Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,057,390 | C→T | G28G (GGC→GGT) | torC → | trimethylamine N‑oxide reductase, cytochrome c‑type subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,057,390 | 0 | C | T | 96.6% | 590.3 / 3.4 | 178 | G28G (GGC→GGT) | torC | trimethylamine N‑oxide reductase, cytochrome c‑type subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/4); new base T (91/81); total (93/85) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.89e-01 |
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
GGGGTTATTATGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGCATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCAACCGGTGTA > NC_000913/1057298‑1057479 | ggggTTATTATGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGCTTGTGATTGGc > 1:2825865/1‑93 (MQ=255) gTTATTATGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTAtt < 2:2959175/93‑1 (MQ=255) gTTATTATGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTAtt > 2:2402786/1‑93 (MQ=255) ttattaTGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTg > 2:739610/1‑93 (MQ=255) ttattaTGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGCATTg > 1:4104179/1‑93 (MQ=255) tattatGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTgc < 2:2937449/93‑1 (MQ=255) tattatGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTgc < 1:1711175/93‑1 (MQ=255) attatGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTgcg > 1:4002919/1‑93 (MQ=255) attatGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTgcg > 2:42946/1‑93 (MQ=255) ttatGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGCATTgcgc > 2:4137538/1‑93 (MQ=255) ttatGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGCGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTgcgc > 1:3624415/1‑93 (MQ=255) ttatGCGGAAACCCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGCATTgcgc < 1:508897/93‑1 (MQ=255) gCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGAt > 1:382689/1‑93 (MQ=255) ggAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTg < 2:3916542/93‑1 (MQ=255) gAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGCCCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGt < 2:1275755/93‑1 (MQ=255) gAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGt < 2:3627986/93‑1 (MQ=255) aCTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTAtt < 1:195698/93‑1 (MQ=255) aCTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTAtt < 2:1224840/93‑1 (MQ=255) tctGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGc > 2:4256383/1‑93 (MQ=255) ctGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGcc < 2:2945761/93‑1 (MQ=255) tGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGccc > 2:1621589/1‑92 (MQ=255) tGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCca < 1:1281482/93‑1 (MQ=255) ggAATGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCcac > 2:2595925/1‑93 (MQ=255) gAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCcaca < 1:2592412/93‑1 (MQ=255) gAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCcaca > 1:4350458/1‑93 (MQ=255) gAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCcaca < 1:1811290/93‑1 (MQ=255) aaCGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCacac > 2:3934176/1‑93 (MQ=255) aCGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACg > 2:3265905/1‑93 (MQ=255) gcgcTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGtt < 2:3368579/93‑1 (MQ=255) gcgcTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGtt > 2:2140088/1‑93 (MQ=255) gcgcTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGtt > 1:3778542/1‑93 (MQ=255) cgcTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTg < 1:1546317/93‑1 (MQ=255) cTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGCATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTggg < 2:3724887/93‑1 (MQ=255) aCGCCGCCCCAGTGCTCGTTGGTCGTGACTGGCGCTGGTCGTAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGAt < 2:2064199/93‑1 (MQ=255) aCGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGAt > 2:4472013/1‑93 (MQ=255) aCGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGAt < 1:3763247/93‑1 (MQ=255) cGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATc < 1:892551/93‑1 (MQ=255) cGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATc > 2:4185645/1‑93 (MQ=255) ccGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCaa > 1:3303528/1‑93 (MQ=255) cGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCaaa > 1:1633565/1‑93 (MQ=255) cGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCaaa < 1:2078670/93‑1 (MQ=255) gACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAg > 1:2547448/1‑93 (MQ=255) aCCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGt > 1:103391/1‑93 (MQ=255) aCCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGt > 1:3954144/1‑93 (MQ=255) cccAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTc > 1:4521960/1‑93 (MQ=255) cccAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTc > 1:2042739/1‑93 (MQ=255) cAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCAc > 2:4415812/1‑93 (MQ=255) gTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCa > 1:2849569/1‑93 (MQ=255) gTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCa > 1:2378023/1‑93 (MQ=255) gTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCa > 1:1936848/1‑93 (MQ=255) gCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGc < 2:1380325/93‑1 (MQ=255) cTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGca < 2:572447/93‑1 (MQ=255) tCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGcac > 2:2961609/1‑93 (MQ=255) tCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGcac > 2:92602/1‑93 (MQ=255) tCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGCATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGcac < 2:2337099/93‑1 (MQ=255) tCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAACTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCTCCAGcac > 2:1970272/1‑93 (MQ=255) gTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACaa > 2:3572267/1‑93 (MQ=255) ttGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAAc > 2:1450859/1‑93 (MQ=255) ttGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAAc < 1:584518/93‑1 (MQ=255) ttGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAAc > 1:2584317/1‑93 (MQ=255) tCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGaa < 2:2216084/93‑1 (MQ=255) cGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAAt < 1:3424107/93‑1 (MQ=255) gTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAGCCGAAttt < 2:3310558/93‑1 (MQ=255) tACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAAtttt < 2:2904884/93‑1 (MQ=255) tACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAAtttt < 1:104185/93‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTtgt < 1:2490971/93‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTtgtg > 1:3525496/1‑93 (MQ=255) gcgcTGGTGGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTc < 2:483291/93‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTc < 2:2649861/93‑1 (MQ=255) cgcTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCa < 2:1770917/93‑1 (MQ=255) cTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGt < 1:2727756/93‑1 (MQ=255) tGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGtt < 1:4704008/93‑1 (MQ=255) ggTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTg > 1:4598190/1‑93 (MQ=255) gTCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGc > 1:2986203/1‑93 (MQ=255) tCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGcc < 1:2136344/93‑1 (MQ=255) tCGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGcc < 2:325934/93‑1 (MQ=255) cGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCca < 2:2622345/93‑1 (MQ=255) cGCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCca < 1:3261254/93‑1 (MQ=255) gCAATTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCcac > 2:2499847/1‑93 (MQ=255) aaTTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAg > 1:1064064/1‑93 (MQ=255) aTTGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGt > 1:714987/1‑93 (MQ=255) ttGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTa < 2:4542226/93‑1 (MQ=255) ttGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTa > 1:3036229/1‑93 (MQ=255) ttGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTa < 2:948631/93‑1 (MQ=255) ttGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTa > 1:3585264/1‑93 (MQ=255) ttGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTa > 2:1452147/1‑93 (MQ=255) tGGGATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTAt < 2:3538175/93‑1 (MQ=255) gggATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATg > 2:3206086/1‑93 (MQ=255) gggATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATg > 2:1737891/1‑93 (MQ=255) ggATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGc > 1:3349777/1‑93 (MQ=255) gATTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCa > 1:49789/1‑93 (MQ=255) aTTGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCaa > 1:3379052/1‑93 (MQ=255) ttGTGATTGGTATTTCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCAAc < 1:1898994/93‑1 (MQ=255) ttGTGATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCAAc > 2:2274217/1‑93 (MQ=255) tgtgATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCAAcc < 2:4655004/93‑1 (MQ=255) tgATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCAACCgg > 1:1103890/1‑93 (MQ=255) gATTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCAACCGgt > 1:4278664/1‑93 (MQ=255) aTTGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCAACCGgtg > 1:1995537/1‑93 (MQ=255) ttGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCAACCGgtgt > 1:3647951/1‑93 (MQ=255) tGGTATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCAACCGGTGTa < 2:1033722/93‑1 (MQ=255) | GGGGTTATTATGCGGAAACTCTGGAACGCGCTACGCCGACCCAGTGCTCGTTGGTCGGTACTGGCGCTGGTCGCAATTGGGATTGTGATTGGCATTGCGCTGATTGTATTGCCACACGTTGGGATCAAAGTCACCAGCACAACCGAATTTTGTGTCAGTTGCCACAGTATGCAACCGGTGTA > NC_000913/1057298‑1057479 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |