGc                                            >  1:3443451/1‑93 (MQ=255)

                                              ctgctAACGTTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCt                                           <  1:1698617/93‑1 (MQ=255)

                                              ctgctAACGGTGTGGGTATTGTTATCAATAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCt                                           <  2:1103176/93‑1 (MQ=255)

                                              ctgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCt                                           >  1:1743800/1‑93 (MQ=255)

                                                gctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGCGCGTGTACCTCCTCCCCGGGGATGATGAGCtgg                                         >  1:4225851/1‑91 (MQ=255)

                                                 ctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGc                                        >  2:3996942/1‑93 (MQ=255)

                                                  tAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCt                                       >  1:2619863/1‑93 (MQ=255)

                                                  tAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCt                                       >  1:2781978/1‑93 (MQ=255)

                                                  tAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGGGCTGATGAGCTTGCt                                       >  2:908847/1‑93 (MQ=255)

                                                   aaCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTg                                      >  2:230064/1‑93 (MQ=255)

                                                    aCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgg                                     >  1:3173028/1‑93 (MQ=255)

                                                    aCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgg                                     <  2:700973/93‑1 (MQ=255)

                                                    aCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgg                                     <  1:903627/93‑1 (MQ=255)

                                                      ggTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgggg                                   >  1:1083885/1‑93 (MQ=255)

                                                      ggTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgggg                                   >  2:2902627/1‑93 (MQ=255)

                                                         gtgGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTg                                <  2:4316777/93‑1 (MQ=255)

                                                           gggTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGc                              >  1:2662010/1‑93 (MQ=255)

                                                              tATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGt                           >  1:4639042/1‑93 (MQ=255)

                                                              tATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGt                           >  1:77146/1‑93 (MQ=255)

                                                                 ggTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCAt                        >  1:830824/1‑93 (MQ=255)

                                                                  gTTATCAAAAACCCGATTGAATGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTATCTGCTTCCCGGTGATGATGTGCTTGCTGGGCCTGGCGGGCAtt                       >  1:3402912/1‑92 (MQ=255)

                                                                  gTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATc                       <  2:930865/93‑1 (MQ=255)

                                                                   ttATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCTCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCt                      >  2:2976646/1‑93 (MQ=255)

                                                                    tATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGG‑CAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGGTGGGGCTGGCGGTCATCtt                     <  1:198601/93‑1 (MQ=255)

                                                                    tATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCtt                     >  2:908353/1‑93 (MQ=255)

                                                                      tCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCg                   <  1:4222111/93‑1 (MQ=255)

                                                                      tCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCg                   >  1:3015452/1‑93 (MQ=255)

                                                                       cAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCgg                  >  1:3474021/1‑93 (MQ=255)

                                                                       cAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCgg                  <  1:1337459/93‑1 (MQ=255)

                                                                       cAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCAGTCATCTTCgg                  <  2:3175568/93‑1 (MQ=255)

                                                                        aaaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGc                 >  1:1138947/1‑93 (MQ=255)

                                                                        aaaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGc                 <  2:473330/93‑1 (MQ=255)

                                                                         aaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGcc                >  2:1970776/1‑93 (MQ=255)

                                                                         aaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGcc                >  2:1752071/1‑93 (MQ=255)

                                                                           aaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTg              >  2:3411111/1‑93 (MQ=255)

                                                                             cccGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGga            <  1:2946027/93‑1 (MQ=255)

                                                                               cGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGgaga          >  2:1344550/1‑93 (MQ=255)

                                                                                gATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGaa         >  2:138033/1‑93 (MQ=255)

                                                                                gATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGaa         >  1:3674268/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAg        <  2:4137050/93‑1 (MQ=255)

                                                                                   tGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAgtg      >  2:2057222/1‑93 (MQ=255)

                                                                                   tGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAgtg      <  2:1936530/93‑1 (MQ=255)

                                                                                    gAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGGCATCTTCGGCCTGGAGAAgtgt     >  2:3550865/1‑93 (MQ=255)

                                                                                      aGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTcg   <  2:2783531/93‑1 (MQ=255)

                                                                                      aGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTcg   <  2:4522820/93‑1 (MQ=255)

                                                                                       ggCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGGGAAGGGTcgc  >  2:2073757/1‑93 (MQ=255)

                                                                                       ggCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTcgc  >  1:934573/1‑93 (MQ=255)

GCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑CAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGC  >  NC_000913/3025583‑3025761

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 20 ≤` `ATCG/ATCG` `< 28 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`