| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3156256 | 1 (0.010) | 241 (1.370) | 118/178 | 0.0 | 99.6% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 3156260 = | 1 (0.010) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
AAAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3156162‑3156256‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATC > NC_000913/3156260‑3156351 AAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCC < 1:4268796/93‑1 AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGCCGTGGGTGGTTTCCGCCTCTTACCGCCA < 2:55606/93‑1 GAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAG < 1:819036/93‑1 GAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAG < 1:444204/93‑1 GAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAG < 1:2850674/93‑1 AGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTCTAGCTCGCCGTGGCCGTGGTTGGTTTGCGACTCTTAGCGACAGGCGG > 1:419029/1‑93 AGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGG > 2:90600/1‑93 AGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGG < 1:4291609/93‑1 AGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGG > 1:3126860/1‑93 CGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTA > 2:1005485/1‑93 GGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAA < 1:1610420/93‑1 GGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAA > 1:3374763/1‑93 GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAAT < 2:3181773/93‑1 GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAAT > 2:4025214/1‑93 GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAAT > 1:1765136/1‑93 AAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATG > 1:2923731/1‑93 AAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAAAATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATG > 2:3803012/1‑93 AGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCGGGCGGTTAATGC > 2:3538875/1‑93 AGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGC < 1:4058430/93‑1 GCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCC > 1:3346120/1‑93 TTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTC > 1:1028559/1‑93 TTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTC > 2:2705715/1‑93 TTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTC < 1:1464458/93‑1 TGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTA < 1:3869624/93‑1 TTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATA > 1:1199307/1‑93 TTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATA < 2:4735293/93‑1 TGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAA < 2:392352/93‑1 TGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAA > 2:1462269/1‑93 GCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGGGGGTTGCGTCTCTTACAGCCAGGCGGTTAATGACTTCTATAAA > 2:3584175/1‑93 CCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAA > 1:2234223/1‑93 GAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC > 2:2104050/1‑93 ACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCAC > 1:3966076/1‑93 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TTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCA < 2:4339478/93‑1 AACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGA < 2:464659/93‑1 ACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAC > 1:2774242/1‑93 ACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTACGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAC > 1:2744919/1‑93 ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGG > 1:304937/1‑93 TGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAA < 1:2029462/93‑1 GATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAAT < 1:1542712/93‑1 GATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAAT > 2:1648606/1‑93 TTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCC > 1:3226570/1‑93 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |