| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,356,994 | C→T | A206T (GCA→ACA) | cadB ← | transport of lysine/cadaverine |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,356,994 | 0 | C | T | 99.1% | 772.2 / ‑4.6 | 221 | A206T (GCA→ACA) | cadB | transport of lysine/cadaverine |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base T (108/111); total (108/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
TGTAAACAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGCGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTATTCCAGTTAG > NC_000913/4356904‑4357083 | tGTAAACAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTgg > 2:768255/1‑93 (MQ=255)tGTAAACAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTgg > 1:2823521/1‑93 (MQ=255)tGTAAACAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTgg > 2:173543/1‑93 (MQ=255)tGTAAACAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTgg > 2:2611923/1‑93 (MQ=255)tGTAAACAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTgg > 1:2107154/1‑93 (MQ=255) tAAACAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGAt > 1:2292176/1‑93 (MQ=255) tAAACAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGAt > 1:3264357/1‑93 (MQ=255) tAAACAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGAt < 2:2168588/93‑1 (MQ=255) tAAACAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGAt > 2:4586167/1‑93 (MQ=255) aaaCAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGAtt > 1:3564916/1‑93 (MQ=255) aaaCAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGAtt > 2:1144087/1‑93 (MQ=255) aaCAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTc < 2:1260316/93‑1 (MQ=255) aaCAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTc > 1:1241179/1‑93 (MQ=255) cAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTcta > 2:4726610/1‑91 (MQ=255) aaTACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAac < 1:2951740/93‑1 (MQ=255) aTACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAaca > 2:3036462/1‑93 (MQ=255) aaCCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAacac < 2:3771953/92‑1 (MQ=255) aCCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACAcc < 2:333629/93‑1 (MQ=255) ccTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATGCCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACAccc < 2:331541/93‑1 (MQ=255) ccTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACAccc > 2:2149983/1‑93 (MQ=255) cTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCa > 2:2896368/1‑93 (MQ=255) cTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCa < 1:843518/93‑1 (MQ=255) cTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCa < 1:4031528/93‑1 (MQ=255) cTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTGGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATCCCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCa < 2:4490935/93‑1 (MQ=255) tGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCAc > 1:1167700/1‑93 (MQ=255) tGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCAc < 2:1251373/93‑1 (MQ=255) tGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCAc > 2:649173/1‑93 (MQ=255) tGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCAc > 1:369874/1‑93 (MQ=255) tGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCAc > 1:2889782/1‑93 (MQ=255) aaaCCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAg > 1:15644/1‑93 (MQ=255) aaaCCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAg < 1:1654703/93‑1 (MQ=255) aaaCCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTAGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACTCACGAAg > 2:2221659/1‑93 (MQ=255) aaCCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAgg > 1:657981/1‑93 (MQ=255) aCCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGc > 1:2530229/1‑93 (MQ=255) gTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCcac > 1:2657911/1‑93 (MQ=255) tACCCAGCCTGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCcaca < 2:3957793/93‑1 (MQ=255) tACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCcaca > 1:718530/1‑93 (MQ=255) ccAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGgc < 1:782117/93‑1 (MQ=255) ccAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAACTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGgc > 2:3573717/1‑93 (MQ=255) ccAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGGTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGgc > 1:620819/1‑93 (MQ=255) aGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGgcag > 1:48429/1‑93 (MQ=255) gCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGgcagg > 2:340213/1‑92 (MQ=255) cATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGgcagag < 1:2176476/93‑1 (MQ=255) cATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGgcagag < 1:1893701/93‑1 (MQ=255) tGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGgcagagca > 2:3704486/1‑93 (MQ=255) tGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGgcagagca > 1:1951412/1‑93 (MQ=255) tGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGgcagagca > 1:3905757/1‑93 (MQ=255) gTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGgcagagcaga < 2:2060769/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGaa < 1:205393/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGaa < 1:1824152/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGaa < 2:834780/93‑1 (MQ=255) tGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAAt > 1:4562392/1‑93 (MQ=255) tGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAAt < 2:1705531/93‑1 (MQ=255) gCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATa < 1:322335/93‑1 (MQ=255) aGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACtt < 1:518411/93‑1 (MQ=255) gCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACttt > 2:3907911/1‑93 (MQ=255) gCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACttt < 2:3014354/93‑1 (MQ=255) gCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACttt < 1:379008/93‑1 (MQ=255) ggAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTa < 1:1324427/93‑1 (MQ=255) gAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTaa < 1:3044177/93‑1 (MQ=255) gAACGGGACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTCCTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTaa > 2:344967/1‑93 (MQ=255) aaCGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAAt < 1:1002043/93‑1 (MQ=255) aCGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATg > 2:2281558/1‑93 (MQ=255) ggTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGAt > 2:3535857/1‑93 (MQ=255) ggTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGAt > 1:3615559/1‑93 (MQ=255) gTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATc > 2:1463122/1‑93 (MQ=255) tACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCg < 2:1754910/93‑1 (MQ=255) tcGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGc < 1:4594944/92‑1 (MQ=255) aCGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGc > 1:451242/1‑93 (MQ=255) gTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCAt < 2:2016126/93‑1 (MQ=255) gTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCAt > 2:669653/1‑93 (MQ=255) tttCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATg > 2:2763090/1‑93 (MQ=255) tCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGAc > 1:4644756/1‑93 (MQ=255) gggTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCa > 2:854980/1‑93 (MQ=255) ggTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCAt < 1:4647622/93‑1 (MQ=255) ggTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCAt < 1:946461/93‑1 (MQ=255) gTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGGTTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATc > 1:2053556/1‑93 (MQ=255) gTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATc < 2:3136309/93‑1 (MQ=255) ttttAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAg < 2:4677832/93‑1 (MQ=255) tttAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGt < 1:1518787/93‑1 (MQ=255) ttAACCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTg < 1:2633664/93‑1 (MQ=255) tAACAATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGGATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTgg > 2:2873748/1‑93 (MQ=255) aaCCATACCAGTACTTACAGCTGCGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGt < 2:1557363/93‑1 (MQ=255) aCCATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTa < 2:1083411/93‑1 (MQ=255) ccATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTAt < 2:4430544/93‑1 (MQ=255) cATACCAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATc > 1:3403252/1‑93 (MQ=255) ccAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCa < 1:904575/93‑1 (MQ=255) cAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAg > 1:2641961/1‑93 (MQ=255) cAGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAg > 2:538075/1‑93 (MQ=255) aGTACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGt > 2:2412944/1‑93 (MQ=255) tACTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTAt > 2:362930/1‑93 (MQ=255) aCTTACAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTAtt > 1:3164191/1‑93 (MQ=255) cAGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTATTCCAGt > 1:2345809/1‑93 (MQ=255) aaGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTATTCCAGt < 2:4340039/92‑1 (MQ=255) aGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTATTCCAGtt < 2:2105131/93‑1 (MQ=255) aGCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTATTCCAGtt > 2:898423/1‑93 (MQ=255) gCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTATTCCATTTa > 1:4075480/1‑93 (MQ=255) gCTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTATTCCAGTTa > 2:2491139/1‑93 (MQ=255) cTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTATTCCAGTTAg > 2:1741832/1‑93 (MQ=255) cTGTGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTATTCCAGTTAg > 2:1178817/1‑93 (MQ=255) | TGTAAACAATACCTGCTAAACCAGTACCCAGCATGGTTGCCAGCGGAACGGTACGTTTCGGGTTTTTAACCATACCAGTACTTACAGCTGCGGATTCAACACCCACGAAGGCCCACAGGCAGAGCAGAATACTTTTAATGATCGCATGACCATCAGTGGTATCCGCAGTATTCCAGTTAG > NC_000913/4356904‑4357083 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |