| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 1 (0.010) | 260 (1.480) | 129/178 | 0.0 | 72.5% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 196 (1.120) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
GGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAT > NC_000913/365435‑365619 | gcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaac > 1:2355231‑M1/93‑93 (MQ=255)gcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaac > 1:744970‑M1/93‑93 (MQ=255) attaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCAt > 2:2533029‑M1/91‑93 (MQ=255) ttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATa > 2:72780‑M1/90‑93 (MQ=255) ttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATa < 1:3680947‑M1/4‑1 (MQ=255) ttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATa < 2:2565102‑M1/4‑1 (MQ=255) ttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATa > 1:4712714‑M1/90‑93 (MQ=255) taaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAg < 1:4370279‑M1/5‑1 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGc > 2:1833200‑M1/88‑93 (MQ=255) agaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTg > 1:207667‑M1/86‑93 (MQ=255) agaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTg < 1:573549‑M1/8‑1 (MQ=255) aacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGtt < 1:1903059‑M1/10‑1 (MQ=255) acagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGttt < 1:3563590‑M1/11‑1 (MQ=255) acagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGttt < 1:2687829‑M1/11‑1 (MQ=255) cagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTc < 2:185898‑M1/12‑1 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTcc > 1:292162‑M1/81‑93 (MQ=255) gaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCt > 1:1461851‑M1/80‑93 (MQ=255) gaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCt < 2:4183030‑M1/14‑1 (MQ=255) gaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGATGTTTCCt < 2:2080110‑M1/14‑1 (MQ=255) accgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtg < 1:3242580‑M1/15‑1 (MQ=255) ccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgt < 2:1781024‑M1/16‑1 (MQ=255) cgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtcagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtg > 1:1151487‑M1/77‑93 (MQ=255) cgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtg > 1:1115696‑M1/77‑93 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgt < 1:4417235‑M1/18‑1 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgt < 1:2645205‑M1/18‑1 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaatttcgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgt > 1:4633799‑M1/76‑93 (MQ=255) cctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgtg < 1:428975‑M1/19‑1 (MQ=255) ctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGa < 1:1346404‑M1/20‑1 (MQ=255) tgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaa > 1:1313802‑M1/73‑93 (MQ=255) gatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaaa > 1:2300434‑M1/72‑93 (MQ=255) atgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAt > 2:2039566‑M1/71‑93 (MQ=255) tgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAtt < 2:4441728‑M1/24‑1 (MQ=255) gtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTg < 2:1514756‑M1/25‑1 (MQ=255) gtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTg > 1:3274324‑M1/69‑93 (MQ=255) tcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt > 2:1225471‑M1/68‑93 (MQ=255) cagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGtt < 1:4236964‑M1/27‑1 (MQ=255) agttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa < 2:895147‑M1/28‑1 (MQ=255) ttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATc > 2:2909697‑M1/64‑93 (MQ=255) tgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATATCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATcc > 2:3266570‑M1/63‑93 (MQ=255) taaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGc > 1:635479‑M1/61‑93 (MQ=255) aaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCt > 2:2123891‑M1/60‑93 (MQ=255) aaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTca > 2:3388972‑M1/58‑93 (MQ=255) ggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTcaca < 1:2201748‑M1/38‑1 (MQ=255) caaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAtt < 2:3169517‑M1/41‑1 (MQ=255) aaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTc < 1:2855162‑M1/42‑1 (MQ=255) aaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTc > 1:4054661‑M1/52‑93 (MQ=255) aaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTc > 1:3040356‑M1/52‑93 (MQ=255) aaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTcc < 1:495963‑M1/43‑1 (MQ=255) aacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcac < 1:2472387‑M1/45‑1 (MQ=255) acggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcaca > 2:4727925‑M1/48‑93 (MQ=255) ggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcacaca > 2:167097‑M1/46‑93 (MQ=255) caaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 2:4612004‑M1/51‑1 (MQ=255) caaaccagcagtaaacttgtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAt > 1:3394850‑M1/42‑93 (MQ=255) aaaaccagcagtaagtgggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAt > 2:480230‑M1/42‑93 (MQ=255) aaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAt > 2:2494384‑M1/42‑93 (MQ=255) aaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAt < 1:2715964‑M1/52‑1 (MQ=255) aaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa > 1:3061905‑M1/41‑93 (MQ=255) aaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCCCTCACAATTCCACACAACATa > 2:4011038‑M1/41‑93 (MQ=255) aaaccagcagtaagcgggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa > 2:3203511‑M1/41‑93 (MQ=255) aaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATAc < 1:691741‑M1/54‑1 (MQ=255) ccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGa > 1:2755666‑M1/38‑93 (MQ=255) cagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATAagag < 2:3046937‑M1/57‑1 (MQ=255) cagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAg < 1:3127171‑M1/57‑1 (MQ=255) cagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAg < 2:1608582‑M1/57‑1 (MQ=255) cagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAg > 2:2787038‑M1/37‑93 (MQ=255) agcagtaagctggtcaccattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGc < 2:1044713‑M1/58‑1 (MQ=255) agcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGc < 2:3086133‑M1/58‑1 (MQ=255) gcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGcc < 2:3811301‑M1/59‑1 (MQ=255) gcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGcc > 2:2338211‑M1/35‑93 (MQ=255) cagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCg < 2:3979550‑M1/60‑1 (MQ=255) gtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGa < 2:3783565‑M1/62‑1 (MQ=255) agctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGc < 2:1436668‑M1/65‑1 (MQ=255) gctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCa < 2:2580498‑M1/66‑1 (MQ=255) tggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATa < 2:432154‑M1/68‑1 (MQ=255) ggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATaa > 1:828101‑M1/25‑93 (MQ=255) ggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATaa > 2:4680209‑M1/25‑93 (MQ=255) ggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATaa > 1:1042198‑M1/25‑93 (MQ=255) gtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTGACAATTCCGCACAACATACGAGCCGGAAgcatgaa < 1:1423618‑M1/70‑4 (MQ=255) 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ttttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTaaa < 2:2016986‑M1/77‑1 (MQ=255) ttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGc > 2:4108122‑M1/15‑93 (MQ=255) gatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCt < 2:1267901‑M1/81‑1 (MQ=255) gatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCt > 1:1736137‑M1/13‑93 (MQ=255) attcgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACCCAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTg > 1:3839896‑M1/12‑93 (MQ=255) atacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTg > 1:4138293‑M1/12‑93 (MQ=255) tacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGcctag < 2:4047562‑M1/83‑3 (MQ=255) tacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTgg > 1:2566174‑M1/11‑93 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |