Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 301,875 | A→G | intergenic (‑78/‑340) | yagT ← / → yagU | putative xanthine dehydrogenase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 301,875 | 0 | A | G | 98.3% | 566.0 / ‑0.8 | 178 | intergenic (‑78/‑340) | yagT/yagU | putative xanthine dehydrogenase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base G (112/62); total (115/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.39e-01 |
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
CTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGATGATG > NC_000913/301785‑301964 | ttGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTc > 2:771630/1‑93 (MQ=255) ttGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTc > 2:2231882/1‑93 (MQ=255) tGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCg > 2:1634923/1‑93 (MQ=255) tGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCg > 2:1162538/1‑93 (MQ=255) tGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGGGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCg > 2:1515864/1‑93 (MQ=255) ggTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCgg > 1:3571389/1‑93 (MQ=255) ggTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCgg < 1:4160085/93‑1 (MQ=255) ggTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCgg < 1:1555656/93‑1 (MQ=255) gCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGAc > 1:4399650/1‑93 (MQ=255) cTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGGAAATAAGAGTGCGTTGCGCGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTTAGCATGGTCGGCGAca > 2:2901124/1‑93 (MQ=255) cTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGAca < 1:2818476/93‑1 (MQ=255) cATACCAGGCCTCCGGTATTCTACAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGAcagc < 2:2579325/93‑1 (MQ=255) cATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGAcagc < 1:3219926/93‑1 (MQ=255) aTACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGAcagca < 1:381892/93‑1 (MQ=255) aaCCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGAcagcag < 2:146413/92‑1 (MQ=255) ccAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCagga < 2:3588920/93‑1 (MQ=255) ccAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCagga > 1:3978559/1‑93 (MQ=255) cAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCaggag > 1:2863669/1‑93 (MQ=255) aGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCaggagg > 2:2152930/1‑93 (MQ=255) aGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCaggagg > 1:2459421/1‑93 (MQ=255) aGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCaggagg > 1:977119/1‑93 (MQ=255) ggCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAggagga > 2:2690981/1‑93 (MQ=255) ccTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGatt < 2:4053284/93‑1 (MQ=255) ccTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGatt < 1:1535572/93‑1 (MQ=255) cTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGCCAGCAGGAGGataa > 2:3954801/1‑91 (MQ=255) cTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGatta > 2:2623929/1‑93 (MQ=255) tCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGattat > 1:3627007/1‑93 (MQ=255) tCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGattat < 1:778050/93‑1 (MQ=255) ccGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGattatt > 2:3120329/1‑93 (MQ=255) cGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTc > 2:4391389/1‑93 (MQ=255) cGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTc < 2:3784210/93‑1 (MQ=255) cGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTc < 2:52799/93‑1 (MQ=255) cGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTc < 1:2314839/93‑1 (MQ=255) cGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTc > 1:1983995/1‑93 (MQ=255) cGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTACTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTc > 1:2676618/1‑93 (MQ=255) ggTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCt > 1:11530/1‑93 (MQ=255) ggTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCt > 2:613741/1‑93 (MQ=255) ggTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCt > 2:2120523/1‑93 (MQ=255) tATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTa > 2:1435488/1‑93 (MQ=255) tATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTa > 2:4229331/1‑93 (MQ=255) ttCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATTGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaaa > 1:3526879/1‑93 (MQ=255) ttCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaaa > 1:856442/1‑93 (MQ=255) tCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTaaaa < 2:1769803/93‑1 (MQ=255) tAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAAcg > 2:3448098/1‑93 (MQ=255) tAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAAcg > 2:326191/1‑93 (MQ=255) tAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGGGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAAcg > 2:1734056/1‑93 (MQ=255) aaGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGGAGGAGGATTATTCTTAAAAcgcg > 2:2593068/1‑93 (MQ=255) aaGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAAcgcg > 2:4029036/1‑93 (MQ=255) ggggAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGaa < 2:1288733/93‑1 (MQ=255) ggggAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGaa < 1:4528231/93‑1 (MQ=255) gAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGc < 2:1022456/93‑1 (MQ=255) aaaTAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAg > 2:1627917/1‑93 (MQ=255) aaaTAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTCAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAg < 2:1039290/93‑1 (MQ=255) aaTAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGc > 1:4649169/1‑93 (MQ=255) aaTAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGc < 1:1899164/93‑1 (MQ=255) aTAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCt > 2:3695767/1‑93 (MQ=255) aTAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCACCt > 1:3910505/1‑93 (MQ=255) tAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTa > 1:4051753/1‑93 (MQ=255) tAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTa > 1:2271100/1‑93 (MQ=255) aaGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTAt < 1:1559324/93‑1 (MQ=255) agagTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATg > 2:1209250/1‑93 (MQ=255) agagTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATg < 2:3760060/93‑1 (MQ=255) agagTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATg > 2:3999777/1‑93 (MQ=255) gagTGGGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTGTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGa < 1:1011614/93‑1 (MQ=255) gagTGCGTTGTGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGa < 1:1009233/93‑1 (MQ=255) gagTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGa < 2:1368302/93‑1 (MQ=255) gagTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGa < 1:4015381/93‑1 (MQ=255) agTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAg > 2:3291732/1‑93 (MQ=255) tGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGcc < 2:1359460/93‑1 (MQ=255) tGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGcc > 2:1934474/1‑93 (MQ=255) tGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGcc > 2:1890549/1‑93 (MQ=255) cGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCg > 1:2188002/1‑93 (MQ=255) gTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCgg > 2:4317750/1‑93 (MQ=255) agagTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCtaata > 1:510146/1‑93 (MQ=255) gagTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCtaataa > 2:3566051/1‑93 (MQ=255) gagTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCtaataa > 1:3409100/1‑93 (MQ=255) gTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAAt > 2:728651/1‑93 (MQ=255) tGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAAtt > 1:298255/1‑93 (MQ=255) tGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCAt > 2:671656/1‑93 (MQ=255) tGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCAt > 1:2591825/1‑93 (MQ=255) gATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATg > 2:2529335/1‑93 (MQ=255) gATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATg > 2:4705903/1‑93 (MQ=255) gATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATg < 1:2424101/93‑1 (MQ=255) gATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATg > 1:2586606/1‑93 (MQ=255) gATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATg > 2:3901316/1‑93 (MQ=255) tGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGtt > 1:2698590/1‑93 (MQ=255) tGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGtt > 1:1272768/1‑93 (MQ=255) tGCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGtt > 2:2621906/1‑93 (MQ=255) gCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTc > 2:4096163/1‑93 (MQ=255) gCTTTTTTAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTc > 2:299853/1‑93 (MQ=255) ttttttAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGc < 2:3463712/93‑1 (MQ=255) ttttttAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGc < 1:4703061/93‑1 (MQ=255) tttttAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGcc < 2:2967119/93‑1 (MQ=255) ttAAACGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCggg < 1:1634923/93‑1 (MQ=255) aCGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGt > 1:1449898/1‑93 (MQ=255) cGTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGtt < 1:1182293/93‑1 (MQ=255) gTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtg > 1:4377827/1‑93 (MQ=255) gTTAAGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtg > 1:1445382/1‑93 (MQ=255) aaGCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtgatg < 2:2166339/93‑1 (MQ=255) gCATGGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTtgatgat > 2:874468/1‑93 (MQ=255) | CTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGATGATG > NC_000913/301785‑301964 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |