Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,949,472 | 0 | G | T | 62.4% | 99.7 / inf | 234 | G18G (GGG→GGT) | yecE | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (61/27); new base T (95/51); total (156/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.90e-08 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
CGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTGCG > NC_000913/1949380‑1949564 | cGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTgggg < 1:179645/93‑1 (MQ=255) cccGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTAt < 1:4595201/93‑1 (MQ=255) cccGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTAt > 1:167915/1‑93 (MQ=255) cccGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGAt < 2:2095440/93‑1 (MQ=255) ctgtgtGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATc < 2:1655155/91‑1 (MQ=255) ccGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATc < 2:4267867/93‑1 (MQ=255) ccGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATc > 2:733936/1‑93 (MQ=255) ccGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATc < 1:415401/93‑1 (MQ=255) cagtgtGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACAGCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATc < 1:2223784/91‑1 (MQ=255) cGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTTGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCa > 1:3236340/1‑93 (MQ=255) cGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCa < 2:257663/93‑1 (MQ=255) cGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCa > 1:2005171/1‑93 (MQ=255) cGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCa > 1:4261296/1‑93 (MQ=255) gtgtGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCAc > 1:3578759/1‑93 (MQ=255) gtgtGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCAc < 1:728124/93‑1 (MQ=255) tgtgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCAcc < 1:7702/93‑1 (MQ=255) tgtgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTAGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCAcc > 2:2629308/1‑93 (MQ=255) gtgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCa < 1:1215263/93‑1 (MQ=255) tgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAg > 1:3451768/1‑93 (MQ=255) tgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAg > 2:564204/1‑93 (MQ=255) tgCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAg > 2:2839528/1‑93 (MQ=255) ggctAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGc < 1:1604768/90‑1 (MQ=255) gCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGc > 1:802403/1‑93 (MQ=255) cGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGcc < 2:3182478/93‑1 (MQ=255) gTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCTTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCt < 1:2621346/93‑1 (MQ=255) gTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCt > 2:2230954/1‑93 (MQ=255) gTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCt < 1:3743716/93‑1 (MQ=255) gTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCt > 2:4072254/1‑93 (MQ=255) tAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCtt < 2:11136/93‑1 (MQ=255) aGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATTGTCGCATCCCAAATGGGTGCGGTTGGGTCTCACCAGCCTTg > 1:1508949/1‑93 (MQ=255) aGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTg > 1:3789043/1‑93 (MQ=255) cGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGaa < 1:3151989/93‑1 (MQ=255) cGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGaa < 1:855501/93‑1 (MQ=255) gTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAag > 2:2506818/1‑93 (MQ=255) tGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAaga > 1:4408274/1‑93 (MQ=255) tGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAaga > 1:606784/1‑93 (MQ=255) ggAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAagag > 2:1782727/1‑93 (MQ=255) gAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGt < 2:1707882/93‑1 (MQ=255) gAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGt < 2:4416490/93‑1 (MQ=255) aaGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTa < 1:104004/93‑1 (MQ=255) aaGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTa > 2:1861821/1‑93 (MQ=255) aaGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTa < 1:3933652/93‑1 (MQ=255) aaGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTa < 2:4555872/93‑1 (MQ=255) agagATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTAt > 1:1421462/1‑93 (MQ=255) agagATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTAt < 2:1898455/93‑1 (MQ=255) gagaTCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATg > 1:3602797/1‑93 (MQ=255) agaTCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGc > 2:100260/1‑93 (MQ=255) gaTCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGcc < 2:304581/93‑1 (MQ=255) gaTCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGcc < 2:369076/93‑1 (MQ=255) aTCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGccc > 2:2856586/1‑93 (MQ=255) aTCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGccc > 2:3847107/1‑93 (MQ=255) cttcaCGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGcc > 2:3102437/5‑93 (MQ=255) cttcaCGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGcc > 1:4083201/5‑93 (MQ=255) cttcaCGCGTTATGATTGACATCGGTCTGCCGCAAGGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGcc < 1:2263580/89‑1 (MQ=255) tcaCGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCAc < 2:2786574/91‑1 (MQ=255) tcaCGCGTTAGTATTTACATCGTTCTGCCGAAATGGCCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCAc < 2:909796/91‑1 (MQ=255) ccgcgTTATGATTTACATCGGTCTGCCGAAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACtt < 1:4444473/92‑1 (MQ=255) aCGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACtt > 2:461551/1‑93 (MQ=255) aCGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACtt > 2:4657149/1‑93 (MQ=255) cgctTTATGATTTCAATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTGGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACttt < 2:200885/93‑1 (MQ=255) cgcgTTATGATTTACATCGTTCTCCCGCAAGGTTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTGGAAGAGTATGCCCGCCACttt < 2:2381577/93‑1 (MQ=255) gcgTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTa > 2:4041089/1‑93 (MQ=255) gTTATGATTTACATGGGTCTGCCGCAGTGGTCGCATCCTAAATGGGTGGGGTGGGGTATCACCGGCCTTAAAGAGTATGCCCGCCACTTTAAc < 2:1201222/93‑1 (MQ=255) gTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAAc > 2:1430497/1‑93 (MQ=255) gTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAAc > 1:3333149/1‑93 (MQ=255) gTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGACGCATCCTAAATGGGAGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTACTGCCGCCACTTTAAc > 2:603782/1‑93 (MQ=255) gTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAAc > 2:1963314/1‑93 (MQ=255) ttATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACt > 1:3961537/1‑93 (MQ=255) tATGTTTTACATCGGTCTGCCGCAATGGCCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTACCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTg < 1:1844504/93‑1 (MQ=255) tATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTg > 1:3123876/1‑93 (MQ=255) tATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTg > 2:2064658/1‑93 (MQ=255) tGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCg > 1:2957347/1‑93 (MQ=255) gATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGt > 2:3397759/1‑93 (MQ=255) aTTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTg > 2:4177590/1‑93 (MQ=255) tttACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGCATGCCCGCCACTTTAACTGCGTga > 2:1269517/1‑92 (MQ=255) ttACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTgac > 1:2805141/1‑91 (MQ=255) tACATCGGTCTGCCGCAAGGGTCGCATCGTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTgacg < 1:2490152/93‑4 (MQ=255) aCATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTgacgc > 1:2456674/1‑89 (MQ=255) aCATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCAAATGGGGTGCGGTTGGGTATCACCAGCCTTAAAGATTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTgacgc < 2:1988847/93‑5 (MQ=255) gTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAaca > 1:2730706/1‑93 (MQ=255) gTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAaca > 2:3515500/1‑93 (MQ=255) gTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGGGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAaca > 2:4333973/1‑93 (MQ=255) ccGCAATGGCCGCATCCTGAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCATCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACg > 2:126680/1‑93 (MQ=255) aaTGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCttt > 2:3130054/1‑93 (MQ=255) aTGGTCGCATCCTAAGTGGGTGGGGTGGGGGATCACCAGCCTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTa < 2:3367723/93‑1 (MQ=255) aTGGTCGCATCCTAAATGGGTGGGTTGGGGGATCCCCAGCCTTAAAGGTTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTa < 1:2851318/93‑1 (MQ=255) aTGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTa > 2:3412591/1‑93 (MQ=255) tCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGcc > 1:1776085/1‑93 (MQ=255) aTCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGc > 1:1919970/1‑93 (MQ=255) aTCCTAAAGGGGTGGGGTGGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGc < 1:4639362/93‑1 (MQ=255) aTCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGc < 2:1533347/93‑1 (MQ=255) tCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGcc > 1:49038/1‑93 (MQ=255) ccTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCg > 2:2758385/1‑93 (MQ=255) tAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGaa > 2:2979012/1‑93 (MQ=255) aaaTGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGaaa > 1:3548150/1‑93 (MQ=255) aTGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAAcc > 1:534563/1‑93 (MQ=255) ggTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGa > 1:2887125/1‑93 (MQ=255) gCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGt < 2:2122152/93‑1 (MQ=255) ggTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTg > 2:290244/1‑93 (MQ=255) ggggACCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCt < 2:826798/93‑1 (MQ=255) | CGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTGCG > NC_000913/1949380‑1949564 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |