| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,321,092 | G→A | A403T (GCC→ACC) | atoC → | ornithine decarboxylase antizyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,321,092 | 0 | G | A | 97.9% | 623.6 / ‑1.0 | 195 | A403T (GCC→ACC) | atoC | ornithine decarboxylase antizyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base A (87/101); total (89/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
GTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > NC_000913/2321002‑2321181 | gtcgtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAcc < 1:2555974/93‑1 (MQ=255) tcgtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAccc < 1:3772029/93‑1 (MQ=255) cgtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAAcccc < 2:1604126/93‑1 (MQ=255) gtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCt > 1:1317989/1‑93 (MQ=255) gtGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCt > 1:1717003/1‑93 (MQ=255) tgatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTg > 1:4431590/1‑93 (MQ=255) tgatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTg < 1:753455/93‑1 (MQ=255) gatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGt < 2:1175240/93‑1 (MQ=255) gatgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGt < 1:1843889/93‑1 (MQ=255) gatgaATTCAGGCATGACATTTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGt < 1:4032732/93‑1 (MQ=255) tgaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCg < 1:1104015/93‑1 (MQ=255) gaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCgg < 1:2722220/93‑1 (MQ=255) gaATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCAACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCgg > 2:1067427/1‑93 (MQ=255) aTTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTg < 1:1909662/93‑1 (MQ=255) ttCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGa < 2:469737/93‑1 (MQ=255) cAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGACCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGc < 2:617510/93‑1 (MQ=255) ccGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAt < 1:1289158/93‑1 (MQ=255) ccGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAt > 1:715544/1‑93 (MQ=255) cGATCTGTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAtt < 1:2558843/93‑1 (MQ=255) cGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAtt > 1:4457457/1‑93 (MQ=255) cGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAtt > 1:540466/1‑93 (MQ=255) cGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAtt > 2:2835671/1‑93 (MQ=255) cGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAtt < 2:4074627/93‑1 (MQ=255) cGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAAtt > 1:922894/1‑93 (MQ=255) aTCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTa > 1:1516537/1‑93 (MQ=255) tCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTaa > 2:2482181/1‑93 (MQ=255) aTTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAACGCTGGCGAGGTAAAAATAACTTCTGTCGGGGAGCGTAATTTaaaa > 1:4227090/1‑93 (MQ=255) tttgtCTGAGGAGCTGCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAaga < 1:2026685/93‑1 (MQ=255) ttttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAagag < 2:1664706/93‑1 (MQ=255) ttCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGa < 1:4120792/93‑1 (MQ=255) tCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGaa < 2:1912290/93‑1 (MQ=255) aGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTa > 1:3876071/1‑93 (MQ=255) ggATCTCCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTaa < 2:583335/93‑1 (MQ=255) gATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGTGTAATTTAAAAGAGGAAATTaaa > 2:2584062/1‑93 (MQ=255) aTCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAc < 1:681729/93‑1 (MQ=255) tCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcg < 1:4428060/93‑1 (MQ=255) ttCCGCCACAGTTATACCAGACAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACATCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgcg < 2:3562401/93‑1 (MQ=255) ttCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgcg > 2:2245627/1‑93 (MQ=255) ttCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAAcgcg > 1:624868/1‑93 (MQ=255) cGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCg < 1:3460976/93‑1 (MQ=255) cGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCg < 1:3060041/93‑1 (MQ=255) gCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGa > 1:1955198/1‑93 (MQ=255) cccACAGATTCGCCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGa < 2:3916672/92‑1 (MQ=255) cacaGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaa > 2:1359575/1‑93 (MQ=255) cacaGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaa < 1:4372030/93‑1 (MQ=255) acaGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaa > 2:1979906/1‑93 (MQ=255) acaGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaa > 2:3513495/1‑93 (MQ=255) acaGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaa > 2:2778696/1‑93 (MQ=255) caGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTTGaaaaa < 2:4606773/93‑1 (MQ=255) caGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaaa < 1:1608644/93‑1 (MQ=255) caGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaaa < 2:434619/93‑1 (MQ=255) caGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGaaaaa < 1:2313474/93‑1 (MQ=255) aGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAAc > 1:3184584/1‑93 (MQ=255) aGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGGAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAAc > 2:536250/1‑93 (MQ=255) 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gTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGaa > 2:3076278/1‑93 (MQ=255) tCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAg < 2:2336014/93‑1 (MQ=255) cTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGt < 1:4677662/93‑1 (MQ=255) tGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGtt > 1:2263070/1‑92 (MQ=255) gTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGc > 1:4242280/1‑93 (MQ=255) aaTGCTGGCGAGGTAAAAACATCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTg < 2:888299/93‑1 (MQ=255) aaTGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTg > 2:1499092/1‑93 (MQ=255) aTGCTGGCGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTgg > 1:2126424/1‑93 (MQ=255) 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cGAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGGATCATTATGGAAGTGCTGGAacaaca < 2:3811833/93‑1 (MQ=255) gAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAAcaacaa > 2:2194296/1‑93 (MQ=255) gAGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAAcaacaa < 2:4368593/93‑1 (MQ=255) aGGTAAAAACAACCTCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaag < 1:356168/93‑1 (MQ=255) aGGTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaag < 1:2486550/93‑1 (MQ=255) gTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaagaa > 2:3079860/1‑93 (MQ=255) gTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaagaa < 1:1278187/93‑1 (MQ=255) gTAAAAACAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACaagaa < 1:3291792/93‑1 (MQ=255) aaaaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAgg < 2:682469/93‑1 (MQ=255) aaaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGa < 1:1331347/93‑1 (MQ=255) aaaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGa < 2:113207/93‑1 (MQ=255) aaaCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGaa > 1:1006207/1‑93 (MQ=255) aacaacCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGaaa < 2:2538786/93‑1 (MQ=255) aCAACCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAc < 2:2704945/93‑1 (MQ=255) | GTCGTGATGAATTCAGGCCCGATCATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAAAAACAGCCCCTGTCGGTGAGCGTAATTTAAAAGAGGAAATTAAACGCGTCGAAAAACGCATCATTATGGAAGTGCTGGAACAACAAGAAGGAAAC > NC_000913/2321002‑2321181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |