Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,021,493 | C→T | A121A (GCC→GCT) A117A (GCC→GCT) |
tatD → b4556 → |
Mg‑dependent DNase hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,021,493 | 0 | C | T | 98.3% | 614.6 / ‑2.2 | 176 | A121A (GCC→GCT) A117A (GCC→GCT) | tatD b4556 | Mg‑dependent DNase hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base T (79/94); total (80/96) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.79e-01 |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
GGCGATTGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCCGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTGGATAAACTGCC > NC_000913/4021403‑4021582 | ggCGATTGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATtgctgc > 1:2955455/1‑93 (MQ=255) gCGATTGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCa < 2:1984942/93‑1 (MQ=255) gCGATTGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCa < 2:4721086/93‑1 (MQ=255) cGATTGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAg > 2:3346507/1‑93 (MQ=255) aTTGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGAt < 1:1007080/93‑1 (MQ=255) aTTGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACACCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGAt < 2:3584650/93‑1 (MQ=255) ttGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGAtt > 2:3273712/1‑93 (MQ=255) ttGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGAtt > 2:213901/1‑93 (MQ=255) ttGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGAtt < 2:1670790/93‑1 (MQ=255) ttGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTGCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGAtt < 2:2723992/93‑1 (MQ=255) gTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTaa > 1:1338034/1‑93 (MQ=255) tGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTaaa > 2:4363797/1‑93 (MQ=255) tGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTaaa > 2:798255/1‑93 (MQ=255) aaTGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACa < 1:577616/93‑1 (MQ=255) aTGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACAt < 2:1878872/93‑1 (MQ=255) aTGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACAt < 1:3477923/93‑1 (MQ=255) aTGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACAt > 1:1022086/1‑93 (MQ=255) gtgGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGc < 2:4714546/93‑1 (MQ=255) gtgGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGc < 1:412985/93‑1 (MQ=255) tgGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGcc > 1:2888865/1‑93 (MQ=255) tgGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGcc < 2:3944949/93‑1 (MQ=255) gTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCgg < 2:399937/93‑1 (MQ=255) gTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCgg < 2:1092647/93‑1 (MQ=255) tcGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACTTGCCGGTAt < 2:3141942/93‑1 (MQ=255) tcGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTAt > 2:1722124/1‑93 (MQ=255) gACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTAttt > 1:1365701/1‑93 (MQ=255) cTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTAt < 1:2877346/93‑1 (MQ=255) ttAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGc > 1:2034478/1‑93 (MQ=255) ttAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGc < 1:636597/93‑1 (MQ=255) ttAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCCGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGc < 1:4500837/93‑1 (MQ=255) cGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGt < 1:1805046/93‑1 (MQ=255) gCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTc > 1:1058042/1‑93 (MQ=255) cAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTcg > 2:1586775/1‑93 (MQ=255) caCTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTcgc < 2:1186020/92‑1 (MQ=255) cTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGa < 1:4027637/93‑1 (MQ=255) cTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGa > 2:58371/1‑93 (MQ=255) cTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGa > 2:386482/1‑93 (MQ=255) ttttCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGAt < 2:181206/93‑1 (MQ=255) ttttCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGAt < 1:3438950/93‑1 (MQ=255) tttCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATg < 2:3185614/93‑1 (MQ=255) tCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGcc < 1:4463677/93‑1 (MQ=255) cGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGccc < 2:1382912/93‑1 (MQ=255) gACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCa > 1:224940/1‑93 (MQ=255) gACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCa < 2:3595433/93‑1 (MQ=255) gACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCa < 1:2511437/93‑1 (MQ=255) aCGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCAc < 2:3112760/93‑1 (MQ=255) aCGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCAc < 1:4541423/93‑1 (MQ=255) aCGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCAc < 1:920734/93‑1 (MQ=255) cGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACg > 1:3352012/1‑93 (MQ=255) gCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGa < 1:4306037/93‑1 (MQ=255) gCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGa > 2:2476643/1‑93 (MQ=255) gCCAGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGa > 1:2529897/1‑93 (MQ=255) cGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGc < 1:2076026/93‑1 (MQ=255) gAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCgg > 2:1142374/1‑93 (MQ=255) aaGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGt > 2:3627546/1‑93 (MQ=255) agagCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCggct > 2:4231515/1‑91 (MQ=255) agagCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGtt > 2:2680129/1‑93 (MQ=255) gagCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGttt > 2:3140996/1‑93 (MQ=255) aaccAGGAACGCTCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGttt < 2:2269586/90‑1 (MQ=255) gCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGATACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTAt > 1:1452226/1‑93 (MQ=255) cAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATg < 2:4644080/93‑1 (MQ=255) aGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGGTGCCCACGAGCGGTTTATGa > 2:4277698/1‑93 (MQ=255) aGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGa > 2:1258011/1‑93 (MQ=255) aGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGa > 1:17434/1‑93 (MQ=255) aGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGa < 1:326077/93‑1 (MQ=255) ggAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGAc > 1:1555962/1‑93 (MQ=255) ggAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGAc < 1:1179153/93‑1 (MQ=255) ggAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGAc > 1:512189/1‑93 (MQ=255) ggAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGAc > 2:374196/1‑93 (MQ=255) aCGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACAtt < 2:3683575/93‑1 (MQ=255) cgcgCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTg > 1:4247337/1‑93 (MQ=255) cTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTgg > 1:3739279/1‑93 (MQ=255) cTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTgg < 2:4253533/93‑1 (MQ=255) cTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTgg < 1:2799872/93‑1 (MQ=255) cTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTgg > 1:3959956/1‑93 (MQ=255) ttttGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGa < 2:2952154/93‑1 (MQ=255) ttttGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGa > 2:1698609/1‑93 (MQ=255) ttttGTTGCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGa > 2:348814/1‑93 (MQ=255) ttgttgCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGc < 2:3453817/93‑1 (MQ=255) tgttgCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGcc < 1:3073817/93‑1 (MQ=255) tgttgCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGcc < 2:2788387/93‑1 (MQ=255) ttgCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGt < 2:4547130/93‑1 (MQ=255) ttgCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGt < 1:1250250/93‑1 (MQ=255) tgCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTg < 1:2647671/93‑1 (MQ=255) tgCCCAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTg < 2:2733630/93‑1 (MQ=255) cccAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGc < 1:3113196/93‑1 (MQ=255) cccAGCTACGCATTGCCGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGc < 2:3312845/93‑1 (MQ=255) cAGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTg < 1:2154549/93‑1 (MQ=255) aGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTgg > 2:4130723/1‑93 (MQ=255) aGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTgg > 2:4471129/1‑93 (MQ=255) aGCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTgg > 2:1438392/1‑93 (MQ=255) gCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTGGa < 2:4500008/93‑1 (MQ=255) gCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTGGa > 1:4617134/1‑93 (MQ=255) gCTACGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTGGa > 1:2117533/1‑93 (MQ=255) aCGCATTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTGGAtta > 2:1955042/1‑91 (MQ=255) aTTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTGGATAAACTg < 2:1014325/93‑1 (MQ=255) aTTGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTGGATAAACTg > 2:1321891/1‑93 (MQ=255) ttGCTGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTGGATAAACTGc > 2:1769969/1‑93 (MQ=255) tgctgcAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTGGATAAACTGcc < 1:715343/93‑1 (MQ=255) tgctgcAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTGGATAAACTGcc < 2:4635735/93‑1 (MQ=255) | GGCGATTGGTGAATGTGGTCTCGACTTTAACCGCAACTTTTCGACGCCGGAAGAGCAGGAACGCGCTTTTGTTGCCCAGCTACGCATTGCCGCAGATTTAAACATGCCGGTATTTATGCACTGTCGCGATGCCCACGAGCGGTTTATGACATTGCTGGAGCCGTGGCTGGATAAACTGCC > NC_000913/4021403‑4021582 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |