Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,127,778 | C→T | G239G (GGC→GGT) | mviN → | putative virulence factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,127,778 | 0 | C | T | 98.0% | 511.2 / ‑1.9 | 151 | G239G (GGC→GGT) | mviN | putative virulence factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/0); new base T (66/82); total (69/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.31e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 |
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
AAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCG > NC_000913/1127689‑1127866 | agaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGtct > 2:806911/1‑93 (MQ=255) agaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGtct > 2:3394197/1‑93 (MQ=255) gaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGGAATGCGCGGGGGGTAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGtctc > 1:1016990/1‑93 (MQ=255) gaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGtctc > 1:1027595/1‑93 (MQ=255) gaTCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGtctc > 1:4165163/1‑93 (MQ=255) cGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCtgt < 1:236737/93‑1 (MQ=255) ggCATGCTGGTCGTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCtgtg < 1:1466389/93‑1 (MQ=255) ggCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCtgtg < 2:1524143/93‑1 (MQ=255) gCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGa < 1:1245169/93‑1 (MQ=255) gCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGa < 1:2597325/93‑1 (MQ=255) gCAGGCTGGTCCTGCCGCGGATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGa < 1:3567520/93‑1 (MQ=255) aTGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGc > 2:881422/1‑93 (MQ=255) aTGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGc > 1:4099606/1‑93 (MQ=255) tGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCGACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGcc < 2:1307408/93‑1 (MQ=255) tGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGcc < 2:2012541/93‑1 (MQ=255) tGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATTGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGa < 1:3492412/93‑1 (MQ=255) ggTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGAt < 2:1807211/93‑1 (MQ=255) cTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTcc < 1:3278166/93‑1 (MQ=255) tGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCt > 1:2288864/1‑93 (MQ=255) tGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCt < 1:1801234/93‑1 (MQ=255) gCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCtt > 2:4480199/1‑93 (MQ=255) gCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCtt < 2:855534/93‑1 (MQ=255) gCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCtt < 1:3398426/93‑1 (MQ=255) gcgcATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATTCTTGGTGTCTCTGGGAGTCAGATCTCCTTAat > 2:1639809/1‑93 (MQ=255) cgcATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAatc > 1:4669234/1‑93 (MQ=255) aTTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAatcatc > 1:3316450/1‑93 (MQ=255) tAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCaa > 2:3372110/1‑93 (MQ=255) tAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCaa < 1:1510489/93‑1 (MQ=255) tAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCaa > 1:1588035/1‑93 (MQ=255) aaCTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAac > 1:1953905/1‑93 (MQ=255) aaCTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAac < 1:1338505/93‑1 (MQ=255) cTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAacac < 1:1389447/93‑1 (MQ=255) ttCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACAcc < 2:2908438/93‑1 (MQ=255) ttCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACAcc > 1:4565660/1‑93 (MQ=255) ttCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACAcc > 1:358497/1‑93 (MQ=255) tCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCa > 1:987158/1‑93 (MQ=255) ccACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAt < 1:929498/93‑1 (MQ=255) ccACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAt > 2:472771/1‑93 (MQ=255) aCGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAttt > 1:2037933/1‑93 (MQ=255) aCGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGAACGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAttt > 1:2656215/1‑93 (MQ=255) cGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAtttt < 1:2895869/93‑1 (MQ=255) gATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAttttt > 1:34265/1‑93 (MQ=255) gATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCAttttt < 1:381606/93‑1 (MQ=255) aTGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTg > 1:1955787/1‑93 (MQ=255) ccGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCt > 2:841715/1‑93 (MQ=255) cGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTc > 2:4354926/1‑93 (MQ=255) cGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTCTGCCTc > 1:866938/1‑93 (MQ=255) cGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTc > 1:4012857/1‑93 (MQ=255) gAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGt < 1:17361/93‑1 (MQ=255) gAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATACTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGt > 2:736033/1‑93 (MQ=255) aGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGtt < 1:2758086/93‑1 (MQ=255) aGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGtt < 1:2902171/93‑1 (MQ=255) aGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGtt > 2:3957960/1‑93 (MQ=255) aGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGtt > 1:3442725/1‑93 (MQ=255) gCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGttt > 1:2690328/1‑93 (MQ=255) gCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGttt > 1:3198418/1‑93 (MQ=255) gCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGttt < 1:2719796/93‑1 (MQ=255) cAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTc < 2:1372023/93‑1 (MQ=255) cAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTc < 2:3506454/93‑1 (MQ=255) aaTGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCt > 1:2924088/1‑93 (MQ=255) aTGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCtt > 1:4720431/1‑93 (MQ=255) aTGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCtt < 1:2221338/93‑1 (MQ=255) gcgcGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGc < 2:3673186/93‑1 (MQ=255) gcgcGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGc < 1:1748946/93‑1 (MQ=255) cgcgTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCt < 2:2984518/93‑1 (MQ=255) gggtggtgAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGAGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATGTTTGCCTCGTTTCTTGCtg > 2:2339284/3‑92 (MQ=255) gcgTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCtt > 1:2675770/1‑93 (MQ=255) cgTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTc < 1:3560127/93‑1 (MQ=255) tggtgAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATAATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCg < 1:1805127/93‑1 (MQ=255) ggtgAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCgg > 2:4157618/1‑93 (MQ=255) gtgAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGt < 1:3624669/93‑1 (MQ=255) tgAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGtt < 2:573391/93‑1 (MQ=255) ggAAACAGATGGAACCGGCGATACTTGGTGTCCCTGTGAGCCAGATCTCCTTACTCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGtt < 2:3579531/92‑1 (MQ=255) gAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAATACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTc < 1:4292625/93‑1 (MQ=255) gAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTc > 2:3028851/1‑93 (MQ=255) aaaCAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCg < 1:2844207/93‑1 (MQ=255) aaaCAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCg < 1:2111818/93‑1 (MQ=255) aaaCAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCg < 2:1084364/93‑1 (MQ=255) aaCAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCgg > 2:3750426/1‑93 (MQ=255) aaCAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCgg < 2:3276651/93‑1 (MQ=255) aCAGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGgt > 1:225307/1‑93 (MQ=255) aGATGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGgtgt < 1:2109403/93‑1 (MQ=255) tGGGACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCtt > 1:4301814/1‑93 (MQ=255) gggACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTg > 1:3814761/1‑93 (MQ=255) gACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGa < 1:1413428/93‑1 (MQ=255) gACCGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGa < 1:3114974/93‑1 (MQ=255) cGGCGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGt > 1:826985/1‑93 (MQ=255) cGATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTAtt < 1:4372518/93‑1 (MQ=255) cGATCCTTGGTGGCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTAtt < 1:3405455/93‑1 (MQ=255) gATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACGCCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTa < 1:589757/93‑1 (MQ=255) gATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTa < 1:589756/93‑1 (MQ=255) gATCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTa < 2:2752479/93‑1 (MQ=255) aTCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTAc < 1:4640781/93‑1 (MQ=255) aTCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTAc > 2:1640755/1‑93 (MQ=255) aTCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTAc > 2:2733238/1‑93 (MQ=255) aTCCTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTAc > 2:2057894/1‑93 (MQ=255) tCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTTCTTACAGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACg > 2:3115959/1‑93 (MQ=255) ccTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGc < 1:2762434/93‑1 (MQ=255) cTTGGTGTGTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGcc < 2:2394535/93‑1 (MQ=255) cTTGGTGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGcc > 2:133141/1‑93 (MQ=255) | AAGATCGGCATGCTGGTCCTGCCGCGCATTAACTTCCACGATGCCGGAGCAATGCGCGTGGTGAAACAGATGGGACCGGCGATCCTTGGCGTCTCTGTGAGCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTCGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCG > NC_000913/1127689‑1127866 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |