Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,301,617 | T→C | V232A (GTG→GCG) | oppB → | oligopeptide transport permease protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,301,617 | 0 | T | C | 96.8% | 373.9 / ‑0.8 | 124 | V232A (GTG→GCG) | oppB | oligopeptide transport permease protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/2); new base C (65/55); total (67/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
ACTCCAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAAC > NC_000913/1301527‑1301706 | ccTCCAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCgcgc < 1:3772522/92‑1 (MQ=255) acTCCAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCgcgc > 1:1005860/1‑93 (MQ=255) acTCCAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCgcgc > 1:721647/1‑93 (MQ=255) ccAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGctct > 1:2359181/1‑93 (MQ=255) cAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGctctc > 2:4446913/1‑93 (MQ=255) cAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGctctc > 2:256031/1‑93 (MQ=255) aaTTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGctctct > 1:107230/1‑93 (MQ=255) aaTTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGctctct > 2:792362/1‑93 (MQ=255) aTTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCtt < 2:3019782/93‑1 (MQ=255) tttATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTtat < 2:1009533/93‑1 (MQ=255) ttATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTtata < 2:3977210/93‑1 (MQ=255) ttATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTtata < 2:2908115/93‑1 (MQ=255) tATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTatat < 1:4529597/93‑1 (MQ=255) aTTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACGCGCGCTCTCTTATATg < 2:247/93‑1 (MQ=255) ttCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATgg < 1:3584050/93‑1 (MQ=255) gTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGcc > 1:1907442/1‑93 (MQ=255) tACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGccc > 1:1161219/1‑93 (MQ=255) tGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGc < 2:2816959/93‑1 (MQ=255) tGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGc > 1:973937/1‑93 (MQ=255) gCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCa > 2:486249/1‑93 (MQ=255) ccGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCTCAtt > 1:912955/1‑93 (MQ=255) gggCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTg < 2:2682130/93‑1 (MQ=255) gggCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTg > 2:2175182/1‑93 (MQ=255) gCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTc < 1:4233067/93‑1 (MQ=255) aaGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCa > 1:2212436/1‑93 (MQ=255) aGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAACCCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCat > 1:222633/1‑93 (MQ=255) aGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCat < 2:152574/93‑1 (MQ=255) aGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCat > 1:767989/1‑93 (MQ=255) aGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCat < 2:869582/93‑1 (MQ=255) ggTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCatta < 2:722212/93‑1 (MQ=255) gTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCattat < 1:1940218/93‑1 (MQ=255) gTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCattaa > 2:4227523/1‑92 (MQ=255) ttACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCattatt < 1:3028944/93‑1 (MQ=255) ttACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCattatt < 2:4272876/93‑1 (MQ=255) ttACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCattatt > 2:4497638/1‑93 (MQ=255) tACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGTAttatta > 2:2396734/1‑93 (MQ=255) aCCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTAc < 2:2784105/93‑1 (MQ=255) aCCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTAc < 1:3051105/93‑1 (MQ=255) ccTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTAcc < 2:2318585/93‑1 (MQ=255) tATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCgg < 1:398880/93‑1 (MQ=255) tATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCgg < 2:2408229/93‑1 (MQ=255) aTGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACTGGt < 2:3495552/93‑1 (MQ=255) aTGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGt > 2:3049287/1‑93 (MQ=255) aTGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGt < 2:1071825/93‑1 (MQ=255) tGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGtt > 2:2955011/1‑93 (MQ=255) gcggcgGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTc < 1:3682272/93‑1 (MQ=255) gcggcgGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTc < 1:1707284/93‑1 (MQ=255) gcggcgGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTc > 2:596514/1‑93 (MQ=255) ggcggATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTa < 1:4115629/93‑1 (MQ=255) ggcggATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTa < 2:1661486/93‑1 (MQ=255) gcggATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTAt > 2:1966369/1‑93 (MQ=255) gcggATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTAt < 1:2013812/93‑1 (MQ=255) cggATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATg < 1:468050/93‑1 (MQ=255) ggATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATgg > 2:35149/1‑93 (MQ=255) ggATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATgg < 2:3526605/93‑1 (MQ=255) gATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGt > 1:4308722/1‑93 (MQ=255) tCATTATACGTCTCGCATTAAAACCTGCTCTGTTTCCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTCTTACCGGTTCTATGGTTa < 2:3101701/93‑1 (MQ=255) cATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTAt < 2:1590310/93‑1 (MQ=255) cATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTAt < 1:3248790/93‑1 (MQ=255) aTTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATc > 2:3986479/1‑93 (MQ=255) aTTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATc < 1:4675369/93‑1 (MQ=255) ttttACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCg > 1:4370857/1‑93 (MQ=255) ttttACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCg > 2:1712485/1‑93 (MQ=255) ttttACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGACCCGCATTTGTCGGGATTATTACCGGTTCTATGGTTATCg > 2:1915866/1‑93 (MQ=255) tttACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGa > 2:3050838/1‑93 (MQ=255) tACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGaaa < 2:3138894/93‑1 (MQ=255) tACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTATTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGaaa < 2:3138895/93‑1 (MQ=255) aCGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAAc > 1:2652089/1‑93 (MQ=255) aCGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAAc > 2:2487274/1‑93 (MQ=255) aCGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAAc > 1:1536388/1‑93 (MQ=255) cGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGACAcc > 1:1328784/1‑93 (MQ=255) gTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCa > 1:4119221/1‑93 (MQ=255) gCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTAt > 1:1028347/1‑93 (MQ=255) gCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTAt > 2:1876409/1‑93 (MQ=255) cATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATg < 2:1828525/93‑1 (MQ=255) aTTAAAACCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATgg > 1:81014/1‑93 (MQ=255) aaaCCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTg > 1:1792790/1‑93 (MQ=255) aaaCCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTg > 2:557198/1‑93 (MQ=255) aCCTGCTCTGTTCCCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGcc < 1:2588296/93‑1 (MQ=255) aCCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGcc < 1:2329014/93‑1 (MQ=255) aCCTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGcc < 1:2792231/93‑1 (MQ=255) ccTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCg > 1:1376089/1‑93 (MQ=255) cTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgg < 1:2774178/93‑1 (MQ=255) cTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgg < 1:2777651/93‑1 (MQ=255) cTGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgg < 1:2777652/93‑1 (MQ=255) tGCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCggg > 2:2385160/1‑93 (MQ=255) gCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgggg > 2:3206792/1‑93 (MQ=255) gCTCTGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgggg > 2:4392103/1‑93 (MQ=255) ctctGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGa < 1:302072/93‑1 (MQ=255) ctctGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGa < 1:4315583/93‑1 (MQ=255) ctctGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGa < 2:4019/93‑1 (MQ=255) tctGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGAt > 1:68587/1‑93 (MQ=255) tctGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGAt > 1:3168598/1‑93 (MQ=255) tcagTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGACATTATTTCCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGAt < 2:4215553/90‑1 (MQ=255) tGTTACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTg > 1:2762369/1‑93 (MQ=255) ttACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTTTCGGCATTATTACCGGGTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGa > 1:1743429/1‑93 (MQ=255) ttACCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGa > 2:301755/1‑93 (MQ=255) ttcccGCGCTGTCTTATATGGGGCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGAc < 1:4594971/91‑1 (MQ=255) aCCCGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACa > 2:3813937/1‑93 (MQ=255) ccGCGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAAc > 1:3195260/1‑93 (MQ=255) | ACTCCAATTTTATTCGTACTGCCCGGGCGAAAGGGTTACCTATGCGGCGGATCATTTTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAAC > NC_000913/1301527‑1301706 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |