Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 160,649 | A→G | intergenic (‑45/+133) | dksA ← / ← sfsA | DksA/putative regulator for maltose metabolism |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 160,649 | 0 | A | G | 99.4% | 509.9 / ‑5.6 | 160 | intergenic (‑45/+133) | dksA/sfsA | DksA/putative regulator for maltose metabolism |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (85/74); total (86/74) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
GAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTT > NC_000913/160560‑160739 | gagaATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGgaaa > 2:2402415/1‑93 (MQ=255) gagaATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGgaaa > 1:2380056/1‑93 (MQ=255) agaATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGaaaaa > 2:787271/1‑93 (MQ=255) gaATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAAt > 2:2092330/1‑93 (MQ=255) aTACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGa < 1:424660/93‑1 (MQ=255) aTACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGa < 1:4487248/93‑1 (MQ=255) aTACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGa < 2:1943851/93‑1 (MQ=255) tACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAg > 2:4517240/1‑93 (MQ=255) tACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAg < 2:2364179/93‑1 (MQ=255) tACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACGATCGATCCCCCTGTTCGGGGGGAAAATGAg > 2:3946486/1‑93 (MQ=255) aCTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAgg < 1:2171101/93‑1 (MQ=255) aCTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAgg < 2:849534/93‑1 (MQ=255) aCTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAgg < 2:3918843/93‑1 (MQ=255) cTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGc > 1:4741143/1‑93 (MQ=255) cTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGc > 2:2118332/1‑93 (MQ=255) tCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGcc < 2:1705656/93‑1 (MQ=255) tCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGcc < 1:1264585/93‑1 (MQ=255) aGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGc > 2:1823513/1‑93 (MQ=255) gggACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGTCGCt > 2:2732730/1‑93 (MQ=255) gACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCtat > 2:1325876/1‑93 (MQ=255) cGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATaa > 2:3706013/1‑93 (MQ=255) gATGTTTTACTGTTTTGCCCTTCTTTCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATaaa < 1:1614733/93‑1 (MQ=255) gATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCGCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATaaa > 1:745823/1‑93 (MQ=255) gATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATaaa > 1:3777583/1‑93 (MQ=255) gATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATaaa < 1:1036332/93‑1 (MQ=255) tGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATa < 1:3625407/93‑1 (MQ=255) tGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATa < 2:2755240/93‑1 (MQ=255) gTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAg < 1:1307036/93‑1 (MQ=255) gTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAg > 2:590095/1‑93 (MQ=255) ttttACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGc > 2:3368142/1‑93 (MQ=255) tttACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCa < 2:2912137/93‑1 (MQ=255) ttACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAg < 1:3878639/93‑1 (MQ=255) tACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGa < 1:748126/93‑1 (MQ=255) tACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGa < 1:2598831/93‑1 (MQ=255) tcGGTTTTGCCCTTCTTTCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGAt < 1:1030769/92‑1 (MQ=255) cGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATg > 1:3352958/1‑93 (MQ=255) ggTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCCTGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGc > 1:3217174/1‑93 (MQ=255) ggTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGc > 2:2948967/1‑93 (MQ=255) ggTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGc > 2:3477883/1‑93 (MQ=255) ttttGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCtt > 2:261975/1‑93 (MQ=255) tttGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCttt < 1:718111/93‑1 (MQ=255) ttGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCtttt < 1:1782921/93‑1 (MQ=255) tGCCCTGCTTGCATGTTGATTCTCCTTATCGCGCACTATCGATCCCGATGTTCGGGGCGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTc < 2:2810963/93‑1 (MQ=255) gCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTcc > 1:2905745/1‑93 (MQ=255) cccTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCg < 2:152983/93‑1 (MQ=255) cccTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCg > 1:3446815/1‑93 (MQ=255) ccTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCgg > 1:2495347/1‑93 (MQ=255) ccTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCgg > 2:1695020/1‑93 (MQ=255) cttcttGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCggg > 1:2255532/1‑92 (MQ=255) cttcttGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGa < 2:4244323/93‑1 (MQ=255) cttcttGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGa > 2:2994717/1‑93 (MQ=255) ttGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCTGATAGc > 2:935934/1‑93 (MQ=255) cATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAAt > 2:773371/1‑93 (MQ=255) cATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAAt > 1:4344148/1‑93 (MQ=255) ctGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAAtt < 1:3598876/92‑1 (MQ=255) aTGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGGTAGCAAtt > 1:2543725/1‑93 (MQ=255) aTGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAAtt > 1:2031796/1‑93 (MQ=255) tGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTa > 1:1497543/1‑93 (MQ=255) tGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTa < 2:4575985/93‑1 (MQ=255) gTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAGAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTAt > 2:2689088/1‑93 (MQ=255) gTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTAt > 2:3166632/1‑93 (MQ=255) ttGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATc > 2:2036421/1‑93 (MQ=255) tGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCt < 2:1085463/93‑1 (MQ=255) tGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCt < 2:2331733/93‑1 (MQ=255) ttCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTaaa < 2:4431039/93‑1 (MQ=255) ccTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTa < 2:4289860/93‑1 (MQ=255) cTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATGGCAATTATCTAAACGTaa > 1:952577/1‑93 (MQ=255) cTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTaa < 1:2102525/93‑1 (MQ=255) ttAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAac > 1:4072175/1‑93 (MQ=255) ttAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAac > 2:3500810/1‑93 (MQ=255) tAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAaca < 1:3038286/93‑1 (MQ=255) aaCACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAacac < 2:3074358/93‑1 (MQ=255) cacGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACtt < 1:3686934/93‑1 (MQ=255) aCTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACaa > 2:4701627/1‑93 (MQ=255) aCTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACaa > 1:2449627/1‑93 (MQ=255) aCTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACaa < 2:519164/93‑1 (MQ=255) aCTATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACaa > 1:4386893/1‑93 (MQ=255) cTATCGATCCCCATGTTCGGGTGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAAc > 1:339235/1‑93 (MQ=255) tATCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACt > 2:1185230/1‑93 (MQ=255) aTCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACtg > 1:1402769/1‑93 (MQ=255) aTCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACtg > 2:3633401/1‑93 (MQ=255) tCGATCCCCATGTTCGGGGGGCAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACtgt > 1:904191/1‑93 (MQ=255) tCGATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACtgt > 2:3957333/1‑93 (MQ=255) gATCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACtgtgt > 2:1442495/1‑93 (MQ=255) aTCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACtgtgtg < 1:658980/93‑1 (MQ=255) tCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGa < 1:4533120/93‑1 (MQ=255) tCCCCATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGa > 2:1728613/1‑93 (MQ=255) ccccATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAg > 1:640122/1‑93 (MQ=255) cccATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAgg < 1:570054/93‑1 (MQ=255) ccATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGa < 2:1234205/93‑1 (MQ=255) ccATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGa > 2:1991891/1‑93 (MQ=255) ccATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGa > 2:3405381/1‑93 (MQ=255) ccATGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGa > 2:507368/1‑93 (MQ=255) tGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGaaaa > 1:2207369/1‑93 (MQ=255) tGTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGaaaa < 1:4725435/93‑1 (MQ=255) gTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAg > 2:2382660/1‑93 (MQ=255) gTTCGGGGGGAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAg > 2:2867401/1‑93 (MQ=255) ggggggAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTa > 2:434262/1‑93 (MQ=255) ggggAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACaa > 2:2249055/1‑72 (MQ=255) ggggAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTAtt < 1:4153256/93‑1 (MQ=255) | GAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTT > NC_000913/160560‑160739 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |