| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,476,636 | G→A | G257D (GGT→GAT) | dsdX → | transport system permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,476,636 | 0 | G | A | 94.3% | 562.5 / 9.7 | 175 | G257D (GGT→GAT) | dsdX | transport system permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/6); new base A (84/81); total (88/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
TCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGC > NC_000913/2476545‑2476724 | aTTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGttt < 1:1396688/93‑1 (MQ=255) aTTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGAttt < 2:2312440/93‑1 (MQ=255) ttAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTg > 1:725336/1‑93 (MQ=255) tAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGt > 1:3218508/1‑93 (MQ=255) aGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGta > 1:4462352/1‑93 (MQ=255) gcgcAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGtata > 1:3962470/1‑93 (MQ=255) gcgcAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGtata < 2:403764/93‑1 (MQ=255) gcAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATc > 2:1778941/1‑93 (MQ=255) gcAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATc > 1:3392458/1‑93 (MQ=255) gcAACGTTATTCACCATACAACTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATc < 1:3932924/93‑1 (MQ=255) cAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCt < 1:3364448/93‑1 (MQ=255) cAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCt < 2:2207855/93‑1 (MQ=255) aaCGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCtt > 1:1536105/1‑93 (MQ=255) aaCGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCtt > 2:1917020/1‑93 (MQ=255) aaCGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCtt < 1:2363115/93‑1 (MQ=255) cGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTgg > 1:1823686/1‑93 (MQ=255) cGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTCCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTgg < 2:4739413/93‑1 (MQ=255) gTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGt > 2:3956594/1‑93 (MQ=255) gTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGt > 1:1627081/1‑93 (MQ=255) gTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGt > 2:1259772/1‑93 (MQ=255) ttATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGtt > 1:4725072/1‑93 (MQ=255) ttATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGtt > 1:2645814/1‑93 (MQ=255) ttATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGtt > 2:3543462/1‑93 (MQ=255) ttATTCACCATACTGCTACCAATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGtt > 1:1245204/1‑93 (MQ=255) gtATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGtt < 2:3809543/92‑1 (MQ=255) aTTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGCTTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTgg > 1:2953730/1‑92 (MQ=255) aTTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTgg > 2:3637325/1‑92 (MQ=255) aTTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGa > 1:3491206/1‑93 (MQ=255) cACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTTGTTGAGtt < 2:2130699/93‑1 (MQ=255) cACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGtt > 2:59993/1‑93 (MQ=255) ccATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTa < 1:4240450/93‑1 (MQ=255) cATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTTGTTGAGTTTAt > 2:1404209/1‑93 (MQ=255) cATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTAt < 1:368726/93‑1 (MQ=255) cATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTAt < 1:1495639/93‑1 (MQ=255) cATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTAt < 2:2759668/93‑1 (MQ=255) aTACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTAtt > 1:3995653/1‑93 (MQ=255) cTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGc > 1:3104712/1‑93 (MQ=255) cTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGc < 1:537070/93‑1 (MQ=255) tGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCa > 1:2487811/1‑93 (MQ=255) cTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAAc > 1:806891/1‑93 (MQ=255) cTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAAc < 2:2858149/93‑1 (MQ=255) tACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAAcc < 2:105766/93‑1 (MQ=255) cccATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTTCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCt < 1:2742877/93‑1 (MQ=255) ccATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTa > 1:1927405/1‑93 (MQ=255) ccATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTa < 1:1335619/93‑1 (MQ=255) cagtGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTAt < 1:454822/90‑1 (MQ=255) cATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTAt > 1:1991082/1‑93 (MQ=255) cATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTAt < 2:4293137/93‑1 (MQ=255) aTTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATc > 2:2363211/1‑93 (MQ=255) aTTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATc < 2:3405270/93‑1 (MQ=255) aTTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATc < 2:432095/93‑1 (MQ=255) aTTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATc > 1:2926869/1‑93 (MQ=255) ttGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCa > 1:2113726/1‑93 (MQ=255) tGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCAc > 2:2540677/1‑93 (MQ=255) gcTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGc < 2:3996825/93‑1 (MQ=255) cTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGcc < 2:272375/93‑1 (MQ=255) tGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCa < 1:3834930/93‑1 (MQ=255) gATGTTGTTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGCGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTACTACTGCCAt > 2:2461395/1‑93 (MQ=255) aTGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATg < 1:2435754/93‑1 (MQ=255) gTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGtt > 1:109579/1‑93 (MQ=255) gTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGtt < 2:3262781/93‑1 (MQ=255) gTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGtt < 1:1354093/93‑1 (MQ=255) ttGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGttt > 2:1546115/1‑93 (MQ=255) ggTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTAt < 2:945670/93‑1 (MQ=255) ggTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTAt > 2:4632197/1‑93 (MQ=255) gTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATc < 2:2426323/93‑1 (MQ=255) gTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATc < 2:4460177/93‑1 (MQ=255) tAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGc < 1:1629229/93‑1 (MQ=255) aaaaCGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGcc > 2:311632/1‑93 (MQ=255) aaaCGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCg > 1:1038837/1‑93 (MQ=255) cGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCACCCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCgtgt < 1:2791194/93‑1 (MQ=255) gATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGtt < 2:223937/93‑1 (MQ=255) gATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGtt < 2:694540/93‑1 (MQ=255) gATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGtt < 1:215370/93‑1 (MQ=255) gATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGtt < 1:273535/93‑1 (MQ=255) tGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGt > 2:3423823/1‑93 (MQ=255) cGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGAGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGc > 1:3899672/1‑93 (MQ=255) gAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGcc > 1:447656/1‑93 (MQ=255) gAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGcc < 2:2544869/93‑1 (MQ=255) aaTTGAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCt < 1:1713004/93‑1 (MQ=255) gAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCtatta > 2:1676074/1‑93 (MQ=255) gAATATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCtatta > 1:3770360/1‑93 (MQ=255) aaTATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCtattat < 1:3127434/93‑1 (MQ=255) aaTATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCtattat > 2:1187305/1‑93 (MQ=255) aaTATGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCtattat > 1:4193953/1‑93 (MQ=255) atatGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTAtg < 1:4316136/93‑1 (MQ=255) tatGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGCTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTCCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTAtgt < 1:778922/93‑1 (MQ=255) tGGCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATgtgt < 2:4706371/93‑1 (MQ=255) ggCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGtt < 2:1695950/93‑1 (MQ=255) ggCGCGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGtt > 2:2080513/1‑93 (MQ=255) ggCGCGTGAGAGCGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGtt > 1:3202762/1‑93 (MQ=255) gcgcGTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTg < 2:1287973/93‑1 (MQ=255) cgcgTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTgg < 1:365421/93‑1 (MQ=255) cgTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGt < 1:4115092/93‑1 (MQ=255) gTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGta < 2:4193279/93‑1 (MQ=255) gTGAGAGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGta > 1:3735636/1‑93 (MQ=255) gagaGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGtata < 2:2351669/93‑1 (MQ=255) gagaGTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGtata > 2:3117401/1‑93 (MQ=255) agagTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATAc < 2:4160214/93‑1 (MQ=255) agagTGATTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATAc > 1:2056593/1‑93 (MQ=255) | TCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGC > NC_000913/2476545‑2476724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |