| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,991,539 | T→C | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) |
cyaY ← b3808 → |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,991,539 | 0 | T | C | 96.6% | 456.1 / 3.6 | 147 | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) | cyaY b3808 | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/3); new base C (66/76); total (68/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.10e-01 | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTC > NC_000913/3991449‑3991628 | ccTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACtc < 1:3586451/93‑1 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACtctc > 1:4668362/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACtctc > 1:2291170/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACtctc > 1:4668363/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACtctc > 2:2278942/1‑93 (MQ=255) cAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCaaa < 1:163013/93‑1 (MQ=255) aGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAg < 2:427082/93‑1 (MQ=255) aGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAg > 1:2462252/1‑93 (MQ=255) aGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAg < 1:1825274/93‑1 (MQ=255) ggTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAgg < 2:3510556/93‑1 (MQ=255) gTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGt > 1:2394518/1‑93 (MQ=255) tCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTa > 1:4184750/1‑93 (MQ=255) tCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTa > 1:506805/1‑93 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt < 1:3886209/93‑1 (MQ=255) aaaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAAt > 1:2146268/1‑93 (MQ=255) aaaTGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGATCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATg > 1:4027393/1‑93 (MQ=255) aaTGGTGCCCGCCCTGTTTGTTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATgg < 1:2412177/93‑1 (MQ=255) agggTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGt < 2:821109/91‑1 (MQ=255) tGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTc > 1:1252294/1‑93 (MQ=255) ggTAGCCGCCCTGTTTTGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCa < 1:2788585/93‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCCTGTTTGGTTCCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAg < 1:3264483/93‑1 (MQ=255) aGCCTCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa < 2:1660555/93‑1 (MQ=255) aGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa < 1:200195/93‑1 (MQ=255) aGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa < 1:3047192/93‑1 (MQ=255) aGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa < 2:1117472/93‑1 (MQ=255) aGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGGTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTa > 1:2799636/1‑93 (MQ=255) gccgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAc > 1:2986938/1‑93 (MQ=255) ccgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcg < 1:818029/93‑1 (MQ=255) cgccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgc > 1:184550/1‑93 (MQ=255) gccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgcc > 1:2668502/1‑93 (MQ=255) gccCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgcc > 1:629964/1‑93 (MQ=255) ccTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTAcgccgc > 2:1683255/1‑93 (MQ=255) tttGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGtt > 2:4620675/1‑93 (MQ=255) gTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAtt < 2:1487721/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 1:1075057/93‑1 (MQ=255) gccagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAATGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCg > 1:2594246/1‑93 (MQ=255) ccagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGc < 2:2371762/93‑1 (MQ=255) ccacccaTGCCGGGTGCAGCGGTTCCGGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGc < 2:2371764/93‑1 (MQ=255) cagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCa < 2:3899510/93‑1 (MQ=255) gccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGt < 2:4521436/93‑1 (MQ=255) gccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGt < 2:4145840/93‑1 (MQ=255) tcaTATCTGGTGCAGCTTCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTGGATTTCGCAGTc > 2:4227143/2‑93 (MQ=255) ccaTCCCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTc < 1:347671/93‑1 (MQ=255) caTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGTTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCg < 2:4289407/93‑1 (MQ=255) tACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat < 2:3045269/93‑1 (MQ=255) tACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat < 2:1815510/93‑1 (MQ=255) tACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat > 2:2122151/1‑93 (MQ=255) tACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGat > 1:15311/1‑93 (MQ=255) ccTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTGGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGatat < 2:279954/93‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc < 1:4404906/93‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATc < 2:2042472/93‑1 (MQ=255) ggTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGc > 2:3464801/1‑93 (MQ=255) ggcggCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTg < 2:406639/89‑1 (MQ=255) gCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGt < 1:1573184/93‑1 (MQ=255) cAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGGCGATATCGCTGTc > 1:1381042/1‑93 (MQ=255) aGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCg > 2:4517769/1‑93 (MQ=255) gCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGc > 2:3811657/1‑93 (MQ=255) gCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGc > 1:2706878/1‑93 (MQ=255) cGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGcc < 1:1062209/93‑1 (MQ=255) ggCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCTCTGTCGCCa < 2:4728703/93‑1 (MQ=255) gCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCAt < 2:684832/93‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATcc > 2:3112838/1‑93 (MQ=255) catGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATccc < 1:1760417/91‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCa > 1:3413322/1‑93 (MQ=255) ggaggTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgt < 1:4259989/90‑1 (MQ=255) ggacgTTGATAAATATTTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTAAGAACGCAGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAg < 2:706013/89‑1 (MQ=255) ggCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTATGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgt > 1:1810275/1‑93 (MQ=255) gCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtc < 1:2856441/93‑1 (MQ=255) gCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtc < 1:2856440/93‑1 (MQ=255) ggTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcgt > 1:894737/1‑93 (MQ=255) ggTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcgt > 1:529176/1‑93 (MQ=255) ggTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcgt < 1:4175836/93‑1 (MQ=255) gTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcgtc > 2:1338379/1‑93 (MQ=255) gTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcgtc > 1:2656169/1‑93 (MQ=255) ttGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAgtcgtgc > 2:1835756/1‑91 (MQ=255) ttGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTcc < 1:173467/93‑1 (MQ=255) tGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCa < 1:3860028/93‑1 (MQ=255) tGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCa < 1:2424561/93‑1 (MQ=255) tGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCa < 2:2729833/93‑1 (MQ=255) tGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCa < 1:4335743/93‑1 (MQ=255) tGATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCa < 2:2430306/93‑1 (MQ=255) gATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCTCAGTCTATATCGCTGTCGCCGTCCCAGTCGTCCAg > 2:3786740/1‑93 (MQ=255) gATAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAg > 2:3786742/1‑93 (MQ=255) tAATGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGc < 2:2361162/93‑1 (MQ=255) aaTGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCg > 1:3765922/1‑93 (MQ=255) aaTGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCg > 1:1662079/1‑93 (MQ=255) aaTGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCg > 1:1288212/1‑93 (MQ=255) aTGA‑TTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGt > 1:868439/1‑93 (MQ=255) tcctgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGTCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCaa < 1:4116207/91‑1 (MQ=255) gctgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAAt < 1:2187054/93‑1 (MQ=255) gctgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAAt < 2:3379752/93‑1 (MQ=255) ctgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATg < 1:2051930/93‑1 (MQ=255) tgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATgg > 2:4574234/1‑93 (MQ=255) tgcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATgg > 1:1405419/1‑93 (MQ=255) gcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGt > 2:2467586/1‑93 (MQ=255) gcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGt > 2:228176/1‑93 (MQ=255) gcCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGt > 1:2561187/1‑93 (MQ=255) ccACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTc > 1:3791394/1‑93 (MQ=255) ccACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTc < 1:3367630/93‑1 (MQ=255) ccACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTc > 2:529329/1‑93 (MQ=255) | CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGA‑TTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTC > NC_000913/3991449‑3991628 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |