| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,433,368 | T→C | E92E (GAA→GAG) | ynaF ← | putative filament protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,433,368 | 0 | T | C | 97.6% | 504.7 / 1.9 | 166 | E92E (GAA→GAG) | ynaF | putative filament protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/1); new base C (89/72); total (93/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.43e-01 | |||||||||||
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
AGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTC > NC_000913/1433278‑1433457 | aGTGGTGATATCCGGTCGATGGGGAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCTAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTc < 2:3226762/93‑1 (MQ=255) gtggtgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTcc < 2:1048499/93‑1 (MQ=255) gtggtgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTcc > 1:2677472/1‑93 (MQ=255) tggtgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGAAGATCATATGAGCGGGGGGCTTCTTCGCCAATTCAAGAATGCGGTCTTTGGGCGCGCcctcct > 2:1168844/1‑93 (MQ=255) tgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCaa < 1:2073251/93‑1 (MQ=255) gATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAAc > 1:1861411/1‑93 (MQ=255) atatCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACa > 1:3895095/1‑93 (MQ=255) tatCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACAt > 2:1536639/1‑93 (MQ=255) tatCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACAt < 2:751716/93‑1 (MQ=255) atCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATg > 2:1932274/1‑93 (MQ=255) atCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATg > 2:1386119/1‑93 (MQ=255) tCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATgg < 1:4018907/93‑1 (MQ=255) tCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATgg > 2:2813881/1‑93 (MQ=255) tCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATgg > 2:1128846/1‑93 (MQ=255) tCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATgg > 2:3835047/1‑93 (MQ=255) ggTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACa > 2:4085323/1‑93 (MQ=255) ggTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACa < 2:1774737/93‑1 (MQ=255) ggTCGAGGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACa > 2:4668143/1‑93 (MQ=255) gATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCa > 1:2316836/1‑93 (MQ=255) gATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCa < 1:1550416/93‑1 (MQ=255) gATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCa > 2:3451492/1‑93 (MQ=255) aTGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCAc < 1:1685179/93‑1 (MQ=255) gAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTg < 2:4272240/93‑1 (MQ=255) aGCAATGATAATCATATGAGCGGGCATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTGTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTc < 2:3404643/93‑1 (MQ=255) gCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCg < 2:95427/93‑1 (MQ=255) cAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCgg > 1:1804533/1‑93 (MQ=255) aaTGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGt < 2:3623926/93‑1 (MQ=255) aaTGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGt > 1:2966937/1‑93 (MQ=255) aaTGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGt > 1:1907511/1‑93 (MQ=255) aaTGATGATCATATGAGCGGGCATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCATCATGGACATGCACTCTGTCGGt < 2:505046/93‑1 (MQ=255) atgatgATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGtt > 2:444596/1‑93 (MQ=255) agatgatCATATGAGCGGGGTTCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTg < 2:2822897/92‑1 (MQ=255) gatgatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTgg > 1:2023022/1‑93 (MQ=255) tgatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCa < 1:2418620/93‑1 (MQ=255) tgatCATATGAGCGGGGATCTTCATCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCa < 2:2592319/93‑1 (MQ=255) gatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAg < 2:3014421/93‑1 (MQ=255) gatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAg < 2:3014291/93‑1 (MQ=255) atCATATGAGCTGAGTTCTCCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGt < 2:4241483/93‑1 (MQ=255) tCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGtt > 2:1626406/1‑93 (MQ=255) tCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGtt < 1:1132764/93‑1 (MQ=255) cATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGttt > 2:3817185/1‑93 (MQ=255) atatGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTa > 1:513279/1‑93 (MQ=255) atatGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTa < 1:35247/93‑1 (MQ=255) gAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAtt < 1:1641998/93‑1 (MQ=255) aGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAttt > 2:1437186/1‑93 (MQ=255) gggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTa > 1:2529269/1‑93 (MQ=255) ggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTaa > 1:700218/1‑93 (MQ=255) ggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTaa < 1:4618892/93‑1 (MQ=255) gATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAAt < 1:724159/93‑1 (MQ=255) atattcttcGCTAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCCCTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATg < 1:3235419/90‑1 (MQ=255) aTCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATg < 2:4179861/93‑1 (MQ=255) aTCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGCCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATg > 2:3541897/1‑93 (MQ=255) tcttctTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGa < 1:262585/93‑1 (MQ=255) cttcttCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAt < 2:494631/93‑1 (MQ=255) ttcttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtc < 2:4635583/93‑1 (MQ=255) ttcttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtc > 1:344047/1‑93 (MQ=255) cttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtctc > 2:3494088/1‑93 (MQ=255) cttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtctc < 1:4486934/93‑1 (MQ=255) cttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtctc > 1:2899790/1‑93 (MQ=255) ttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATctct > 1:4033461/1‑93 (MQ=255) ttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATctct < 1:1599970/93‑1 (MQ=255) tcGCCAATTCCTGAGTGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCtt < 2:990214/93‑1 (MQ=255) tcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCtt < 2:2160690/93‑1 (MQ=255) gCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTcc > 1:1232044/1‑93 (MQ=255) ccAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCa > 1:3707209/1‑93 (MQ=255) cAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAg > 2:2701405/1‑93 (MQ=255) cAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAg > 2:660019/1‑93 (MQ=255) cAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAg < 2:204150/93‑1 (MQ=255) cAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAg > 1:4121729/1‑93 (MQ=255) aaTTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGt > 2:78284/1‑93 (MQ=255) aaTTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGt < 2:2447034/93‑1 (MQ=255) aaTTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGt > 2:123182/1‑93 (MQ=255) aaTTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGt > 2:123180/1‑93 (MQ=255) aTTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGtt > 1:1441570/1‑93 (MQ=255) aTTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGtt < 1:3856369/93‑1 (MQ=255) aTTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGtt < 2:3974533/93‑1 (MQ=255) tCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGc < 2:852021/93‑1 (MQ=255) tCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGc < 2:2083762/93‑1 (MQ=255) ccAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCg > 1:3563778/1‑93 (MQ=255) aGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGAt > 1:1512571/1‑93 (MQ=255) aGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGAt > 2:3839260/1‑93 (MQ=255) aGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGAt > 1:1911867/1‑93 (MQ=255) gAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGAtt < 2:4030021/93‑1 (MQ=255) gAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGAtt < 1:2223610/93‑1 (MQ=255) gAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGAtt > 1:2484227/1‑93 (MQ=255) gtGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGCGGCGATTTg < 2:50732/92‑1 (MQ=255) aTGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTg > 2:2930996/1‑93 (MQ=255) aTGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTg > 2:1727524/1‑93 (MQ=255) gCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGc < 2:3248479/93‑1 (MQ=255) gCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGc > 1:447692/1‑93 (MQ=255) gCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGc > 1:880942/1‑93 (MQ=255) gTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTc > 1:3755170/1‑93 (MQ=255) tCTTTGGGCGGGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTcc > 2:2627566/1‑93 (MQ=255) tttGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGc > 1:2086146/1‑93 (MQ=255) tttGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGc > 2:310539/1‑93 (MQ=255) ttGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCt > 1:4372114/1‑93 (MQ=255) tGGGCGAGCCGTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGGTTAAATTTTCTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCGGCtt > 2:663192/1‑93 (MQ=255) gAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAgg < 2:4551717/93‑1 (MQ=255) aGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGt > 2:598281/1‑93 (MQ=255) gCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTc > 2:1503055/1‑93 (MQ=255) | AGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTC > NC_000913/1433278‑1433457 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |