Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,964,041 | A→G | T4A (ACC→GCC) | rho → | transcription termination factor Rho |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,964,041 | 0 | A | G | 98.1% | 665.0 / 0.9 | 212 | T4A (ACC→GCC) | rho | transcription termination factor Rho |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/3); new base G (87/121); total (88/124) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.88e-01 |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
TAAACAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTACCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGCAGGAC > NC_000913/3963951‑3964130 | tAAACAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGcc > 2:75526/1‑93 (MQ=255) aaaCAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCg < 2:126544/93‑1 (MQ=255) aCAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGaa > 2:2224032/1‑93 (MQ=255) aGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACTTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTACCGAAtt < 1:4591917/93‑1 (MQ=255) aGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAAtt < 2:1464153/93‑1 (MQ=255) ggCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTa < 1:873599/93‑1 (MQ=255) ggCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTa > 2:3609902/1‑93 (MQ=255) atcATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATGAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAATAACTCACACCACTATGAATCCTGCCGAATTa < 2:2472413/91‑1 (MQ=255) gCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTaa < 1:3423128/93‑1 (MQ=255) aTGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAg > 2:3317064/1‑93 (MQ=255) aTGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTCTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAg < 2:1982580/93‑1 (MQ=255) aTGGATGATCCTGCCATACCATTAACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAg < 2:2623141/93‑1 (MQ=255) tGGATGATCCTACCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGa > 2:2078889/1‑93 (MQ=255) ggATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGaa < 2:3774263/93‑1 (MQ=255) atgatCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATa > 2:4708478/1‑93 (MQ=255) tgatCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATAc > 1:4372432/1‑93 (MQ=255) tgatCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATAc > 2:3557214/1‑93 (MQ=255) tgatCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATAc < 1:1207477/93‑1 (MQ=255) tgacCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATAc < 2:3048860/93‑1 (MQ=255) tCCTGCCATACCATTCACACCATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGcc < 1:4202126/93‑1 (MQ=255) tCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATGTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGcc > 1:825976/1‑93 (MQ=255) cTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCgg < 1:1506150/93‑1 (MQ=255) cTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCgg < 1:1415005/93‑1 (MQ=255) cTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCgg > 2:2952005/1‑93 (MQ=255) tGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGt < 1:2377832/93‑1 (MQ=255) gCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCggat > 1:144773/1‑91 (MQ=255) cATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTc < 2:826089/93‑1 (MQ=255) aTACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCt < 2:509998/93‑1 (MQ=255) tACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTg > 1:1232260/1‑93 (MQ=255) ccATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAg > 1:2592195/1‑93 (MQ=255) cATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGc < 1:3628916/93‑1 (MQ=255) cATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGc > 1:2653524/1‑93 (MQ=255) cATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGc > 2:258521/1‑93 (MQ=255) ttCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATCCGCCGGTTTCTGAGCTg > 1:4084589/1‑93 (MQ=255) ttCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTg > 2:2801582/1‑93 (MQ=255) ttCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTg > 2:177172/1‑93 (MQ=255) tCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGa < 1:4520170/93‑1 (MQ=255) tCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGa < 2:4542359/93‑1 (MQ=255) cacaACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGAt > 1:3674926/1‑93 (MQ=255) cacaACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGAt < 1:1487518/93‑1 (MQ=255) cacaACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGAt > 2:487938/1‑93 (MQ=255) acaacaTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATc > 2:4240866/1‑93 (MQ=255) caacaTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCa > 1:3590301/1‑93 (MQ=255) caacaTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCa > 1:956577/1‑93 (MQ=255) aacaTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCAc > 1:2725281/1‑93 (MQ=255) aacaTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCAc > 2:2522315/1‑93 (MQ=255) aacaTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCAc > 2:17477/1‑93 (MQ=255) acaTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCAct > 1:18126/1‑93 (MQ=255) caTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTGAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATAActc > 1:311146/1‑93 (MQ=255) aaTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCActc < 2:4738566/92‑1 (MQ=255) aTTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCActct > 2:3630190/1‑93 (MQ=255) ttAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACtctc > 1:2208482/1‑93 (MQ=255) tAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCg < 2:2723236/93‑1 (MQ=255) aGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGc < 2:3364610/93‑1 (MQ=255) gTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCg > 1:79171/1‑93 (MQ=255) gTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCg > 2:4144235/1‑93 (MQ=255) tCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGaa < 2:4013695/93‑1 (MQ=255) cGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGaaa < 1:3721380/93‑1 (MQ=255) agaTTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAat < 1:3775684/93‑1 (MQ=255) tttACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATg < 1:4282125/93‑1 (MQ=255) tttACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATg > 2:2897234/1‑93 (MQ=255) ttACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAATATATgg > 1:1191674/1‑93 (MQ=255) tACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATggg < 2:2915261/93‑1 (MQ=255) tACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATggg > 1:1050905/1‑93 (MQ=255) tACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATggg < 1:512487/93‑1 (MQ=255) tACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATggg < 2:567695/93‑1 (MQ=255) tACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATggg < 1:2141647/93‑1 (MQ=255) cccAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCt > 2:1253235/1‑93 (MQ=255) cccAAAGTTAAGAACTCACACCACTAATAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCt < 1:1688862/93‑1 (MQ=255) ccAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTg > 1:551406/1‑93 (MQ=255) ccAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTg < 2:3660711/93‑1 (MQ=255) ccAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTg > 2:3210307/1‑93 (MQ=255) cAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTgg < 2:43539/93‑1 (MQ=255) aaGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGa > 1:3962921/1‑93 (MQ=255) gTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGaaa < 1:3273719/93‑1 (MQ=255) ttAAGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAAc < 2:66747/93‑1 (MQ=255) aGAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTg < 2:4494956/93‑1 (MQ=255) gAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTgg < 2:3691102/93‑1 (MQ=255) gAACTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTgg < 1:3049344/93‑1 (MQ=255) aatcTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTgg < 2:1406865/90‑1 (MQ=255) aaCTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGc < 1:1900644/93‑1 (MQ=255) aaCTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGc < 2:728580/93‑1 (MQ=255) aaCTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGc < 2:4676024/93‑1 (MQ=255) cTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTc > 1:1860496/1‑93 (MQ=255) cTCACACCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTc > 2:1611927/1‑93 (MQ=255) cacaCCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGt < 2:1287625/93‑1 (MQ=255) acacCACTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGTGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTa < 2:106800/93‑1 (MQ=255) caccacTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTAt > 2:3059618/1‑93 (MQ=255) caccacTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTAt < 1:4348487/93‑1 (MQ=255) accacTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATg < 2:852338/93‑1 (MQ=255) accacTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATg < 2:1862809/93‑1 (MQ=255) ccacTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGc > 1:2599796/1‑93 (MQ=255) acTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGt < 1:3405607/93‑1 (MQ=255) acTATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGt < 1:1437345/93‑1 (MQ=255) tATGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTaa < 1:1258345/93‑1 (MQ=255) aTGAATCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAg < 1:2843068/93‑1 (MQ=255) aTGAATCTTACCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAg > 1:1577709/1‑93 (MQ=255) aaTCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGATCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGCAg < 1:2891483/93‑1 (MQ=255) aaTCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGCAg < 2:3360244/93‑1 (MQ=255) tCTTGCCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGCAGGa > 1:11378/1‑93 (MQ=255) | TAAACAGGCATGGATGATCCTGCCATACCATTCACAACATTAAGTTCGAGATTTACCCCAAGTTTAAGAACTCACACCACTATGAATCTTACCGAATTAAAGAATACGCCGGTTTCTGAGCTGATCACTCTCGGCGAAAATATGGGGCTGGAAAACCTGGCTCGTATGCGTAAGCAGGAC > NC_000913/3963951‑3964130 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |