| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 629,933 | T→C | W273R (TGG→CGG) | cstA → | carbon starvation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 629,933 | 0 | T | C | 98.9% | 270.4 / ‑4.7 | 91 | W273R (TGG→CGG) | cstA | carbon starvation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (43/47); total (43/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.23e-01 | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGC > NC_000913/629844‑630022 | cGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGt < 1:314447/93‑1 (MQ=255)cGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGt < 2:1834115/93‑1 (MQ=255) gccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTa < 2:1994350/92‑1 (MQ=255) ccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAc > 1:2977090/1‑93 (MQ=255) ccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAc > 2:3673782/1‑93 (MQ=255) cTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAct < 1:4510996/93‑1 (MQ=255) tGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTTctg > 2:1819267/1‑93 (MQ=255) ggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgct < 1:4036475/93‑1 (MQ=255) gCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgctg < 2:730098/93‑1 (MQ=255) cACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTgg > 2:181383/1‑93 (MQ=255) cACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTgg > 2:181384/1‑93 (MQ=255) aCCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGc > 2:573972/1‑93 (MQ=255) ccGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTActgcttggc > 2:171698/1‑89 (MQ=255) gTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGcccc < 2:4234474/93‑1 (MQ=255) gTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGcccc < 2:3091317/93‑1 (MQ=255) cTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCcgcg < 2:2325199/93‑1 (MQ=255) tttGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑t < 2:3500704/93‑1 (MQ=255) ttGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGTCCCCCG‑Tg > 2:495247/1‑93 (MQ=255) tGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGCCCCGCG‑TGa > 1:1403443/1‑93 (MQ=255) gACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGCCCCGCG‑TGAc > 2:1279661/1‑93 (MQ=255) cTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGGTGCGGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGGG‑GGACtc > 1:1462094/1‑92 (MQ=255) cTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGCTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑Tgcata > 1:4578423/1‑89 (MQ=255) tttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGGCCCGCG‑TGACTAc > 2:1569364/1‑93 (MQ=255) tttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑GGACTAc > 1:621697/1‑93 (MQ=255) ttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGGGCGGGTACTCGTGGCCCCGCG‑GGACTAcc > 2:962242/1‑93 (MQ=255) tACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACct > 1:3317707/1‑93 (MQ=255) aCCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACctc < 2:2768856/93‑1 (MQ=255) cGGCGTGCGGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACctctc < 1:830037/93‑1 (MQ=255) cGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACctctc < 1:1835465/93‑1 (MQ=255) cGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACctctc < 1:155058/93‑1 (MQ=255) gTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTAcc < 2:1174197/93‑1 (MQ=255) gTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTAcc > 2:3011758/1‑93 (MQ=255) gTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGGGCGGTTACTGGTGGCCCCGCG‑GGACTACCTGTCTAcc > 2:1115679/1‑93 (MQ=255) tGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTAACTCTCTACCt > 2:2783102/1‑93 (MQ=255) cAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTc > 1:283354/1‑93 (MQ=255) cAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTc < 1:3446198/93‑1 (MQ=255) gTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGGCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACcctcct > 2:4199173/1‑93 (MQ=255) gTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCt > 1:3284866/1‑93 (MQ=255) ttGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGGCCCGCG‑TGACTACCTCTCTAACTTCCTg > 2:2492577/1‑93 (MQ=255) ttGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTg < 2:4269887/93‑1 (MQ=255) ttGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTg < 1:4012266/93‑1 (MQ=255) tGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGa < 2:1923366/93‑1 (MQ=255) gACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCC‑TGGCTACCTCTCTCCCTTCCTGaa > 1:4022762/1‑93 (MQ=255) aCCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGaaa > 1:462133/1‑93 (MQ=255) aCCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGACCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGaaa > 1:557999/1‑93 (MQ=255) ccTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGaaaa < 1:3684457/93‑1 (MQ=255) cTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAAt < 2:3263456/93‑1 (MQ=255) tGGATGGTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATc < 1:3650379/93‑1 (MQ=255) tGGATGCTGGTGTGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATc > 2:3037763/1‑93 (MQ=255) tGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTATCTTCCTGAAAATc > 2:125174/1‑93 (MQ=255) tGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGaaaaac > 1:1914332/1‑91 (MQ=255) tGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATc > 1:182458/1‑93 (MQ=255) ggATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCg > 1:2247288/1‑93 (MQ=255) gATGCTGGTTGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTCCCTCTCTACCTTCCTGAAAATCgg < 2:3818012/93‑1 (MQ=255) gATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCgg > 2:3647543/1‑93 (MQ=255) gATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCgg < 2:4712728/93‑1 (MQ=255) gATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGCGGGTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCgg > 2:4066352/1‑93 (MQ=255) aTGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCggg < 2:3118160/93‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGa < 2:3680577/93‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGa < 2:3680576/93‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGa > 1:2733190/1‑93 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTCTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTGCCTTCCTGAAAATCGGGa < 2:1955532/93‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGAc < 2:204278/93‑1 (MQ=255) gCTGGTGCGGTACGGTTTTGTGTCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAAGCGGGAc < 2:499583/93‑1 (MQ=255) tggtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTa > 1:3116941/1‑93 (MQ=255) tggtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTa > 1:3364487/1‑93 (MQ=255) ggtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGCGGACT‑CCTCTCTCCCTTCCTGCAAATCAGGACtct > 1:2602509/1‑91 (MQ=255) ggtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAt < 1:549129/93‑1 (MQ=255) gtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtc < 2:2891494/93‑1 (MQ=255) tggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcg > 1:2939111/1‑93 (MQ=255) gTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgtcg > 1:2787022/1‑93 (MQ=255) tACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGt > 2:2666590/1‑93 (MQ=255) tACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGt > 2:556309/1‑93 (MQ=255) aCGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTc < 2:4373689/93‑1 (MQ=255) cGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCt < 1:3158395/93‑1 (MQ=255) cGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCt < 2:2188179/93‑1 (MQ=255) ttttGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGc < 1:4062698/93‑1 (MQ=255) ttttGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGc < 2:3868085/93‑1 (MQ=255) ttttGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGc < 2:384089/93‑1 (MQ=255) ttttGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTAACTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGc > 1:4594133/1‑93 (MQ=255) ttatgGCGACGATGCTGCCGGTGCGGTTACTACAGGCCAAGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGACAATCAGGACTATCGTCGGTCTGGCgg < 2:4222727/90‑1 (MQ=255) ttGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCgg > 1:1373769/1‑93 (MQ=255) ttGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCgg < 2:3485173/93‑1 (MQ=255) tgtgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGt < 1:1032451/93‑1 (MQ=255) tggggcggcGGTGCTCCCGGTGCGGTTACTGCGGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTCCCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGt < 2:1091306/90‑1 (MQ=38) gtgGCGGCGGGGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTa > 1:4286058/1‑93 (MQ=255) tgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAg < 2:2365637/93‑1 (MQ=255) tgGCGGCGGCGCGGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCCCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAg < 2:3997214/93‑1 (MQ=255) gcggcgGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGc < 2:1523208/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCAGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAtttt > 2:2732891/1‑93 (MQ=255) gTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTTGGCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTg > 2:1523778/1‑93 (MQ=255) gTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTg > 2:1523777/1‑93 (MQ=255) tgctgcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGa > 1:1509934/1‑93 (MQ=255) gctgcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGAt < 1:3104562/93‑1 (MQ=255) gcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTAt > 2:990436/1‑93 (MQ=255) gcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTAt > 2:1735140/1‑93 (MQ=255) gcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTAt < 2:3168148/93‑1 (MQ=255) ggTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGAATTTTGATTATgcg > 1:838801/1‑93 (MQ=255) gtgcGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATgcgc > 1:3634480/1‑93 (MQ=255) gtgcGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATgcgc > 1:2814062/1‑93 (MQ=255) | CGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCG‑TGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGC > NC_000913/629844‑630022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |