| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,826,476 | T→C | N428S (AAC→AGC) | b1746 ← | putative aldehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,826,476 | 0 | T | C | 98.1% | 326.3 / ‑2.7 | 103 | N428S (AAC→AGC) | b1746 | putative aldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (49/52); total (50/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGT > NC_000913/1826388‑1826564 | aTACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAAc > 1:3384999/1‑93 (MQ=255) tACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACa > 1:1420277/1‑93 (MQ=255) tACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGCTCCAGCTAACa > 1:1967095/1‑93 (MQ=255) ccAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAAt < 1:1461219/93‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATc < 2:2175054/93‑1 (MQ=255) aGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcc > 1:4199151/1‑93 (MQ=255) aGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACAAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcc > 2:2740049/1‑93 (MQ=255) aGGCGCGGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcc < 1:576305/93‑1 (MQ=255) ggCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATccc < 1:3019396/93‑1 (MQ=255) ggCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATccc > 1:4484260/1‑93 (MQ=255) ggCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATccc > 2:4716824/1‑93 (MQ=255) ggCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGGACTGGCAGCACCGGTAAGCGGCTTGTTCCAGCTAACCATccc > 2:2564160/1‑93 (MQ=255) gcgcTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTACAGCTAACAATcccc < 2:4684088/93‑1 (MQ=255) gcgcTGGGGCGATGGTGACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGTGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATcccc < 2:1258629/93‑1 (MQ=255) 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gCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCgcgc > 1:4402143/1‑93 (MQ=255) cGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGcc > 1:2991994/1‑93 (MQ=255) gATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCt > 1:2094851/1‑93 (MQ=255) tGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTcc < 2:230409/93‑1 (MQ=255) tGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTcc < 2:3176059/93‑1 (MQ=255) gTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAg < 1:1041695/93‑1 (MQ=255) cGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACa < 1:4300236/93‑1 (MQ=255) ggAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCTGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAg < 2:3582494/93‑1 (MQ=255) ggAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAg < 2:923806/93‑1 (MQ=255) ggAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAg < 2:4277443/93‑1 (MQ=255) gAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGt > 1:4137357/1‑93 (MQ=255) gAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGt < 2:3218334/93‑1 (MQ=255) gAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGt > 1:1819190/1‑93 (MQ=255) gAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGt > 2:3605288/1‑93 (MQ=255) aGCACCAATGCCCCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCACCTCCAGCAACAGTTg < 2:3428918/93‑1 (MQ=255) gCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGAGGTTTGTTCCAGCTAACAATACTCGCACGCTCCTCGCGCAACAGTTgt > 2:1165769/1‑92 (MQ=255) acACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGa < 1:736537/92‑1 (MQ=255) caaaTGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCg < 2:869457/91‑1 (MQ=255) cAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGa > 1:3123546/1‑93 (MQ=255) cAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGa < 1:2883580/93‑1 (MQ=255) cAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGa > 2:566015/1‑93 (MQ=255) aTGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAAc > 1:524631/1‑93 (MQ=255) gccgccGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACtt < 1:3911147/93‑1 (MQ=255) cctccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACttt < 2:1366790/90‑1 (MQ=255) ccgccgAATGGCGGGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACttt < 2:1603825/93‑1 (MQ=255) ccgccgAATGGCGCGGTCCTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACttt < 2:4729698/93‑1 (MQ=255) gccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCCCGCCTCGCCCGACAGTTGATCGAACTTTTc > 2:1095112/1‑93 (MQ=255) ccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTcc > 1:4484412/1‑93 (MQ=255) ccgAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTcc < 2:1047983/93‑1 (MQ=255) ccgAAGGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTcc < 2:3922079/93‑1 (MQ=255) aaTGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGc < 1:1789701/93‑1 (MQ=255) aTGGCGCGGTACTGGCCGCGCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCt < 2:1088356/93‑1 (MQ=255) aTGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCt > 1:4726105/1‑93 (MQ=255) tGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTc > 1:2055607/1‑93 (MQ=255) cgcgGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCggg > 2:2134344/1‑93 (MQ=255) gcgGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCgggg > 1:1114164/1‑93 (MQ=255) cgGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCggggg < 1:2360654/93‑1 (MQ=255) ggTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGa < 1:2996404/93‑1 (MQ=255) ggTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCCCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCCCTCGGGGGa > 1:1598949/1‑93 (MQ=255) gTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGaa > 2:2195898/1‑93 (MQ=255) cTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTACCGCTCGGGGGAAAcc > 1:2714542/1‑93 (MQ=255) tGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCa < 1:2284859/93‑1 (MQ=255) ggCAGCACGGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAg < 1:3063394/93‑1 (MQ=255) ggCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAg > 1:1417253/1‑93 (MQ=255) ggCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAg > 1:3616997/1‑93 (MQ=255) ggCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAg > 1:3512872/1‑93 (MQ=255) gcagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGa < 2:76017/93‑1 (MQ=255) gcagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGa < 2:4568526/93‑1 (MQ=255) cagcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAc < 1:2292789/93‑1 (MQ=255) agcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGAcc < 1:1769027/93‑1 (MQ=255) gcaCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCAGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCg > 2:4063673/1‑93 (MQ=255) caCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGc > 1:964902/1‑93 (MQ=255) caCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGc > 1:1219343/1‑93 (MQ=255) aCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCa > 1:4614971/1‑93 (MQ=255) aCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCa > 1:4555281/1‑93 (MQ=255) aCCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCa > 1:1538847/1‑93 (MQ=255) 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aGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGt < 2:1641903/93‑1 (MQ=255) aGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGt < 1:2006759/93‑1 (MQ=255) aGCGGTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGt > 2:974325/1‑93 (MQ=255) ggTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCg > 1:3758341/1‑93 (MQ=255) ggTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCg < 1:3346995/93‑1 (MQ=255) ggTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCg < 2:749783/93‑1 (MQ=255) gTTTGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGa < 1:2477628/93‑1 (MQ=255) ttttttCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGaa < 2:1018000/93‑1 (MQ=255) tttGTTCCAGCTAACAATTCCCGCCCGCGCCTGCAGCAAAAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAAACAGACCGCAAGAGAATCCGaa < 2:1688362/93‑1 (MQ=255) tttGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGaa < 1:3064394/93‑1 (MQ=255) tttGTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGaa < 1:1464824/93‑1 (MQ=255) gTTCCAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGCAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCg > 1:2649924/1‑93 (MQ=255) ccAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAgt < 1:2316971/93‑1 (MQ=255) ccAGCTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAgt < 2:3830768/93‑1 (MQ=255) | ATACCAGGCGCTGGGGCGATGGTTACCGGAAGCACCAATGCCGCCGAATGGCGCGGTACTGGCAGCACCGGTAAGCGGTTTGTTCCAGTTAACAATCCCCGCCCGCGCCTCCAGCAACAGTTGATCGAACTTTTCCCGCTCGGGGGAAACCAGACCGCAAGAGAGTCCGAAGCGAGT > NC_000913/1826388‑1826564 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |