| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,949,436 | 0 | A | G | 71.9% | 552.9 / 306.7 | 405 | L6L (CTA→CTG) | yecE | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (73/41); new base G (192/99); total (265/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 436 total aligned reads displayed.
GCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCA > NC_000913/1949344‑1949527 | gcaCAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTa > 2:3476373/1‑93 (MQ=255) acaATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTAcc > 1:2734928/1‑93 (MQ=255) acaATAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGcc > 2:140197/1‑93 (MQ=255) acaATAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGcc < 1:3161308/93‑1 (MQ=255) caATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCg > 1:1592112/1‑93 (MQ=255) caATAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCg < 2:1689138/93‑1 (MQ=255) caATAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCg > 2:2236537/1‑93 (MQ=255) caATAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCg > 2:4074399/1‑93 (MQ=255) aaTAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGc > 1:1007355/1‑93 (MQ=255) aaTAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGc > 2:434916/1‑93 (MQ=255) tAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCaa > 1:2658530/1‑93 (MQ=255) tAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCaa > 2:313751/1‑93 (MQ=255) tAACAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCaa > 2:3650477/1‑93 (MQ=255) aaCAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAAt < 2:122430/93‑1 (MQ=255) aCAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTTCATCGGTCTGCCGCAATg < 1:4263485/93‑1 (MQ=255) aCAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAAta > 2:4188005/1‑92 (MQ=255) aCAGCATTAATCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTAGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATg < 1:3709821/93‑1 (MQ=255) gTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTc > 2:1020667/1‑93 (MQ=255) gTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTc < 1:1503293/93‑1 (MQ=255) tCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCa > 1:2441074/1‑93 (MQ=255) tCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCa > 1:3004896/1‑93 (MQ=255) aaCCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAAGGCATTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATc > 2:1321114/1‑93 (MQ=255) aaCCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATc > 1:4005187/1‑93 (MQ=255) aaCCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATc > 1:1288858/1‑93 (MQ=255) tcATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGGGCGTAGCGTGGAAGATATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCt < 1:3280549/92‑1 (MQ=255) cATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTa < 1:1112796/93‑1 (MQ=255) atatCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTaa < 1:2214370/93‑1 (MQ=255) tatCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTaaa > 2:612608/1‑93 (MQ=255) tatCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTaaa < 2:790420/93‑1 (MQ=255) tatCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTaaa > 2:1452587/1‑93 (MQ=255) tCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATg < 2:3881105/93‑1 (MQ=255) tCTACCCGCGCATAGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAAAGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATACTAAATg > 2:2079384/1‑93 (MQ=255) cTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGTGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATgg > 2:3173852/1‑93 (MQ=255) cTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATgg > 2:1136215/1‑93 (MQ=255) cTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATgg > 1:4533199/1‑93 (MQ=255) tACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATggg > 2:2143455/1‑93 (MQ=255) tACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATggg > 2:3974686/1‑93 (MQ=255) tACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATggg > 2:15141/1‑93 (MQ=255) tACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATggg > 2:1290837/1‑93 (MQ=255) aCCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGt > 1:1872731/1‑93 (MQ=255) aCCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGt > 1:3509107/1‑93 (MQ=255) aCCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGt < 2:4319622/93‑1 (MQ=255) aCCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGt < 1:2134239/93‑1 (MQ=255) cccGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTg < 1:3899430/93‑1 (MQ=255) ccGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGc > 2:161435/1‑93 (MQ=255) ccGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGc > 1:2499231/1‑93 (MQ=255) gcgcATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCgg > 1:295629/1‑93 (MQ=255) gcgcATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCgg > 2:3742747/1‑93 (MQ=255) gcATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGtt < 2:181587/93‑1 (MQ=255) cATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTg > 1:1640940/1‑93 (MQ=255) cATCGCCCGTGTGCATAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTg < 2:2881249/93‑1 (MQ=255) ctCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTgg > 1:2891410/2‑93 (MQ=255) ctCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCGCAGCGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTgg < 2:712345/92‑1 (MQ=255) aTCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTgg < 1:4185497/93‑1 (MQ=255) cGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTgggg < 1:179645/93‑1 (MQ=255) gCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTgggta > 2:1263963/1‑91 (MQ=255) ccGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATc < 1:415401/93‑1 (MQ=255) cGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCa > 1:2005171/1‑93 (MQ=255) cGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCa < 2:257663/93‑1 (MQ=255) gtgtGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCAc > 1:759646/1‑93 (MQ=255) tgtgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCAcc > 1:176168/1‑93 (MQ=255) tgtgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCAcc > 2:55992/1‑93 (MQ=255) tgtgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCAcc > 2:2062419/1‑93 (MQ=255) tgtgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCAcc > 2:892829/1‑93 (MQ=255) tgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAg > 2:4499170/1‑93 (MQ=255) tgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAg > 2:2839528/1‑93 (MQ=255) gTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCTTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCt < 1:2621346/93‑1 (MQ=255) gTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCGTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCt > 1:674687/1‑93 (MQ=255) tAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCtt > 1:575399/1‑93 (MQ=255) gCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGa > 1:788437/1‑93 (MQ=255) gCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGa > 2:4054309/1‑93 (MQ=255) cGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGaa > 1:4618473/1‑93 (MQ=255) cGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGaa < 1:855501/93‑1 (MQ=255) cGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGaa < 2:2764911/93‑1 (MQ=255) gTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAag < 1:3765133/93‑1 (MQ=255) tGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAaga < 1:3406885/93‑1 (MQ=255) ggAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAagag < 1:4384299/93‑1 (MQ=255) gAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGt < 2:4416490/93‑1 (MQ=255) aaGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTa > 2:1861822/1‑93 (MQ=255) aaGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTa > 1:2809711/1‑93 (MQ=255) agagATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAt > 1:1421462/1‑93 (MQ=255) gagaTCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATg > 2:295690/1‑93 (MQ=255) gagaTCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATg > 1:3602797/1‑93 (MQ=255) gaTCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGcc < 2:304581/93‑1 (MQ=255) gaTCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGcc < 2:369076/93‑1 (MQ=255) gaTCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGcc > 2:4648005/1‑93 (MQ=255) cttcaCGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGcc > 1:4083200/5‑93 (MQ=255) cttcaCGCGTTATGATTGACATCGGTCTGCCGCAAGGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGcc < 1:2263580/89‑1 (MQ=255) tCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCa > 2:1922354/1‑93 (MQ=255) caCGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACt > 2:4589536/2‑93 (MQ=255) ccgctTTATTATTTACACCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCATAAAGGGGTGCGTTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACtt < 2:2665561/92‑1 (MQ=255) ccgcgTTATGATTTACATCGGTCTGCCGAAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACtt < 1:4444473/92‑1 (MQ=255) aTGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGc > 1:3148986/1‑93 (MQ=255) aTGAGTTACATGGGTCTACCGCAATGGGCGCATCCTAAAGGTGGGCGGTTCGGGTTCACCAGCCTTGAATAGTATGCCCGCCACTTTAACtcg > 2:3296862/1‑91 (MQ=255) gATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGt > 2:3397759/1‑93 (MQ=255) tttACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGCATGCCCGCCACTTTAACTGCGTgg > 2:1738781/1‑93 (MQ=255) tttACATCGGTCTACCGCAAGGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTgg < 2:240619/93‑1 (MQ=255) tACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTgacg > 2:4243605/1‑90 (MQ=255) aCATGGGTCTCCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGGGGTGGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAgg < 1:4737758/93‑1 (MQ=255) aCATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCAAATGGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTAAAGATTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTgacgc < 2:1988847/93‑5 (MQ=255) | GCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCA > NC_000913/1949344‑1949527 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |