| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,883,067 | T→C | D121D (GAT→GAC) | yidC → | 60 KD inner‑membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,883,067 | 0 | T | C | 98.8% | 511.5 / ‑2.6 | 166 | D121D (GAT→GAC) | yidC | 60 KD inner‑membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base C (86/78); total (88/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
AACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGA > NC_000913/3882978‑3883158 | aCTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAcc > 2:10024/1‑93 (MQ=255) tctACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCg > 1:3343671/1‑93 (MQ=255) cccAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTa > 1:2072863/1‑93 (MQ=255) ccAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTGGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTaa > 1:1628927/1‑93 (MQ=255) cAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAAc < 1:645487/93‑1 (MQ=255) gCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACgg > 1:3267747/1‑93 (MQ=255) ccGGTCCAGCTGTTAGAAACGTCACCGCAGTTTACTTATCAGACCCAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGc < 2:3969109/93‑1 (MQ=255) gTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTCTTTATCAGGCACCGAGCGGTCTCACCAGTCGTGATGGCCCGGACCACCCGGCTAACCGccc > 1:1255397/1‑93 (MQ=255) gTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGccc > 1:4619304/1‑93 (MQ=255) gTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGccc > 1:155431/1‑93 (MQ=255) gTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGccc > 2:2485559/1‑93 (MQ=255) ttCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCcg > 2:2986580/1‑93 (MQ=255) ttCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCcg > 2:4114682/1‑93 (MQ=255) ttCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCcg > 1:2641651/1‑93 (MQ=255) ccAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCcgcg > 2:587569/1‑93 (MQ=255) cAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGTGCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTACCGGCCcgcgc > 1:2595131/1‑92 (MQ=255) cAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGt > 1:82436/1‑93 (MQ=255) cAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGCCCCGGACAACCCGGCTAACGTCCCGCGt > 1:1778018/1‑93 (MQ=255) aGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTc > 2:2843003/1‑93 (MQ=255) gCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTcc < 1:2025805/93‑1 (MQ=255) tGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGc > 2:1778625/1‑93 (MQ=255) gTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCt > 1:3520199/1‑93 (MQ=255) ttGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTg > 2:1795479/1‑93 (MQ=255) ttGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTg > 2:1093949/1‑93 (MQ=255) ggAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGta < 2:4354504/93‑1 (MQ=255) aaCTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATaa > 2:1576846/1‑93 (MQ=255) aaCTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATaa > 2:337132/1‑93 (MQ=255) aCTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAAc > 2:4256067/1‑93 (MQ=255) cTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACg > 1:1442346/1‑93 (MQ=255) cTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACg < 1:2330568/93‑1 (MQ=255) cACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTg > 2:1145599/1‑93 (MQ=255) cccGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGa < 2:1191449/92‑1 (MQ=255) ccGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATCACGTTGaa > 2:3505084/1‑93 (MQ=255) cGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGCTGGGCCGGACAACCCGGCTAACGACCCACGCCCCCTGTTCAACGTTCaac > 1:4169428/1‑92 (MQ=255) gcggTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaa < 2:54766/90‑1 (MQ=255) gCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaa > 2:1371511/1‑93 (MQ=255) gCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaa > 1:3034849/1‑93 (MQ=255) cAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaaa < 1:1767232/93‑1 (MQ=255) aGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAg < 2:849232/93‑1 (MQ=255) aGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGACCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAg < 1:2347376/93‑1 (MQ=255) gTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGa < 1:1387996/93‑1 (MQ=255) gTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGa < 1:2833963/93‑1 (MQ=255) gTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGa < 1:4028034/93‑1 (MQ=255) tttatttaTCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGAc < 2:1739363/93‑1 (MQ=255) tttatttaTCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGAc > 1:274388/1‑93 (MQ=255) tatttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGc < 2:2333412/93‑1 (MQ=255) tatttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGc < 2:4553670/93‑1 (MQ=255) atttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCt > 2:1480931/1‑93 (MQ=255) atttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAACCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCt < 2:1878297/93‑1 (MQ=255) tttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCtt < 1:1664645/93‑1 (MQ=255) ttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTa < 1:2477943/93‑1 (MQ=255) tatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAt < 1:4679425/93‑1 (MQ=255) atCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAtg < 2:3557778/93‑1 (MQ=255) cAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAtgtg < 1:4448040/93‑1 (MQ=255) aGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgc < 2:2628094/93‑1 (MQ=255) aGGCACAGAGCGGGCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCCGGAGAACGGTGAAAAAGACGCTCACGTgc > 1:3601963/1‑93 (MQ=255) ggCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgct > 2:1202956/1‑93 (MQ=255) ggCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgct < 2:4561507/93‑1 (MQ=255) ggCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgct > 2:684675/1‑93 (MQ=255) gCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctg > 1:3067994/1‑93 (MQ=255) gCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctg < 2:127566/93‑1 (MQ=255) gCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctg < 2:127565/93‑1 (MQ=255) gCACAGAGCGGTCTGACCGGTCATGATGGCACGGAAAACCCTGCCCACGGCTCGCGTCCGCTGTATAATGTTGAAAATGGCGCATATGCgctg > 2:4429399/1‑93 (MQ=255) acaGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctggc > 2:229995/1‑93 (MQ=255) acaGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctggc < 1:708017/93‑1 (MQ=255) caGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctggct > 1:1970854/1‑93 (MQ=255) gagCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGa > 1:4192913/1‑93 (MQ=255) gCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAg < 2:2315841/93‑1 (MQ=255) gCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCGAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAg < 1:545782/93‑1 (MQ=255) ggTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGt < 2:4722135/93‑1 (MQ=255) ggTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGt < 1:632104/93‑1 (MQ=255) gTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTc < 2:3855082/93‑1 (MQ=255) cTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAACAAGACGCTTATGTGCTGGCTAAAGGTaaa > 1:4036644/1‑93 (MQ=255) tGACCGGTCGTGAAGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCaaa > 2:887069/1‑93 (MQ=255) gACCGGTCGTGATGACCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCaaaa > 1:2100018/1‑93 (MQ=255) ccGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACg > 1:1895002/1‑93 (MQ=255) cGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGATGAAAAAGACACTTATGTGCTGGCTGAATGTTGAAAcca > 2:160183/1‑91 (MQ=255) ggTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGaa > 2:3272074/1‑93 (MQ=255) 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tGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCa < 2:4011689/93‑1 (MQ=255) tGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCa > 2:3225273/1‑93 (MQ=255) gATGGCCCGTACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAg < 2:2533362/93‑1 (MQ=255) gATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAg < 2:3341805/93‑1 (MQ=255) gATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAg > 1:4112046/1‑93 (MQ=255) gATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAg < 2:4674159/93‑1 (MQ=255) gATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCACGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAg < 2:2533361/93‑1 (MQ=255) aTGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAgg > 2:3102864/1‑93 (MQ=255) aTGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAgg > 1:4722370/1‑93 (MQ=255) ggCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTg > 2:1632844/1‑93 (MQ=255) ccGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCg < 1:75130/93‑1 (MQ=255) cGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGa < 2:2390527/93‑1 (MQ=255) cGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGa > 2:319647/1‑93 (MQ=255) aTAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGa > 1:3136148/1‑93 (MQ=255) | AACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGA > NC_000913/3882978‑3883158 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |