| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,237,242 | +C | intergenic (+55/‑342) | ygjT → / → ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,237,240 | 1 | . | C | 98.1% | 328.7 / ‑0.6 | 106 | intergenic (+53/‑344) | ygjT/ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (83/21); total (84/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑C‑CTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAA > NC_000913/3237148‑3237326 | cTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct > 1:3632943/1‑93 (MQ=255)cTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct > 1:3763233/1‑93 (MQ=255) tGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑c > 1:4374598/1‑93 (MQ=255) tGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑c > 2:4548551/1‑93 (MQ=255) tGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑c > 2:4548550/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑c‑c > 1:1053353/1‑93 (MQ=255) gTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTCCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑c‑cct < 2:1381272/93‑3 (MQ=255) gTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑c‑cct < 1:3441473/93‑3 (MQ=255) tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGGGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑c‑cctc > 2:4117357/1‑90 (MQ=255) gAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑c‑cctct < 2:2818688/93‑5 (MQ=255) gAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTtct‑c‑cctct > 2:2661292/1‑89 (MQ=255) tATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTctcc‑ctct‑ccct < 2:1247106/93‑3 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCa < 1:2696623/93‑1 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCa < 1:2556084/93‑1 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAg > 1:945656/1‑93 (MQ=255) cATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAgg < 1:955951/93‑1 (MQ=255) aTGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAggg > 2:3369668/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGga > 1:4634464/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGga > 1:433805/1‑93 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGgag > 1:398001/1‑93 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGgaga > 2:3769212/1‑93 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGgaga < 2:218676/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGgaga < 2:1980432/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGgaga < 2:858710/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCAGTGTCCCTTGTCATTAACATGAGCACTGTTTTCT‑CGCTCTCCCTTCCAGGgaga < 2:2879408/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag < 2:1822063/93‑1 (MQ=255) aaGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAgg > 2:1720809/1‑93 (MQ=255) aaGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAgg < 1:462960/93‑1 (MQ=255) aaGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAgg > 1:3964500/1‑93 (MQ=255) aaGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAgg > 2:1737577/1‑93 (MQ=255) agcagcGGGGTGTATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAggg < 1:4590460/93‑1 (MQ=255) agcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAggg > 1:3346257/1‑93 (MQ=255) acagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 1:2479151/92‑1 (MQ=255) cagcGGGGTTGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTc < 1:1593871/93‑1 (MQ=255) agcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCTTAAGCCGTGTCCCCTGTAATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTCCCAGGGAGAGGGTCg < 2:3200274/93‑1 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgg > 1:3961212/1‑93 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgg < 1:259848/93‑1 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCATGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgg < 2:3049855/93‑1 (MQ=255) cGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggg > 2:3604457/1‑93 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg > 1:1743529/1‑93 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg > 2:1150850/1‑93 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg > 2:3286862/1‑93 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg > 1:4721048/1‑93 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt > 1:3609969/1‑93 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt < 1:1416393/93‑1 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt < 2:2830424/93‑1 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg > 2:1791271/1‑93 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTgg > 1:1175132/1‑92 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa > 2:1870028/1‑93 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa > 2:1870027/1‑93 (MQ=255) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTCCTCTGTCATTAACAGGAGCTCCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAgg < 1:434105/93‑1 (MQ=255) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg > 2:2741843/1‑93 (MQ=39) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg > 2:633703/1‑93 (MQ=39) gATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCACTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAggg > 1:86581/1‑93 (MQ=38) tAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTCCCCTGTCATTAACATGAGAACTGTTTTCT‑CACTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTa > 2:3053686/1‑93 (MQ=255) tAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTa > 2:4008538/1‑93 (MQ=38) aTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAt > 2:2889382/1‑93 (MQ=38) aTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAt > 1:3256862/1‑93 (MQ=38) tttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtt > 1:71973/1‑93 (MQ=38) tttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtt > 1:1354721/1‑93 (MQ=38) tttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtt > 2:4314664/1‑93 (MQ=38) tttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtttt > 2:98389/1‑93 (MQ=38) tAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGGAATTTTTc > 2:1719192/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCAcc > 1:2135084/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCAcc > 1:337567/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAGGGTAATTTTTCGCAcc > 2:1154310/1‑93 (MQ=38) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCg > 2:1866931/1‑93 (MQ=38) ccTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGa > 2:4177778/1‑93 (MQ=38) cTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGAt > 2:4658097/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 2:962645/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 2:1187056/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 1:283194/1‑93 (MQ=38) aaGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGc > 2:856789/1‑93 (MQ=37) aaGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGc > 1:475358/1‑93 (MQ=38) ccGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTgg > 2:144991/1‑93 (MQ=37) gtttACCCTGTCATTAACATGAGCCCCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGCTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc < 1:1899231/90‑1 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc > 1:1450786/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:3695587/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 2:160641/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:16661/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:2026034/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:2415692/1‑93 (MQ=37) gtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 1:25592/1‑93 (MQ=37) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGt > 1:3481402/1‑93 (MQ=37) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGCGAGGGGAAGTTTTCGCACCGATGCTGGCCTgg > 2:2601887/1‑92 (MQ=37) ccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcc > 2:1663690/1‑93 (MQ=37) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTtcc > 2:3644563/1‑93 (MQ=25) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTtcc > 2:4726721/1‑93 (MQ=37) aTTAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccccccc > 1:2883822/1‑89 (MQ=25) aTTAACACGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAc > 1:2468128/1‑93 (MQ=21) tAACATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACTGATGCTGGCCTGTTCTCCTCAccc > 1:4261557/1‑93 (MQ=25) aaCATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCccccccccc > 1:1915179/1‑92 (MQ=25) aCATGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGGAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCCCAcccca > 2:2120579/1‑91 (MQ=25) aTGAGCACCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccccccccccctc > 2:377361/1‑89 (MQ=21) aCCGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCCCCCCCCCACCCcctc > 2:1090720/1‑93 (MQ=21) cGTTTTCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGGCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCCTACCCTCTccc > 1:248268/1‑93 (MQ=17) ttttCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCa > 1:2220668/1‑93 (MQ=18) ttttCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCa > 1:3985344/1‑93 (MQ=17) tttCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTccccca > 2:1460293/1‑91 (MQ=17) tttCTCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCaa > 1:407509/1‑93 (MQ=17) | CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCT‑C‑CTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAA > NC_000913/3237148‑3237326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |