Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 4,004,812 T→C R448R (CGT→CGC recQ → ATP‑dependent DNA helicase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009134,004,8120TC98.4% 572.5 / ‑1.7 183R448R (CGT→CGCrecQATP‑dependent DNA helicase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/3);  new base C (92/88);  total (92/91)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 190 total aligned reads displayed.

TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT  >  NC_000913/4004722‑4004901
                                                                                          |                                                                                         
tCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAt                                                                                         >  1:3073577/1‑93 (MQ=255)
 cAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATc                                                                                        <  1:3324732/93‑1 (MQ=255)
 cAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATc                                                                                        <  2:4050194/93‑1 (MQ=255)
 cAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATc                                                                                        <  1:116673/93‑1 (MQ=255)
   gATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCcg                                                                                      <  2:3377242/93‑1 (MQ=255)
    aTTTCCCTTTCCACCATTGGTCCTGTGAATCAGCGGCTTGGGATGGGGTATGTGGTGGAAGTGATTCGCGGGCATAATAACCAGCTCATccac                                                                                     >  2:4039505/1‑91 (MQ=255)
    aTTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCcgc                                                                                     <  2:1441939/93‑1 (MQ=255)
       gCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGAc                                                                                  >  2:81906/1‑93 (MQ=255)
       gCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGAc                                                                                  <  2:4522968/93‑1 (MQ=255)
         ccTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTa                                                                                >  1:4646382/1‑93 (MQ=255)
          cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAt                                                                               <  1:4161609/93‑1 (MQ=255)
          cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAt                                                                               <  2:3660662/93‑1 (MQ=255)
          cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAt                                                                               <  1:2464773/93‑1 (MQ=255)
           tttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATg                                                                              <  1:57870/93‑1 (MQ=255)
               caccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCa                                                                          >  2:3898167/1‑93 (MQ=255)
                accaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCAt                                                                         >  1:4726609/1‑93 (MQ=255)
                  caTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGa                                                                       >  2:942767/1‑93 (MQ=255)
                  caTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGa                                                                       <  2:152420/93‑1 (MQ=255)
                  caTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGa                                                                       >  2:4149643/1‑93 (MQ=255)
                   aTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGAc                                                                      <  2:2927509/93‑1 (MQ=255)
                   aTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGAc                                                                      >  2:25295/1‑93 (MQ=255)
                      ggTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACaaa                                                                   <  1:3913713/93‑1 (MQ=255)
                      ggTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACaaa                                                                   <  1:4504172/93‑1 (MQ=255)
                       gTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAAc                                                                  <  2:3506001/93‑1 (MQ=255)
                       gTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAAc                                                                  >  1:4558063/1‑93 (MQ=255)
                        tCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACt                                                                 <  1:3537946/93‑1 (MQ=255)
                           tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaa                                                              >  2:2877326/1‑93 (MQ=255)
                           tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaa                                                              >  2:4744054/1‑93 (MQ=255)
                           tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGGTATGGGGTGGAAGTGATGCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACAATGGTCATGACAAACTGaa                                                              >  1:1598744/1‑93 (MQ=255)
                            gtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaaa                                                             <  1:3927079/93‑1 (MQ=255)
                              gAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGt                                                           <  2:601090/93‑1 (MQ=255)
                               aaTCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGCGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTc                                                          >  2:2278233/1‑93 (MQ=255)
                                aTCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCt                                                         >  1:3662809/1‑93 (MQ=255)
                                aTCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCt                                                         <  1:2621199/93‑1 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        <  2:2832508/93‑1 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        <  2:2190707/93‑1 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        <  2:2920580/93‑1 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        >  1:1146236/1‑93 (MQ=255)
                                   aGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATg                                                      >  1:1087669/1‑93 (MQ=255)
                                   aGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATg                                                      <  1:1956932/93‑1 (MQ=255)
                                   aGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATg                                                      <  1:3868620/93‑1 (MQ=255)
                                      ggTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATggaa                                                   >  2:1116426/1‑91 (MQ=255)
                                       gTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAt                                                  <  2:3080861/93‑1 (MQ=255)
                                       gTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAt                                                  >  2:2439122/1‑93 (MQ=255)
                                         ttGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATgg                                                <  1:1880872/93‑1 (MQ=255)
                                         ttGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATgg                                                <  2:4656096/93‑1 (MQ=255)
                                          tGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATggc                                               >  2:4682226/1‑92 (MQ=255)
                                          tGGGATGGGTTATGTGGGGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATggg                                               >  1:706702/1‑93 (MQ=255)
                                              aTGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGt                                           <  2:112708/93‑1 (MQ=255)
                                               tGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTg                                          >  2:3827839/1‑93 (MQ=255)
                                                gggTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCCGCGCATCCGCAACTATGGTCATGACAAACTGACAGTCTATGGCATGGGCCGTGa                                         >  1:1334094/1‑93 (MQ=255)
                                                gggTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGa                                         >  2:3179746/1‑93 (MQ=255)
                                                  gTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATa                                       >  1:2112125/1‑93 (MQ=255)
                                                    tATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaa                                     <  2:677648/93‑1 (MQ=255)
                                                    tATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaa                                     <  2:726969/93‑1 (MQ=255)
                                                    tATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaa                                     <  1:4685464/93‑1 (MQ=255)
                                                     aTGTGGTGGAAGTTATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaaa                                    >  2:2323767/1‑93 (MQ=255)
                                                     aTGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaaa                                    <  1:4549260/93‑1 (MQ=255)
                                                       gtggtgGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGc                                  <  1:2190723/93‑1 (MQ=255)
                                                       gtggtgGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGc                                  <  1:62010/93‑1 (MQ=255)
                                                        tggtggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGcc                                 >  1:3157295/1‑93 (MQ=255)
                                                         ggtggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCa                                <  1:1891762/93‑1 (MQ=255)
                                                           tggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATg                              >  2:2657793/1‑93 (MQ=255)
                                                             gAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGaa                            <  1:2340232/93‑1 (MQ=255)
                                                              aaGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAc                           >  2:3034833/1‑93 (MQ=255)
                                                              aaGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAc                           <  2:858648/93‑1 (MQ=255)
                                                               aGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACa                          <  2:1067195/93‑1 (MQ=255)
                                                                 tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTTATAAAAGCCATGAACAtt                        >  2:1311917/1‑93 (MQ=255)
                                                                 tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAtt                        >  2:2756953/1‑93 (MQ=255)
                                                                 tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAtt                        >  2:4243914/1‑93 (MQ=255)
                                                                  gATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTg                       >  1:1254970/1‑93 (MQ=255)
                                                                  gATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTg                       >  2:541897/1‑93 (MQ=255)
                                                                  gATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTg                       >  1:4364759/1‑93 (MQ=255)
                                                                   aTTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTgg                      >  1:4315915/1‑93 (MQ=255)
                                                                   aTTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTgg                      >  2:1984117/1‑93 (MQ=255)
                                                                    ttCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTggg                     >  1:4201999/1‑93 (MQ=255)
                                                                    ttCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTggg                     <  1:1564912/93‑1 (MQ=255)
                                                                       gtggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGa                  <  1:4062066/93‑1 (MQ=255)
                                                                         ggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGc                <  2:3065412/93‑1 (MQ=255)
                                                                          gtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCg               <  2:1253298/93‑1 (MQ=255)
                                                                            gCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTg             <  2:4586847/93‑1 (MQ=255)
                                                                            gCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTg             >  1:1826188/1‑93 (MQ=255)
                                                                              taataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAt           >  1:3403581/1‑93 (MQ=255)
                                                                              taataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAt           >  1:4125087/1‑93 (MQ=255)
                                                                              taataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAt           >  1:3843157/1‑93 (MQ=255)
                                                                              taataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAt           <  2:3675862/93‑1 (MQ=255)
                                                                               aataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATc          >  1:200402/1‑93 (MQ=255)
                                                                               aataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATc          >  2:4710589/1‑93 (MQ=255)
                                                                               aataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATc          >  2:1447082/1‑93 (MQ=255)
                                                                                ataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGACATGACAAACTGGAAGTCTATGGCATGGGCCGGTATAAAAGCCATGAACATTGGGTGCGCGCGAttc         >  2:3103789/1‑91 (MQ=255)
                                                                                 taaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCg        <  1:3773858/93‑1 (MQ=255)
                                                                                 taaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCg        >  1:2474784/1‑93 (MQ=255)
                                                                                  aaCCAGCGCATCCGAGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGc       >  1:2317809/1‑93 (MQ=255)
                                                                                   aCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGcc      <  1:424609/93‑1 (MQ=255)
                                                                                   aCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGcc      <  2:3901249/93‑1 (MQ=255)
                                                                                   aCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGcc      <  2:1571241/93‑1 (MQ=255)
                                                                                    ccAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCa     >  2:618932/1‑93 (MQ=255)
                                                                                    ccAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCa     <  1:2137854/93‑1 (MQ=255)
                                                                                     cAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAg    <  1:3085415/93‑1 (MQ=255)
                                                                                      aGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGc   >  1:985471/1‑93 (MQ=255)
                                                                                          |                                                                                         
TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT  >  NC_000913/4004722‑4004901

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: