Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,950,400 | T→C | R98R (CGT→CGC) | ilvE → | branched‑chain amino‑acid aminotransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,950,400 | 0 | T | C | 95.5% | 461.2 / 7.7 | 156 | R98R (CGT→CGC) | ilvE | branched‑chain amino‑acid aminotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (5/2); new base C (80/69); total (85/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GCTTCCCGGTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGTCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTCCCGTGGGG > NC_000913/3950312‑3950489 | gCTTCCCGGTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCGCCAGCGCCTATATccgcccgc < 1:4489617/93‑1 (MQ=255) cTTCCCGGTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCt < 1:1153912/93‑1 (MQ=255) ttCCCGGTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTg > 2:4629162/1‑93 (MQ=255) ttCCCGGTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTg < 2:3181045/93‑1 (MQ=255) cccGGTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGAt < 1:3747778/93‑1 (MQ=255) cccGGTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGAt < 1:3112737/93‑1 (MQ=255) ccGGTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATc < 1:3984932/93‑1 (MQ=255) cGGTTTCGCAGAGTATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCt < 2:2396535/93‑1 (MQ=255) cGGTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCt < 2:2396534/93‑1 (MQ=255) ggTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCtt > 2:3434219/1‑93 (MQ=255) ggTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCtt > 2:2233381/1‑93 (MQ=255) ggTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCtt > 2:2573653/1‑93 (MQ=255) gTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTtc < 1:4128945/93‑1 (MQ=255) tttCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTtcg < 1:742969/93‑1 (MQ=255) tttCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTtcg > 2:2521012/1‑93 (MQ=255) tCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTtcgtc < 1:1707780/93‑1 (MQ=255) tCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTtcgtc < 2:1056781/93‑1 (MQ=255) cGCAGAGGATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCTGGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTtcgtcg < 1:1119602/93‑1 (MQ=255) gCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGTCCGCTGATCTTCGTCgg < 2:3915343/93‑1 (MQ=255) cAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGt < 2:2790610/93‑1 (MQ=255) cAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGt < 1:2927950/93‑1 (MQ=255) gagCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAACAACAATCTCACCAGCGCCTATCTGCGCCCGCGGATCTCCTTCGGTGa > 1:1613641/1‑93 (MQ=255) gagCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGa > 1:2439408/1‑93 (MQ=255) agCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGAt < 2:1766351/93‑1 (MQ=255) agCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGAt < 2:4733366/93‑1 (MQ=255) aTTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGtt > 1:384265/1‑93 (MQ=255) tgatgaGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTgg < 2:1297586/93‑1 (MQ=255) tgatgaGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTgg < 2:302393/93‑1 (MQ=255) tgatgaGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTgg > 1:4064007/1‑93 (MQ=255) atgaGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGTCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCa > 1:3924099/1‑93 (MQ=255) gaGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATg < 1:1222710/93‑1 (MQ=255) aGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATgg < 1:4591399/93‑1 (MQ=255) cTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGa < 2:3148420/93‑1 (MQ=255) tGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAg > 2:1186111/1‑93 (MQ=255) tGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAg > 1:327253/1‑93 (MQ=255) gATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAga > 1:4617997/1‑92 (MQ=255) gATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGt < 1:742125/93‑1 (MQ=255) gATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTACCCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGAGCTTCGTCGGTGATGTTGGCATgggcga > 1:1976400/1‑90 (MQ=255) aTGGAAGCTTGTCGTTCGGTCATCCGCAAAACCAATCTCCCCAGCGCCTATATCCGCCCTCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTa < 2:1842968/93‑1 (MQ=255) tGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTaa < 2:757256/93‑1 (MQ=255) ggAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTaaa > 2:98070/1‑93 (MQ=255) ggAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTaaa < 1:4272104/93‑1 (MQ=255) gAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAAc < 2:3813352/93‑1 (MQ=255) aaGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAAcc > 1:367269/1‑93 (MQ=255) aaGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAAcc > 1:1361544/1‑93 (MQ=255) aaGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAAcc < 1:1364632/93‑1 (MQ=255) gCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCg > 1:2029868/1‑93 (MQ=255) cTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGc > 2:4152252/1‑93 (MQ=255) ttGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGcc < 1:2301316/93‑1 (MQ=255) ttGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGcc > 2:168883/1‑93 (MQ=255) ttGTCGTGACGTGATCCCCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGATTAAACCCGcc < 2:1290506/93‑1 (MQ=255) cgtgacgtgaTCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCg < 2:2080379/93‑1 (MQ=255) gtgacgtgaTCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCgg > 2:2882208/1‑93 (MQ=255) tgacgtgaTCCGCAAAAACAATCTCCCCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCggg < 2:4347233/93‑1 (MQ=255) tgacgtgaTCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCggg > 1:556559/1‑93 (MQ=255) gacgtgaTCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGa < 1:3700285/93‑1 (MQ=255) gacgtgaTCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGa > 2:4116384/1‑93 (MQ=255) gacgtgaTCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGa < 2:1592249/93‑1 (MQ=255) cgtgaTCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCAGCCAGCGGGATa > 2:1155893/1‑93 (MQ=255) gtgaTCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATAc < 2:4077110/93‑1 (MQ=255) tgaTCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACt > 1:474571/1‑93 (MQ=255) tCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCaa > 1:2891784/1‑93 (MQ=255) aaaaaCAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGAc > 1:257165/1‑93 (MQ=255) aaaaaCAACCCCCCCAGCGCCTTAACCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGAc < 1:3361195/93‑1 (MQ=255) aaaaCAATCTCACCAGCGCCTATATCCGTCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACg > 2:4030144/1‑93 (MQ=255) aaaCAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGt > 2:2714231/1‑93 (MQ=255) aaaCAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGt > 2:644220/1‑93 (MQ=255) aaCAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTg > 1:2354167/1‑93 (MQ=255) aaCAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTg > 2:3237226/1‑93 (MQ=255) aCAATCTCACCAGCGCCTATATCCGTCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGa > 1:204271/1‑93 (MQ=255) cAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGAt < 2:3296007/93‑1 (MQ=255) cAATCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGAt > 1:125569/1‑93 (MQ=255) aTCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTa < 1:3000264/93‑1 (MQ=255) aTCTCACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTa > 1:1786414/1‑93 (MQ=255) ctcACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATc > 2:648714/1‑93 (MQ=255) tcACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCg > 1:973893/1‑93 (MQ=255) gcACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCg > 2:1932298/2‑93 (MQ=255) ccccAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCgc < 1:2895439/91‑1 (MQ=255) cACCAGCGCCTATATCCGTCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCgc < 1:4365235/93‑1 (MQ=255) cACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCgc > 2:2020382/1‑93 (MQ=255) cACCAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCgc > 1:931039/1‑93 (MQ=255) cccAGCGTCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAACCCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCgct < 1:2393748/92‑1 (MQ=255) ccAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCgctg > 2:2685368/1‑93 (MQ=255) ccAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCgctg < 1:2956712/93‑1 (MQ=255) ccAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCgctg > 2:3272866/1‑93 (MQ=255) ccAGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCgctg > 1:1341512/1‑93 (MQ=255) aGCGCCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCgctgct < 1:4445432/93‑1 (MQ=255) gcgcCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCtt < 1:2668581/93‑1 (MQ=255) gcgcCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATAGCTGCtt > 2:2054097/1‑93 (MQ=255) cgcCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGGTGCttt < 2:3380511/93‑1 (MQ=255) gcCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTc > 2:324791/1‑93 (MQ=255) gcCTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTc > 2:1395521/1‑93 (MQ=255) cTATATCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTccc < 1:1458168/93‑1 (MQ=255) atacCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTCCCGt < 2:4342567/93‑1 (MQ=255) tatCCGCCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAACGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTCCCGTg > 1:1278815/1‑93 (MQ=255) agccgcccgcTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTCCCGTgg < 1:1693655/91‑1 (MQ=255) tccgcccgCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTCCCGTggg > 1:1248338/1‑93 (MQ=255) tccgcccgCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTCCCGTggg < 1:3895323/93‑1 (MQ=255) tccgaccgCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTCCCGTggg < 1:3688215/93‑1 (MQ=255) ccgcccgcTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTCCCGTgggg < 1:339723/93‑1 (MQ=255) | GCTTCCCGGTTTCGCAGAGCATTGATGAGCTGATGGAAGCTTGTCGTGACGTGATCCGCAAAAACAATCTCACCAGCGCCTATATCCGTCCGCTGATCTTCGTCGGTGATGTTGGCATGGGAGTAAACCCGCCAGCGGGATACTCAACCGACGTGATTATCGCTGCTTTCCCGTGGGG > NC_000913/3950312‑3950489 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |