Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 4,091,572 | 3461 bp→GCATGCGGATCCTCTAGAGTCGACATATG | [rhaD]–rhaB | [rhaD], rhaA, rhaB |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4091572 | 4095032 | 3461 | 229 [0] | [0] 231 | [rhaD]–rhaB | [rhaD],rhaA,rhaB |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4091571 | 0 (0.000) | 162 (1.310) +GCATGCGGATCCTCTAGAGTCGACATATG |
85/126 | 0.0 | 100% | coding (283/825 nt) | rhaD | rhamnulose‑phosphate aldolase |
? | NC_000913 | 4095033 = | 0 (0.000) | intergenic (‑4/‑284) | rhaB/rhaS | rhamnulokinase/RhaS |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GGCTGCGGCATTCACGCTCGTAACGCGCCAGCATCACGCGCCCACTGGATGCGCCGAGATCGACGGCGACACAATTGCGAAAGGTCATAATGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGCCATTGGCAACCA > NC_000913/4094942‑4095125 | gtggggacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGt < 1:3594623‑M2/2‑1 (MQ=255) gggacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGAt > 1:2039085‑M2/89‑93 (MQ=255) ggacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATc < 1:4386787‑M2/6‑1 (MQ=255) gacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATcc < 1:1560280‑M2/7‑1 (MQ=255) gacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATcc < 2:4171857‑M2/7‑1 (MQ=255) gacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATcc > 1:3523710‑M2/87‑93 (MQ=255) gacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagccgacatatgGTGATcc > 1:4721008‑M2/87‑93 (MQ=255) gacggcttcgctggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATcc > 2:3642070‑M2/87‑93 (MQ=255) acggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCct < 2:3646521‑M2/8‑1 (MQ=255) gcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgct > 1:4590319‑M2/83‑93 (MQ=255) cttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgctg > 2:230739‑M2/82‑93 (MQ=255) cttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgctg > 2:2687814‑M2/82‑93 (MQ=255) ttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGa > 1:857602‑M2/81‑93 (MQ=255) tcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGaa < 2:796678‑M2/14‑1 (MQ=255) tgttggtaaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAt < 2:3553010‑M2/15‑1 (MQ=255) gttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAtt > 2:1936083‑M2/78‑93 (MQ=255) ttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAttt > 1:2279882‑M2/77‑93 (MQ=255) ttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAttt > 2:3384183‑M2/77‑93 (MQ=255) ggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCa > 1:1847881‑M2/75‑93 (MQ=255) ggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCa < 1:3672427‑M2/19‑1 (MQ=255) gttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCAt < 2:4515760‑M2/20‑1 (MQ=255) gttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCAt > 1:285743‑M2/74‑93 (MQ=255) gttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCAt < 1:3936351‑M2/20‑1 (MQ=255) ttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCAtt > 1:2000545‑M2/73‑93 (MQ=255) taacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCattc > 2:4577454‑M2/72‑92 (MQ=255) taacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTa > 1:4469141‑M2/72‑93 (MQ=255) aacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTAc > 2:4698011‑M2/71‑93 (MQ=255) acccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACg > 1:4532482‑M2/70‑93 (MQ=255) acccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACg > 2:3444695‑M2/70‑93 (MQ=255) acccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACg > 2:3988634‑M2/70‑93 (MQ=255) cccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGa > 2:2603791‑M2/69‑93 (MQ=255) ccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGAc > 1:1705445‑M2/68‑93 (MQ=255) ccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGAc > 1:2556457‑M2/68‑93 (MQ=255) ccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGAc > 1:2780419‑M2/68‑93 (MQ=255) cccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGAcc < 1:660149‑M2/27‑1 (MQ=255) cccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGAcc > 1:494203‑M2/67‑93 (MQ=255) cccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGAcc > 1:4271466‑M2/67‑93 (MQ=255) caaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAg > 2:4421470‑M2/65‑93 (MQ=255) caaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAg < 2:640392‑M2/29‑1 (MQ=255) caaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAg > 2:1871017‑M2/65‑93 (MQ=255) caaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAg < 1:2208194‑M2/29‑1 (MQ=255) aaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGt > 2:2740474‑M2/64‑93 (MQ=255) aaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGt > 2:841774‑M2/64‑93 (MQ=255) gaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTa > 1:3153892‑M2/61‑93 (MQ=255) aatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTaa < 2:1594651‑M2/34‑1 (MQ=255) ttggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTaaaaa < 1:3779975‑M2/37‑1 (MQ=255) gtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTaaaaa > 1:2480881‑M2/57‑93 (MQ=255) tggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAg > 2:1719706‑M2/56‑93 (MQ=255) gtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAgcg > 1:3216889‑M2/54‑93 (MQ=255) agcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGcc > 1:2941447‑M2/52‑93 (MQ=255) agcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGcc > 1:526980‑M2/52‑93 (MQ=255) gcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCt > 2:1149852‑M2/51‑93 (MQ=255) ccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTTATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGa > 1:1361916‑M2/49‑93 (MQ=255) ccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacataggGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGa > 1:1831973‑M2/49‑93 (MQ=255) cgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGaa < 1:925934‑M2/46‑1 (MQ=255) cgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGaa < 1:3295025‑M2/46‑1 (MQ=255) cgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGaa > 2:3852831‑M2/48‑93 (MQ=255) cgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGaa > 1:4502803‑M2/48‑93 (MQ=255) gcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAAt > 2:2039963‑M2/47‑93 (MQ=255) cgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgagatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAACCGCCtgaaat < 2:4403843‑M2/48‑3 (MQ=255) cgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAAtt > 1:2106177‑M2/46‑93 (MQ=255) gccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTc < 1:2351947‑M2/49‑1 (MQ=255) cgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTcgc > 1:1194001‑M2/43‑93 (MQ=255) cgtcgctggcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTcgc < 1:1292729‑M2/51‑1 (MQ=255) gtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATTCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTcgcg > 2:141451‑M2/42‑93 (MQ=255) tcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGa > 1:267264‑M2/41‑93 (MQ=255) tgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCtt > 2:754603‑M2/37‑93 (MQ=255) tgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCtt > 1:2923630‑M2/37‑93 (MQ=255) gtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtc < 2:1074053‑M2/58‑1 (MQ=255) gtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtc > 1:2559851‑M2/36‑93 (MQ=255) cgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtctc < 1:1000848‑M2/60‑1 (MQ=255) cgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtctc > 1:1624050‑M2/34‑93 (MQ=255) gacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGTCTGAATTCGCGACCTTCTCg > 1:4348447‑M2/33‑93 (MQ=255) gacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCg > 2:343267‑M2/33‑93 (MQ=255) catgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTACAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTAc > 1:681852‑M2/29‑93 (MQ=255) catgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTAc > 2:2206392‑M2/29‑93 (MQ=255) tgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCATGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTg > 1:1484033‑M2/27‑93 (MQ=255) ggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACa < 2:2255950‑M2/70‑1 (MQ=255) ggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACa > 1:3430332‑M2/24‑93 (MQ=255) atcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAgg > 2:2445613‑M2/22‑93 (MQ=255) tcctctatggtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGa < 2:905955‑M2/73‑1 (MQ=255) tcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGa > 2:40609‑M2/21‑93 (MQ=255) cctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGaa > 2:1112356‑M2/20‑93 (MQ=255) tctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGaaaa > 1:2308711‑M2/18‑93 (MQ=255) agagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAAtga > 2:3063719‑M2/15‑92 (MQ=255) agagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAAtga > 2:4030562‑M2/15‑92 (MQ=255) gtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGcc > 1:1678140‑M2/12‑93 (MQ=255) gtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGcc > 2:2102992‑M2/12‑93 (MQ=255) gtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGcc > 2:1489695‑M2/12‑93 (MQ=255) gtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGcc > 1:2426508‑M2/12‑93 (MQ=255) cgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCAt > 1:655650‑M2/10‑93 (MQ=255) gacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCTCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCAtt < 2:1699199‑M2/85‑1 (MQ=255) acatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTg > 1:3050933‑M2/8‑93 (MQ=255) atatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTGGc < 2:4138936‑M2/88‑1 (MQ=255) atgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTGGCaa > 1:1101156‑M2/4‑93 (MQ=255) tgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTGGCAAc > 1:1949394‑M2/3‑93 (MQ=255) tgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTGGCAAc < 2:3144074‑M2/91‑1 (MQ=255) tgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTGGCAAc > 2:3317569‑M2/3‑93 (MQ=255) gGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTGGCAAcc > 2:2827598‑M2/2‑93 (MQ=255) gtgATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGAGCCATTGGCAACCa < 2:1242152/93‑1 (MQ=255) | GGCTGCGGCATTCACGCTCGTAACGCGCCAGCATCACGCGCCCACTGGATGCGCCGAGATCGACGGCGACACAATTGCGAAAGGTCATAATGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGCCATTGGCAACCA > NC_000913/4094942‑4095125 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |